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遺傳學(xué)的研究對(duì)象精選(九篇)

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遺傳學(xué)的研究對(duì)象

第1篇:遺傳學(xué)的研究對(duì)象范文

進(jìn)入21世紀(jì)后,遺傳學(xué)知識(shí)得到了一定程度的普及。如果父母均為健康人,而(外)祖父母與孫輩有同樣的疾病,人們也認(rèn)為這是一種“遺傳”。實(shí)際上,一個(gè)家族中,兩系(指父系、母系)三代內(nèi)只要有兩位成員患同一種病,人們都能聯(lián)想到“遺傳”??梢?,人們心中“遺傳”的概念已在不斷擴(kuò)展。

許多傳統(tǒng)的遺傳病可以遺傳,這已勿庸置疑,比如先天性智能發(fā)育不全、家族性偏頭痛等。但是,隨著醫(yī)學(xué)的發(fā)展,人們概念中的“非遺傳病”也加入了遺傳的行列。醫(yī)學(xué)家在很多“非遺傳病”中發(fā)現(xiàn)了致病基因,如糖尿病基因、白血病基因、精神分裂癥基因、肥胖基因等,大大突破了人們的傳統(tǒng)觀念。再發(fā)展下去,會(huì)不會(huì)發(fā)現(xiàn)長壽基因、智能基因、幸?;?、感冒基因、成癮基因呢?甚至最終發(fā)現(xiàn)所有疾病均與基因,也就是遺傳有關(guān)?

其實(shí),當(dāng)代遺傳學(xué)中許多超乎常人想象的突破性發(fā)現(xiàn),正是源于遺傳學(xué)家持有“所有疾病都可能與遺傳有關(guān)”的觀念!比如,在鴉片濫用、酒精依賴、海洛因成癮、老年性癡呆、神經(jīng)性厭食、失眠癥和人格障礙等中都找到了相應(yīng)的致病基因。人們不禁要問:這種觀念會(huì)不會(huì)太極端、太離譜呢?對(duì)此,醫(yī)學(xué)家們肯定地說:這是科學(xué)的!

實(shí)際上,所有的疾病都是由內(nèi)部的遺傳因素和外部的環(huán)境因素結(jié)合所致,只是兩種因素在不同疾病中所占的分量各不相同。如果遺傳因素占主導(dǎo)地位(遺傳相關(guān)性大于60%),這種疾病就是人們常見的遺傳病;如果遺傳因素不占主導(dǎo)地位,人們很難聯(lián)想到遺傳,但在遺傳學(xué)家的眼中,它們還是與“遺傳”有關(guān),即使其遺傳相關(guān)性不到1%,這種認(rèn)識(shí)上的差異是遺傳學(xué)的發(fā)展所致。

遺傳學(xué)一般可分為傳統(tǒng)的群體遺傳學(xué)和現(xiàn)代的分子遺傳學(xué),前者以病癥為研究對(duì)象,其“遺傳”概念通常指病癥遺傳。如果某種癥狀具有以下三個(gè)特點(diǎn),就可認(rèn)為有遺傳傾向:①該癥狀具有家族聚集現(xiàn)象,即在同一家族成員中發(fā)生率比普通人群發(fā)生率高;②該癥狀發(fā)生率在單卵雙生子中比雙卵雙生子中高;③高發(fā)家系中的子女,即使從小寄養(yǎng)在正常家庭中,該癥狀的發(fā)生率仍比普通人群高。分子遺傳學(xué)則以基因?yàn)檠芯繉?duì)象,其“遺傳”概念是指基因遺傳,認(rèn)為所有的遺傳是通過基因傳遞來進(jìn)行的。分子生物學(xué)的研究目的主要是尋找與疾病相關(guān)的致病基因,而研究的前提假設(shè)就是“所有疾病都可能與遺傳有關(guān)”。由于許多疾病的癥狀并非與生俱來,但其致病基因則在出生時(shí)就已攜帶,所以,分子遺傳學(xué)的觀點(diǎn)比傳統(tǒng)的群體遺傳學(xué)更精確、客觀和科學(xué)。比如,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了老年性癡呆的致病基因,但病人的癥狀直到老年才出現(xiàn),有的人甚至在癥狀還未出現(xiàn)時(shí)就過世了,可見依癥狀判斷疾病是否有遺傳傾向,總體上就會(huì)縮小發(fā)現(xiàn)疾病遺傳性的可能性。許多人身上攜帶致病基因,但不一定出現(xiàn)病癥,因?yàn)檫@還受到環(huán)境因素的影響。有些在祖輩中從未出現(xiàn)過的病癥,在子孫中出現(xiàn),也被稱為遺傳病,因?yàn)槠渲虏』蚴沁z傳的。

第2篇:遺傳學(xué)的研究對(duì)象范文

關(guān)鍵詞:遺傳學(xué);教學(xué)改革;課程群;

隨著現(xiàn)代生物科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,遺傳學(xué)已成為21世紀(jì)生命科學(xué)領(lǐng)域發(fā)展最為迅速的學(xué)科之一,是生命科學(xué)中各門學(xué)科的核心,它的分支幾乎擴(kuò)展到生命科學(xué)的各個(gè)研究領(lǐng)域.目前,在生物學(xué)各專業(yè)的教學(xué)中,普遍存在著知識(shí)老化,課程體系陳舊,如遺傳學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)、生物化學(xué)、基因工程、基因組學(xué)、分子遺傳學(xué)等課程之間存在著部分內(nèi)容重復(fù)等一系列問題.顯然,當(dāng)前的課程體系已不適應(yīng)高等學(xué)校生命科學(xué)教育的要求.如何突出遺傳學(xué)主干課程,實(shí)現(xiàn)課程體系的整合、優(yōu)化,不同課程間知識(shí)的融通和銜接,以此組建口徑寬、方向靈活的課程群,加強(qiáng)學(xué)生創(chuàng)新意識(shí)和創(chuàng)新能力的培養(yǎng),以增強(qiáng)學(xué)生的適應(yīng)性和競(jìng)爭力,培養(yǎng)學(xué)生的個(gè)性特長、能力特長以及繼續(xù)學(xué)習(xí)的能力,形成終身學(xué)習(xí)的觀念,是擺在我們面前值得思考的問題.我們從遺傳學(xué)課程入手,對(duì)遺傳學(xué)課程群進(jìn)行了初步的思考,重新設(shè)置和實(shí)踐,目的是實(shí)現(xiàn)課程體系的整合、優(yōu)化,培養(yǎng)符合現(xiàn)代社會(huì)要求的創(chuàng)新型、復(fù)合型人才.

1遺傳學(xué)課程群內(nèi)課程設(shè)置的基本思路

遺傳學(xué)課程群內(nèi)課程設(shè)置的基本思路就是圍繞“一個(gè)中心,三個(gè)方向”的原則,以普通遺傳學(xué)為核心課程,兼顧三個(gè)方面的內(nèi)容.基本框架如圖1.

“一個(gè)中心”就是以普通遺傳學(xué)為核心課程.遺傳學(xué)是一門生命科學(xué)所有專業(yè)的重要基礎(chǔ)課,要求全面系統(tǒng)地介紹遺傳學(xué)的基本原理、分析方法及現(xiàn)代遺傳學(xué)發(fā)展的最新成就.在教學(xué)中,要始終貫穿遺傳物質(zhì)的本質(zhì)、遺傳物質(zhì)的傳遞和變異、遺傳信息的表達(dá)與調(diào)控這一主線,使學(xué)生在群體水平、個(gè)體水平、細(xì)胞水平和分子水平的不同層次上對(duì)遺傳學(xué)有比較全面、系統(tǒng)的認(rèn)識(shí),并能應(yīng)用其基本原理分析遺傳學(xué)數(shù)據(jù),解釋遺傳學(xué)現(xiàn)象,并對(duì)遺傳學(xué)各分支學(xué)科有一個(gè)基本的了解.

“三個(gè)方向”是以遺傳學(xué)分支學(xué)科、反映現(xiàn)代遺傳學(xué)發(fā)展的學(xué)科及遺傳學(xué)普及性學(xué)科為遺傳學(xué)內(nèi)容細(xì)化、深化和普及的三個(gè)層面,主要包括以下內(nèi)容:

一是遺傳學(xué)分支學(xué)科的內(nèi)容,主要包括《群體遺傳學(xué)》、《微生物遺傳學(xué)》、《細(xì)胞遺傳學(xué)》等課程,以專業(yè)選修課的形式開出,主要目的是根據(jù)學(xué)生的興趣和愛好,深入學(xué)習(xí)遺傳學(xué)各個(gè)分支學(xué)科的知識(shí).如《群體遺傳學(xué)》是研究在自然選擇、基因漂變、突變以及遷移四種進(jìn)化動(dòng)力的影響下,等位基因的分布和改變.它是在群體水平上研究種群的分類、空間結(jié)構(gòu)等,并試圖解釋諸如適應(yīng)和物種形成現(xiàn)象的理論.《微生物遺傳學(xué)》是以病毒、細(xì)菌、小型真菌以及單細(xì)胞動(dòng)植物等為研究對(duì)象的遺傳學(xué)分支學(xué)科.《細(xì)胞遺傳學(xué)》是遺傳學(xué)與細(xì)胞學(xué)相結(jié)合的一個(gè)遺傳學(xué)分支學(xué)科,主要是在細(xì)胞和染色體水平上研究.

二是反映現(xiàn)代遺傳學(xué)發(fā)展的學(xué)科,如《基因工程》、《分子遺傳學(xué)》、《基因組學(xué)》.這三門課程都是在普通遺傳學(xué)基礎(chǔ)上開設(shè)的專業(yè)選修課程,目的是與現(xiàn)代遺傳學(xué)的發(fā)展接軌.如《分子遺傳學(xué)》(moleculargenetics)的主要內(nèi)容為基因的結(jié)構(gòu)、復(fù)制和轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控、翻譯,基因突變,DNA的復(fù)制、修復(fù),原核與真核生物的基因表達(dá)調(diào)控,是在分子水平上進(jìn)行的研究.此課程為生命科學(xué)各專業(yè)本科生的學(xué)科基礎(chǔ)課,也可作為研究生的專業(yè)選修課.《基因工程》(geneengineering)主要介紹基因操作的主要技術(shù)原理,基因操作的工具酶,克隆載體,目的基因的分離方法,重組體的構(gòu)建及導(dǎo)入,克隆基因的表達(dá)與檢測(cè),基因工程研究進(jìn)展,存在問題及新策略等內(nèi)容,使學(xué)生具備基因工程方面的基本知識(shí)和掌握其操作技術(shù).《基因組學(xué)》(genomics)是對(duì)所有基因進(jìn)行基因組作圖,核苷酸序列分析,基因定位和基因功能分析的一門科學(xué).主要講述生物基因組的基本結(jié)構(gòu)和組成、基因組內(nèi)基因的表達(dá)和調(diào)控、遺傳圖譜與物理圖譜、基因組測(cè)序、基因組序列解讀、染色體的結(jié)構(gòu)與基因表達(dá)調(diào)控、基因組的復(fù)制、基因組進(jìn)化的分子基礎(chǔ)、基因組進(jìn)化的模式、分子系統(tǒng)發(fā)生學(xué)等內(nèi)容,并講述人類基因組計(jì)劃的全過程以及由此引發(fā)的道德倫理和法律問題,系統(tǒng)向?qū)W生講授基因組學(xué)研究的基本內(nèi)容及相關(guān)進(jìn)展.通過該課程學(xué)習(xí),使學(xué)生了解結(jié)構(gòu)基因組學(xué)和功能基因組學(xué)的重要研究領(lǐng)域、熱點(diǎn)問題與發(fā)展趨勢(shì),以及國內(nèi)外研究現(xiàn)狀與進(jìn)展.

三是遺傳學(xué)普及性的內(nèi)容,此類課程為遺傳學(xué)的平行課程,以公選課的形式開出,主要目的是普及遺傳學(xué)知識(shí),提高人口質(zhì)量和全民素質(zhì).我們針對(duì)非生物專業(yè)的學(xué)生開設(shè)了《人類遺傳學(xué)》和《遺傳與優(yōu)生》兩門課程.《人類遺傳學(xué)》主要講述人類在形態(tài)、結(jié)構(gòu)、生理、生化、免疫、行為等各種性狀的遺傳上的相似和差別,人類群體的遺傳規(guī)律以及人類遺傳性疾病的發(fā)生機(jī)理、傳遞規(guī)律和如何預(yù)防等內(nèi)容,使學(xué)生掌握人類遺傳學(xué)的基本概念和主要研究方法.《遺傳與優(yōu)生》主要講述什么是遺傳病,遺傳病對(duì)人類的危害,人類的染色體和染色體病、基因和基因病、腫瘤與遺傳、人類代謝和發(fā)育中的遺傳學(xué)問題、優(yōu)生學(xué)的基本概念、影響優(yōu)生的因素,優(yōu)生的措施等.這兩門課程都注重貼近生活,貼近社會(huì),從剖析青年學(xué)生關(guān)注的問題入手去介紹人類遺傳與優(yōu)生的基礎(chǔ)理論和基本知識(shí),使學(xué)生能夠在輕松、順暢且饒有興趣的學(xué)習(xí)過程中獲益.對(duì)于醫(yī)療保健事業(yè)和人群遺傳素質(zhì)的改進(jìn)具有重要意義.

2遺傳學(xué)課程群內(nèi)課程內(nèi)容整合的思路

為解決遺傳學(xué)的迅速發(fā)展及新知識(shí)、新技術(shù)不斷出現(xiàn)與遺傳學(xué)教學(xué)時(shí)數(shù)減少這一矛盾,我們通過建立遺傳學(xué)課程群體系,協(xié)調(diào)課程群內(nèi)各門課程的關(guān)系,盡量減少重復(fù)內(nèi)容,對(duì)于學(xué)習(xí)遺傳學(xué)的有關(guān)基礎(chǔ)知識(shí),如核酸的結(jié)構(gòu)和特征在先修課程《生物化學(xué)》中介紹,染色體的結(jié)構(gòu),細(xì)胞周期等在細(xì)胞生物學(xué)課程中介紹,概率和統(tǒng)計(jì)學(xué)知識(shí)在生物統(tǒng)計(jì)學(xué)課程中介紹.而對(duì)于遺傳學(xué)各分支學(xué)科的深入討論,將在細(xì)胞遺傳學(xué)、群體及數(shù)量遺傳學(xué)、分子遺傳學(xué)、基因組學(xué)、基因工程、生物信息學(xué)等課程中介紹.

3遺傳學(xué)課程群內(nèi)實(shí)驗(yàn)課程整合的思路

遺傳學(xué)課程群內(nèi)主要設(shè)置了遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)和分子遺傳學(xué)大實(shí)驗(yàn),遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)是為了配合遺傳學(xué)的教學(xué)而開設(shè)的一門實(shí)驗(yàn)課程,其設(shè)計(jì)思想是:1)配合遺傳學(xué)的教學(xué),鞏固和加深對(duì)遺傳學(xué)知識(shí)的理解;2)適應(yīng)現(xiàn)代遺傳學(xué)的發(fā)展,讓學(xué)生掌握現(xiàn)代遺傳學(xué)研究所必需的基本實(shí)驗(yàn)技術(shù);3)開設(shè)綜合性、設(shè)計(jì)性和創(chuàng)新性實(shí)驗(yàn),鼓勵(lì)學(xué)生自己動(dòng)腦筋設(shè)計(jì)、完成實(shí)驗(yàn).目前已形成具有基礎(chǔ)性實(shí)驗(yàn)、提高性實(shí)驗(yàn)和具有綜合性、研究創(chuàng)新性、開放性實(shí)驗(yàn)的不同層次的遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)內(nèi)容體系.鼓勵(lì)學(xué)生自己動(dòng)腦筋設(shè)計(jì)、完成實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)室已對(duì)學(xué)生部分開放,并實(shí)施了自選實(shí)驗(yàn)考試法[1].學(xué)生在此過程中得到了很好的科研訓(xùn)練,部分學(xué)生在本科階段就寫作并發(fā)表了論文,充分體現(xiàn)了遺傳學(xué)課程教學(xué)改革的特色.例如,結(jié)合本科畢業(yè)設(shè)計(jì),我們編制了“遺傳學(xué)試驗(yàn)的計(jì)算機(jī)模擬”軟件[2],增強(qiáng)了學(xué)生對(duì)遺傳學(xué)基本概念和基本原理的理解,而且也增加了學(xué)生對(duì)計(jì)算機(jī)應(yīng)用于生命科學(xué)研究的興趣.我們開發(fā)設(shè)計(jì)了“遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)顯微圖像演示系統(tǒng)”[3],建立了遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)圖像庫,學(xué)生在實(shí)驗(yàn)前可以方便地檢索觀察實(shí)驗(yàn)中可能出現(xiàn)的各種圖像,大大提高了實(shí)驗(yàn)效率.通過遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)的培訓(xùn),學(xué)生具備了一定的設(shè)計(jì)和綜合創(chuàng)新的能力,在此基礎(chǔ)上,進(jìn)入分子遺傳學(xué)大實(shí)驗(yàn)的學(xué)習(xí).而分子遺傳學(xué)大實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)整合了分子遺傳學(xué)和基因工程兩門課程的實(shí)驗(yàn)內(nèi)容,既涵蓋了分子遺傳學(xué)的基本實(shí)驗(yàn)技術(shù),也體現(xiàn)了現(xiàn)代分子遺傳學(xué)發(fā)展的新方法、新技術(shù).實(shí)驗(yàn)通過DNA提取、擴(kuò)增、檢測(cè),到目的基因的獲取、重組、轉(zhuǎn)化、分子雜交等系列性實(shí)驗(yàn),使學(xué)生不僅掌握了現(xiàn)代生物學(xué)分析技術(shù),也培養(yǎng)了學(xué)生的動(dòng)手能力和獨(dú)立設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)的能力,更實(shí)現(xiàn)了理論類課程與實(shí)踐訓(xùn)練類課程的有序銜接,同時(shí)完善了學(xué)生從認(rèn)知實(shí)踐到科研實(shí)踐的創(chuàng)新精神培養(yǎng)體系.

4遺傳學(xué)課程群實(shí)踐基地的建設(shè)

僅有書本上的知識(shí)是不夠的,遺傳學(xué)課程群內(nèi)的課程具有很強(qiáng)的實(shí)踐性,專業(yè)知識(shí)與生產(chǎn)實(shí)際相結(jié)合的綜合性教學(xué)是實(shí)踐教學(xué)環(huán)節(jié)不可缺少的重要一環(huán).為此,我們通過認(rèn)識(shí)實(shí)習(xí)和生產(chǎn)實(shí)習(xí)等手段加強(qiáng)課程知識(shí)的掌握.利用地域優(yōu)勢(shì),與中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院徐州分院、江蘇省藥用植物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、江蘇維維集團(tuán)等建立長期穩(wěn)定的合作關(guān)系.如,我們?cè)谥v解“三系配套”時(shí)就帶領(lǐng)學(xué)生到中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院徐州分院參觀學(xué)習(xí)、實(shí)地學(xué)習(xí)如何進(jìn)行“三系配套”的操作,加深了對(duì)理論知識(shí)的理解.通過專業(yè)實(shí)踐,拓寬了學(xué)生的視野,培養(yǎng)了學(xué)生分析問題、解決問題以及開拓創(chuàng)新的能力,增強(qiáng)了學(xué)生的事業(yè)心和責(zé)任感.

5遺傳學(xué)課程群教學(xué)方法和教學(xué)手段改革之思考

第3篇:遺傳學(xué)的研究對(duì)象范文

【關(guān)鍵詞】分子腫瘤;病理學(xué);新進(jìn)展

795文章編號(hào):1004-7484(2014)-06-3631-01

分子腫瘤病理學(xué)屬于一門新興學(xué)科,其與傳統(tǒng)的腫瘤病理學(xué)以形態(tài)學(xué)為基礎(chǔ)的診斷有著明顯的差異。分子腫瘤病理學(xué)主要是以分子、細(xì)胞為研究對(duì)象,通過科學(xué)、客觀的研究來進(jìn)行診斷。分子腫瘤病理學(xué)主要包括有:分子水平上的分子腫瘤病理學(xué)以及細(xì)胞水平上的臨床細(xì)胞遺傳學(xué)兩大類。近年來,隨著分子腫瘤病理學(xué)的不斷完善與發(fā)展,其已經(jīng)廣泛應(yīng)用于國內(nèi)外對(duì)腫瘤的病理診斷當(dāng)中。

1分子腫瘤病理學(xué)的研究進(jìn)展

1.1分子腫瘤病理學(xué)分子腫瘤病理學(xué)作為腫瘤病理學(xué)和分子生物學(xué)相結(jié)合的產(chǎn)物,其所包含的研究內(nèi)容非常之廣,近年來,隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,分子腫瘤病理學(xué)也得到了有效的完善。分子腫瘤病理學(xué)的研究范圍非常之廣,包括有細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、增殖與凋亡、細(xì)胞生長與分化、細(xì)胞與基質(zhì)相互作用、浸潤與轉(zhuǎn)移、腫瘤血管生成等多個(gè)領(lǐng)域。常見的檢測(cè)手段包括有雜合子缺失檢測(cè)、克隆性分析、定量PCR檢測(cè)等,通過各種檢測(cè)手段,來觀察腫瘤細(xì)胞的印鑒,并于臨床上輔助醫(yī)生對(duì)腫瘤的良惡性進(jìn)行判斷。

1.1.1雜合子缺失檢測(cè)雜合子缺失檢測(cè)主要是對(duì)抑癌基因周圍雜合子的缺失進(jìn)行檢測(cè),以此來反映抑癌基因的缺失,臨床上可通過檢測(cè)雜合子缺失,來準(zhǔn)確、快速地判斷腫瘤細(xì)胞的來源。

1.1.2克隆性分析克隆性分析法在非實(shí)體或?qū)嶓w瘤中均可得到應(yīng)用,其應(yīng)用于淋巴造血系統(tǒng)腫瘤的診斷具有顯著的價(jià)值。

1.1.3定量PCR檢測(cè)在臨床腫瘤的治療中,分子標(biāo)志物可以為醫(yī)生提供準(zhǔn)確的預(yù)后和機(jī)體對(duì)治療的反應(yīng)、耐藥物和毒副作用,而與腫瘤惡性有關(guān)的基因改變具有多樣性,因此為得到腫瘤完整的特征,定量PCR檢測(cè)技術(shù)的應(yīng)用必不可少。通過定量PCR,可以準(zhǔn)確測(cè)定基因的重復(fù)和缺失。

1.2臨床分子細(xì)胞遺傳學(xué)從嚴(yán)格的意義上來講,臨床分子細(xì)胞遺傳學(xué)屬于一門較為久遠(yuǎn)的醫(yī)學(xué)研究,其主要是以細(xì)胞為研究對(duì)象來觀察病變情況的,因此也不能將其完全劃分到分子腫瘤病理學(xué)的研究范圍中。但是,由于臨床細(xì)胞遺傳學(xué)的技術(shù)手段和分子腫瘤病理學(xué)有著相互作用,相輔相成的效果,因此,在實(shí)際的應(yīng)用當(dāng)中多將其囊括到了分子腫瘤病理學(xué)當(dāng)中。

臨床分子細(xì)胞遺傳學(xué)主要是以研究染色體等為主,研究手段包括有染色體組圖分析、熒光原位雜交技術(shù)(FISH)比較基因組原位雜交技術(shù)(CGH)等。①染色體組圖分析主要是研究染色體的亞顯微結(jié)構(gòu)以及基因活動(dòng)的關(guān)系,包括對(duì)染色體數(shù)目改變、平衡改變及不平衡改變的研究。但染色體組圖分析要從新鮮的腫瘤組織中先分離腫瘤細(xì)胞,再進(jìn)行短期培養(yǎng)得到有絲分裂的中期細(xì)胞后才能展開分展,這也導(dǎo)致了其在未得到新鮮組織的情況下,難以開展研究。②熒光原位雜交技術(shù)是指利用熒光染料標(biāo)記探針DNA,變性成為單鏈后與變性后的染色體或細(xì)胞核靶DNA雜交,之后在熒光顯微鏡下進(jìn)行觀察并記錄結(jié)果。此技術(shù)上具有操作簡便,探針標(biāo)記后穩(wěn)定,檢測(cè)結(jié)果快速準(zhǔn)確,可與多種技術(shù)結(jié)合應(yīng)用的特點(diǎn)。從目前的研究進(jìn)展來看,采用此技術(shù)可以檢測(cè)間期細(xì)胞、分裂中期細(xì)胞、死亡或存活細(xì)胞、分化或未分化細(xì)胞等。將FISH應(yīng)用于白血病和實(shí)體瘤中時(shí),其檢測(cè)的特異性和敏感性高達(dá)90%。③采用比較基因原位雜交技術(shù),對(duì)染色體的變化情況可以進(jìn)行全面、詳細(xì)的檢測(cè),此技術(shù)的分辨率也十分高。但是,該技術(shù)到檢測(cè)設(shè)備、檢測(cè)技術(shù)人員的專業(yè)性要求較高,使得其在臨床上還未得到廣泛、成熟的應(yīng)用。

2分子腫瘤病理學(xué)在臨床腫瘤診治中的應(yīng)用價(jià)值

分子腫瘤病理學(xué)在臨床腫瘤診治中具有十分重要的應(yīng)用價(jià)值,其主要體現(xiàn)在如下幾方面:

2.1對(duì)腫瘤診斷的意義臨床在腫瘤的診斷中應(yīng)用分子腫瘤病理學(xué),可以早期發(fā)現(xiàn)患者的腫瘤,并通過及時(shí)、準(zhǔn)確地確診,對(duì)早期積極對(duì)癥治療,提高患者的存活率起著重要的意義。例如,某病患起初因喉部出現(xiàn)腫塊而進(jìn)行了全喉切除手術(shù),術(shù)后進(jìn)行腫瘤病理學(xué)診斷,確診患者屬于中度分化的鱗狀細(xì)胞癌。在后期隨訪中,患者身體恢復(fù)情況良好,但患者在全喉手術(shù)七年后,進(jìn)行檢查時(shí)又發(fā)現(xiàn)右上肺出現(xiàn)單一性腫物,于是又進(jìn)行了肺葉切除手術(shù),術(shù)后病理診斷其屬于中度分化的鱗狀上皮癌。但喉鱗癌與肺鱗癌在鏡下的形態(tài)非常相似,臨床上很難準(zhǔn)確地區(qū)分,且患者后期出現(xiàn)的肺鱗癌是否屬于喉癌的轉(zhuǎn)移灶,采取傳統(tǒng)的手段也無法辨別。基于這種現(xiàn)象,應(yīng)用分子腫瘤病理學(xué),通過雜合缺失檢查結(jié)果(略),可以有效的得知該患者發(fā)生的肺癌,屬于喉癌的轉(zhuǎn)移灶。

2.2對(duì)腫瘤組織學(xué)分類意義常見的腫瘤當(dāng)中,通過對(duì)一些腫瘤所作的較大規(guī)模的病例分析發(fā)現(xiàn),很多腫瘤均在臨床進(jìn)行的組織學(xué)分類,根據(jù)分子腫瘤病理學(xué)科學(xué)、合理地將腫瘤進(jìn)行組織學(xué)分類,進(jìn)而更容易辨別各類腫瘤的特點(diǎn)、浸潤范圍以及淋巴轉(zhuǎn)移率。

2.3對(duì)腫瘤治療的意義在臨床腫瘤治療當(dāng)中,可通過分子腫瘤病理學(xué)分析,指導(dǎo)臨床醫(yī)生進(jìn)行積極、準(zhǔn)確、全面的治療,這對(duì)治療效果有著明顯的促進(jìn)作用。

2.4對(duì)腫瘤預(yù)后的意義通過對(duì)臨床常見腫瘤的分子腫瘤病理學(xué)分析,當(dāng)臨床上對(duì)腫瘤的浸潤深度、組織學(xué)分化、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等指標(biāo)有詳細(xì)的了解時(shí),對(duì)指導(dǎo)預(yù)后,提高患者的生存率也有著十分重要的作用。

3分子腫瘤病理學(xué)的發(fā)展趨勢(shì)

隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,分子腫瘤病理學(xué)也在不斷地完善,例如,人類基因組計(jì)劃的提出與實(shí)踐,當(dāng)基因芯片、SNP芯片等技術(shù)日益成熟時(shí),臨床腫瘤病理學(xué)中應(yīng)用基因芯片、SNP芯片也將是必然的趨勢(shì)。相信在今后的分子腫瘤病理學(xué)的發(fā)展中,分子腫瘤病理學(xué)的深入研究與基因芯片等技術(shù)的應(yīng)用,其對(duì)腫瘤的早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療、指導(dǎo)預(yù)后、提高醫(yī)生專業(yè)性等方面會(huì)起到積極、重要的作用。

綜上所述,今后的分子腫瘤病理學(xué)必將朝著SNP芯片、基因芯片以及有效預(yù)防腫瘤等方向進(jìn)行發(fā)展,使分子腫瘤病理學(xué)對(duì)臨床腫瘤的診治效果起到顯著的促進(jìn)作用。

參考文獻(xiàn)

[1]周庚寅,白艷花,覺道健一.甲狀腺狀癌的病理診斷及遺傳學(xué)特點(diǎn)[J].臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志,2010,2(2):436-437.

第4篇:遺傳學(xué)的研究對(duì)象范文

[關(guān)鍵詞] 華法林;心房顫動(dòng);CYP2C9;VKORC1

[中圖分類號(hào)] R541.7+5 [文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼] B [文章編號(hào)] 1673-9701(2014)32-0151-04

Dose study on atrial fibrillation patients’ warfarin use based on pharmacogenetics

FU Yongping1 ZHANG Ziyan2

1.Department of Cardiology, Affiliated Hospital of Shaoxing University, Shaoxing 312000, China; 2.Department of Hematology, Heze Hospital of Traditional Chinese Medicine in Shandong Province, Heze 274035, China

[Abstract] Objective To compare the strengths of warfarin based on pharmacogenetics or defined by clinical indicators. Methods Either from outpatient or inpatient department, 220 patients who needed anticoagulative treatment by warfarin were recruited. These cases were divided into two groups. Warfarin use method of one group was determined by pharmacogenetics, specifically, CYP2C9 and VKORC1 genotyping were carried out to ascertain and adjust use dosage by Polymerase chain reaction-restriction nuclease fragment length polymorphism(PCR-RFLP). As for the other group, therapeutic regimen was defined by the stable and qualifying time, the frequency of drug adjustment, absolute difference between initial and eventual dose and the proportion of anticoagulant overdose. Additionally, the severity and incidence of hemorrhagic events were closely observed during half year’s following up. Results Compared with traditional warfarin use regimen defined by clinical indicators, the results obtained by pharmacogenetics, including the stable and qualifying time, the frequency of drug adjustment, absolute difference between initial and eventual dose, the proportion of anticoagulant overdose(1.8% compared to 16.4%), and the incidence of severe hemorrhagic events were unanimously better and statistically difference (P

[Key words] Warfarin; Atrial fibrillation; CYP2C9; VKORC1

我國心房顫動(dòng)患者數(shù)接近1000萬,心房顫動(dòng)的主要危害是腦梗死,而腦梗死的致殘率高,使患者生活質(zhì)量嚴(yán)重下降,給患者及其家屬帶來巨大的精神負(fù)擔(dān)和經(jīng)濟(jì)損失??鼓委熌軌驕p少心房顫動(dòng)的栓塞發(fā)生率,但由于醫(yī)患雙方對(duì)其出血副作用的擔(dān)心,使用華法林抗凝人數(shù)很少。雖然有新型抗凝藥物的出現(xiàn),但新型抗凝藥物價(jià)格昂貴,尚無針對(duì)性拮抗劑,在腎功能不全病人使用的局限性以及在瓣膜性心臟病應(yīng)用的局限性,大規(guī)模應(yīng)用新型抗凝藥物并不適合我國國情。相比之下,華法林價(jià)格便宜,每日服藥一次,腎功能不全患者無需調(diào)整劑量,所以華法林在抗凝治療中的地位尚無可替代。為更好地探索我國心房顫動(dòng)患者的華法林使用劑量的個(gè)體化差異,本研究以門診或病房房顫患者為研究對(duì)象,對(duì)CHA2DS2-VASC評(píng)分≥2分以上需要華法林治療的患者進(jìn)行研究。

1對(duì)象與方法

1.1研究對(duì)象

選擇2012年10月~2013年12月心內(nèi)科門診或病房需要使用華法林抗凝的心房顫動(dòng)患者220例。其中男123例,女97例,年齡35~97歲,平均(57.5±12.5)歲。入選標(biāo)準(zhǔn):(1)漢族;(2)≥18歲;(3)心房顫動(dòng)患者;(4)CHA2DS2-VASC評(píng)分≥2;(5)簽知情同意書并能夠配合臨床隨訪觀察。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)嚴(yán)重的肝、腎功能不全或甲狀腺疾??;(2)近期手術(shù)史;(3)急性心肌梗死1個(gè)月內(nèi);(4)活動(dòng)性消化性潰瘍;(5)感染性心內(nèi)膜炎;(6)必須長期服用非甾體類抗炎藥;(7)必須使用試驗(yàn)藥物以外的抗血小板、抗凝藥物及溶栓藥物;(8)惡性腫瘤;(9)處于妊娠期;(10)有血液系統(tǒng)疾病,血小板缺乏癥;(11)不能定期門診復(fù)診條件或治療過程中不能規(guī)律服藥;(12)拒絕隨訪。

1.2方法

由專人收集臨床資料和隨訪登記,與患者簽署書面知情同意書,病例隨機(jī)分為兩組,一組為藥理遺傳學(xué)組(110例):抽取外周靜脈血2 mL,提取基因組DNA,使用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性內(nèi)切核酸酶片段長度的多態(tài)性(PCR-RFLP)給患者進(jìn)行CYP2C9和VKORC1基因型分析,根據(jù)計(jì)算模型(http://)確定的華法林劑量用藥,并進(jìn)行調(diào)整。另一組為臨床指標(biāo)組(110例):根據(jù)臨床指標(biāo)確定的華法林劑量用藥。華法林片由齊魯制藥有限公司生產(chǎn),批準(zhǔn)文號(hào):國藥準(zhǔn)字:H37021314,每片2.5 mg。兩組患者在性別、年齡、合并疾病病史及合并用藥等一般資料方面差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,具有可比性,見表1。

1.3 CYP2C9和VKORC1基因型分析材料與方法

1.3.1 試劑 基因組DNA抽提試劑盒、Taq DNA聚合酶、10×PCR緩沖液、10 mmol/L dNTPs、25 mmol/L氯化鎂、DNA 標(biāo)記物(采購自加拿大Bio Basic Inc.);引物由上海生工生物工程有限公司合成提供;限制性內(nèi)切酶AvaⅡ、Nsi I、Msp I及瓊脂糖(均購自美國Promega)。

1.3.2 儀器 HH-W21.420型電熱恒溫水箱(天津泰斯特儀器有限公司);DYY-6C型穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀(北京六一儀器廠);多功能暗箱式紫外線分析裝置(北京賽百奧公司);FerroTec基因擴(kuò)增儀(杭州大和公司);LX-100手掌型離心機(jī)(江蘇海門)。

1.3.3 基因組DNA提取及PCR擴(kuò)增 取外周抗凝血液2 mL,使用基因組DNA抽提試劑盒提取基因組DNA,-20℃保存。PCR反應(yīng)的引物設(shè)計(jì)參考有關(guān)文獻(xiàn)[1-3],VKORC1基因檢測(cè)的正向引物為5’-GCCAGCA-GGAGAGGGAAATA-3’,反向引物為5’-AGTTTGGACTACAGGTGCCT-3’;CYP2C9 *3基因檢測(cè)的正向引物為5’-AATAATAATATGCACGAGGTCCAGAGATGC-3’,反向引物為5’-GATACTATGAATTTGG-GACTTC-3’;CYP2C9 *2基因檢測(cè)的正向引物為5’TACAAATACAATGAAAATATCATG-3’,反向引物為5’-CTAACAACCAGACTCATAATG-3’。PCR反應(yīng)體系包括基因組DNA 0.2 μg,2.5 mmol/L,dNTPs 4 mL,10×PCR緩沖液5 μL,25 mmol/L的MgCl2 4 μL,10 μmol/L的引物各3 mL,5 u/L Taq聚合酶0.5 μL,加超純水至50 μL。CYP2C9*2反應(yīng)條件為:先94℃預(yù)變性5 min,然后94℃處理45 s,再50℃處理45 s,最后72℃處理1 min,共35個(gè)循環(huán),接下來72℃延伸5 min;CYP2C9*3的反應(yīng)條件為:先94℃ 預(yù)變性5 min,然后94℃處理45 s,再56℃處理45 s,最后72℃處理30 s,共35個(gè)循環(huán),接下來72℃延伸5 min;VKORC1-1639G>A的反應(yīng)條件為:先94℃ 預(yù)變性5 min,然后94℃處理45 s,再59℃處理30 s,之后72℃處理30 s,共35個(gè)循環(huán),最后72℃延伸5 min。

1.3.4 限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性(RFLP)分析 取用VKORCl、 CYP2C9 *2、CYP2C9 *3PCR產(chǎn)物各10 μL,然后分別加入限制性內(nèi)切酶AvaⅡ、Msp I、 Nsi I各0.5 μL以及牛血清白蛋白0.2 μL和緩沖液2 μL,再加入超純水至20 μL,37℃水浴4 h。酶切產(chǎn)物在2.5%瓊脂糖凝膠電泳,最后紫外燈下觀察條帶。

1.4 觀察指標(biāo)

觀察兩組患者達(dá)標(biāo)穩(wěn)定時(shí)間(從給予首劑華法林開始到INR值在達(dá)到治療范圍(2~3)且INR值穩(wěn)定所需要的時(shí)間)、藥物調(diào)整的次數(shù)、終點(diǎn)劑量與初始劑量的絕對(duì)差值、抗凝過量的比例(INR初次超過4的比例),并觀察隨訪過程中出血事件的嚴(yán)重程度和發(fā)生率。隨訪時(shí)間約半年。

1.5統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

應(yīng)用SPSS 15.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件,對(duì)所有計(jì)量資料均先進(jìn)行單樣本正態(tài)分布檢驗(yàn),正態(tài)分布或近似正態(tài)分布資料的組間比較采用t檢驗(yàn)。計(jì)量資料數(shù)據(jù)采用(x±s)表示。計(jì)數(shù)資料的組間比較采用χ2檢驗(yàn),P

2 結(jié)果

2.1 CYP2C9和VKORC1基因型分析

藥理遺傳學(xué)的方法組共對(duì)110例患者采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性內(nèi)切核酸酶片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)進(jìn)行CYP2C9和VKORC1基因型分析,CYP2C9基因具有高度多態(tài)性,在基因編碼區(qū)和非編碼存在許多單堿基突變,最主要的有3種: CYP2C9*1、CYP2C9*2和CYP2C9*3, CYP2C9:*1型102例占92.7%;CYP2C9:*2型0例占0%;CYP2C9:*3型8例占7.3%。VKORC1發(fā)現(xiàn)有AA、AG、GG三種基因型,VKORC1:AA型81例占73.6%;VKORC1:AG型26例占23.7%;VKORC1:GG型3例占2.7%.

2.2 兩組臨床觀察指標(biāo)的差異

患者隨訪時(shí)間半年,半年后對(duì)兩組患者在達(dá)標(biāo)穩(wěn)定時(shí)間、藥物調(diào)整的次數(shù)、終點(diǎn)劑量與初始劑量的絕對(duì)差值、抗凝過量的比例、嚴(yán)重出血發(fā)生率進(jìn)行觀察和比較,藥理遺傳學(xué)的方法與臨床指標(biāo)組相比,各項(xiàng)指標(biāo)均具有優(yōu)勢(shì),具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P

表2 兩組臨床觀察指標(biāo)的差異(x±s)

注:藥理遺傳學(xué)組與臨床指標(biāo)組相比,各觀察指標(biāo)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P

2.3 CYP2C9和VKORC1基因型分析結(jié)果

對(duì)所有抗凝過量和嚴(yán)重出血患者都進(jìn)行CYP2C9和VKORC1基因型分析。出現(xiàn)抗凝過量共20例:基因類型為CYP2C9*1,VKORC1:AA共10例,有4例出現(xiàn)嚴(yán)重出血,基因類型為CYP2C9*3、VKORC1:AA共6例,有3例出現(xiàn)嚴(yán)重出血;基因類型為CYP2C9*1、VKORC1:AG共1例,基因類型為CYP2C9*3、VKORC1:AG共2例,基因類型為CYP2C9*3;VKORC1:GG共1例。10例嚴(yán)重出血患者的VKORC1基因型均是AA。

3 討論

華法林在抗凝治療中的地位尚無可替代。但華法林治療窗很窄,而且用藥的個(gè)體性差異和種族差異也很大,要達(dá)到相同作用效果,最大劑量與最小劑量相差可以達(dá)到10倍以上。目前發(fā)現(xiàn)影響華法林藥效學(xué)的基因主要有2個(gè),細(xì)胞色素氧化酶P450 2C9(cytochrome P-450 2C9,CYP2C9)和維生素K環(huán)氧化物還原酶復(fù)合體1(VKORC1)。華法林全部由肝臟代謝,CYP2C9是人類肝臟中一種重要藥物代謝酶系統(tǒng),是華法林代謝最關(guān)鍵的酶,CYP2C9基因具有高度多態(tài)性,在基因編碼區(qū)和非編碼存在許多單堿基突變,其中研究最多也是最主要的有3種,即野生型CYP2C9*1、突變體CYP2C9*2和突變體CYP2C9*3,這幾個(gè)等位基因的多態(tài)性可以影響華法林藥效,導(dǎo)致個(gè)體對(duì)華法林的敏感性不同以及華法林在抗凝治療過程中出血的危險(xiǎn)性,對(duì)華法林的使用劑量密切相關(guān)的兩個(gè)等位基因分別為CYP2C9*2和CYP2C9*3。基因型CYP2C9*2和CYP2C9*3的患者所需的華法林治療劑量小[4,5]。VKORC1是人體內(nèi)維生素K依賴性凝血因子生成的限速酶和關(guān)鍵酶,華法林通過競(jìng)爭性抑制此酶的作用而達(dá)到抗凝效果。VKORC1發(fā)現(xiàn)有AA、AG、GG三種基因型,AA基因型為華法林劑量敏感型,所需的華法林治療劑量小。AG、GG兩種基因型為華法林劑量抵抗型,所需的華法林治療劑量大[4,5]。納入藥理遺傳學(xué)的方法組的患者CYP2C9和VKORC1基因型見2.1。本研究中發(fā)現(xiàn):CYP2C9基因型分布CYP2C9*1占92.7%,CYP2C9*2占0%,CYP2C9*3占7.3%。CYP2C9基因型分布以CYP2C9*1為主,與西方人相似[6-10],可見CYP2C9基因型分布無明顯種族差異。本研究中:VKORC1基因型分布AA占73.6%,AG占23.7%,GG占2.7%。與文獻(xiàn)報(bào)道我國漢族人VKORC1基因型以AA型為主,GG、GA型少見相符[6-9],而西方人以GG、GA型為主,AA型少見,提示VKORC1基因型存在人種差異[6-9]。已知CYP2C9*1、VKORC1-AA型基因的患者,所需華法林劑量減少,這可部分解釋我國漢族人所需華法林劑量低于西方人群的原因。

本研究通過對(duì)兩組間臨床觀察指標(biāo)(表2)的比較,藥理遺傳學(xué)的方法組與臨床指標(biāo)組比較,穩(wěn)定達(dá)標(biāo)時(shí)間更短,藥物調(diào)整的次數(shù)更少,終點(diǎn)劑量與初始劑量的絕對(duì)差值更小,抗凝過量的比例更低,嚴(yán)重出血事件發(fā)生率更低。藥理遺傳學(xué)的方法組各項(xiàng)指標(biāo)均具有優(yōu)勢(shì),具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P

本研究中觀察對(duì)象共發(fā)生抗凝過量例數(shù)20例,抗凝過量患者中基因型表現(xiàn)以CYP2C9*3或VKORC1:AA為多見,抗凝過量患者平均年齡(72.4±9.4)歲,也較大。觀察對(duì)象共發(fā)生9例嚴(yán)重出血,其中嚴(yán)重出血病人中7例抗凝過量,另外2例并未出現(xiàn)抗凝過量,但年齡較大,提示抗凝過量和年齡是出血的重要因素[4,11-14]。嚴(yán)重出血患者的VKORC1基因型均是AA,VKORC1基因型表現(xiàn)為AG、GG的嚴(yán)重出血病例沒有觀察到。CYP2C9*3且VKORC1:AA的患者嚴(yán)重出血發(fā)生率較高,應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注此類患者。嚴(yán)重出血患者平均年齡為71.5歲,高于本研究觀察對(duì)象的平均年齡。藥理遺傳學(xué)的方法能夠及早發(fā)現(xiàn)這些出血高?;颊撸苊鈬?yán)重出血的發(fā)生。這也是藥理遺傳學(xué)的方法指導(dǎo)華法林使用劑量組嚴(yán)重出血發(fā)生率低的主要原因。

基于藥理遺傳學(xué)的方法指導(dǎo)華法林使用劑量比根據(jù)臨床指標(biāo)確定的華法林劑量用藥方法使用劑量推薦劑量更加精確,劑量調(diào)整小而少,能更快到達(dá)INR治療范圍,而且嚴(yán)重出血發(fā)生率低,對(duì)患者更安全,值得推廣應(yīng)用。

[參考文獻(xiàn)]

[1] 趙磊,賈玫. CYP2C9 1075 A>C和VKORC1-1639 G>A基因多態(tài)性與華法林用藥劑量差異的相關(guān)性及檢測(cè)方法研究[J]. 中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2012,35(11):1010-1015.

[2] YASAR U,ELIASSON E,DAHL M L,et al. Validation of methods for CYP2C9 genotyping:frequencies of mutant alleles in a Swedish population[J]. Biochem Biophys Res Commun,1999,254(3):628-631.

[3] SC0NCE E A,KHAN T I,WYNNE H A,et al. The impact of CYP2C9 and VKORC1 genetic polymorphism and patient characteristics upon warfarin dose requirements:Proposal for a new dosing regimen[J]. Blood,2005,106(7):2329-2333.

[4] Home BD,Lenzini PA,Wadelius M,et al. Phannaeogenetie warfarin dose refinements remain significantly influenced by genetic factors after one week of therapy[J]. Thromb Haemost,2012,107:232-240.

[5] Obayashi K,Aomori T,F(xiàn)ujita Y,et al. Influence of CYC2C9 and vitamin K oxide reductase complex(VK0RC)1 polymorphisms on time to determine the warfarin maintenance dose[J]. Pharmazie,2011,66(3):222-225.

[6] dbSNP Short Genetic Variations. [2012-10-12]. http://ncbi.nlm.nih.gov.

[7] Maurice CB,Barua PK,Simses D,et al. Comparison of assay systems for warfarin-related CYP2C9 and VKORC1 genotyping[J]. Clin Chim Acta,2010,411(13-14):947-954.

[8] Choi JR,Kim JO,Kang DR,et al. Proposal of pharmacogenetics-based warfarin dosing algorithm in Korean patients[J]. J Hum Genet,2011,56:290-295.

[9] Zeng WT,Zheng QS,Huang M,et al. Genetic polymorphisms of VKORC1,CYP2C9,CYP4F2 in Bai ibetan Chinese[J]. Pharmazie,2012,67(1):69-73.

[10] Limdi NA,Wadelius M,Cavallari L,et al. International warfarin pharmacogenetics consortium. warfarin pharmacogenetics:A single VKORC1 polymorphism is predictive of dose across 3 racial groups[J]. Blood,2010,115(18):3827-3834.

[11] 何水波,郁水華,孟銳,等. 華法林預(yù)防老年非瓣膜性心房顫動(dòng)患者缺血性腦卒中及出血風(fēng)險(xiǎn)的臨床對(duì)照研究[J]. 中國心血管雜志,2013,18(4):268-271.

[12] 李小鷹. 老年心房顫動(dòng)患者應(yīng)用華法林的出血風(fēng)險(xiǎn)、影響因素與預(yù)防[J]. 中華心血管病雜志,2011,39:285-288.

[13] Zineh I,Pacanowski M,Woodcock J,et al. Pharmacogenetics and coumarin dosing-recalibrating expectations[J].N Engl J Med,2013,369(24):2273-2275.

第5篇:遺傳學(xué)的研究對(duì)象范文

【關(guān)鍵詞】: 植物分子;群體;遺傳學(xué);研究

中圖分類號(hào):Q37 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:E文章編號(hào):1006-0510(2008)09091-04

分子群體遺傳學(xué)是在經(jīng)典群體遺傳的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的,它利用大分子主要是DNA序列的變異式樣來研究群體的遺傳結(jié)構(gòu)及引起群體遺傳變化的因素與群體遺傳結(jié)構(gòu)的關(guān)系,從而使得遺傳學(xué)家能夠從數(shù)量上精確地推知群體的進(jìn)化演變,不僅克服了經(jīng)典的群體遺傳學(xué)通常只能研究群體遺傳結(jié)構(gòu)短期變化的局限性,而且可檢驗(yàn)以往關(guān)于長期進(jìn)化或遺傳系統(tǒng)穩(wěn)定性推論的可靠程度。同時(shí),對(duì)群體中分子序列變異式樣的研究也使人們開始重新審視達(dá)爾文的以"自然選擇"為核心的進(jìn)化學(xué)說。到目前為止,分子群體遺傳學(xué)已經(jīng)取得長足的發(fā)展,闡明了許多重要的科學(xué)問題,如一些重要農(nóng)作物的DNA多態(tài)性式樣、連鎖不平衡水平及其影響因素、種群的變遷歷史、基因進(jìn)化的遺傳學(xué)動(dòng)力等,更為重要的是,在分子群體遺傳學(xué)基礎(chǔ)上建立起來的新興的學(xué)科如分子系統(tǒng)地理學(xué)等也得到了迅速的發(fā)展。文中綜述了植物分子群體遺傳研究的內(nèi)容及最新成果。

1. 理論分子群體遺傳學(xué)的發(fā)展簡史

經(jīng)典群體遺傳學(xué)最早起源于英國數(shù)學(xué)家哈迪和德國醫(yī)學(xué)家溫伯格于1908年提出的遺傳平衡定律。以后,英國數(shù)學(xué)家費(fèi)希爾、遺傳學(xué)家霍爾丹(Haldane JBS)和美國遺傳學(xué)家賴特(Wright S)等建立了群體遺傳學(xué)的數(shù)學(xué)基礎(chǔ)及相關(guān)計(jì)算方法,從而初步形成了群體遺傳學(xué)理論體系,群體遺傳學(xué)也逐步發(fā)展成為一門獨(dú)立的學(xué)科。群體遺傳學(xué)是研究生物群體的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳結(jié)構(gòu)變化規(guī)律的科學(xué),它應(yīng)用數(shù)學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)的原理和方法研究生物群體中基因頻率和基因型頻率的變化,以及影響這些變化的環(huán)境選擇效應(yīng)、遺傳突變作用、遷移及遺傳漂變等因素與遺傳結(jié)構(gòu)的關(guān)系,由此來探討生物進(jìn)化的機(jī)制并為育種工作提供理論基礎(chǔ)。從某種意義上來說, 生物進(jìn)化就是群體遺傳結(jié)構(gòu)持續(xù)變化和演變的過程, 因此群體遺傳學(xué)理論在生物進(jìn)化機(jī)制特別是種內(nèi)進(jìn)化機(jī)制的研究中有著重要作用。

在20世紀(jì)60年代以前, 群體遺傳學(xué)主要還只涉及到群體遺傳結(jié)構(gòu)短期的變化,這是由于人們的壽命與進(jìn)化時(shí)間相比極為短暫,以至于沒有辦法探測(cè)經(jīng)過長期進(jìn)化后群體遺傳的遺傳變化或者基因的進(jìn)化變異,只好簡單地用短期變化的延續(xù)來推測(cè)長期進(jìn)化的過程。而利用大分子序列特別是DNA序列變異來進(jìn)行群體遺傳學(xué)研究后,人們可以從數(shù)量上精確地推知群體的進(jìn)化演變, 并可檢驗(yàn)以往關(guān)于長期進(jìn)化或遺傳系統(tǒng)穩(wěn)定性推論的可靠程度。同時(shí), 對(duì)生物群體中同源大分子序列變異式樣的研究也使人們開始重新審視達(dá)爾文的以"自然選擇"為核心的生物進(jìn)化學(xué)說。20世紀(jì)60年代末、70年代初,Kimura、King和Jukes相繼提出了中性突變的隨機(jī)漂變學(xué)說: 認(rèn)為多數(shù)大分子的進(jìn)化變異是選擇性中性突變隨機(jī)固定的結(jié)果。此后,分子進(jìn)化的中性學(xué)說得到進(jìn)一步完善,如Ohno關(guān)于復(fù)制在進(jìn)化中的作用假說: 認(rèn)為進(jìn)化的發(fā)生主要是重復(fù)基因獲得了新的功能,自然選擇只不過是保持基因原有功能的機(jī)制;最近Britten甚至推斷幾乎所有的人類基因都來自于古老的復(fù)制事件。盡管中性學(xué)說也存在理論和實(shí)驗(yàn)方法的缺陷, 但是它為分子進(jìn)化的非中性檢測(cè)提供了必要的理論基礎(chǔ)。目前, "選擇學(xué)說"和"中性進(jìn)化學(xué)說"仍然是分子群體遺傳學(xué)界討論的焦點(diǎn)。

1971年,Kimura最先明確地提出了分子群體遺傳學(xué)這一新的學(xué)說。其后, Nei從理論上對(duì)分子群體遺傳學(xué)進(jìn)行了比較系統(tǒng)的闡述。1975年, Watterson估算了基于替代模型下的DNA多態(tài)性的參數(shù)Theta(θ)值和期望方差。1982年, 英國數(shù)學(xué)家Kingman構(gòu)建了"溯祖"原理的基本框架, 從而使得以少量的樣本來代表整個(gè)群體進(jìn)行群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究成為可能, 并可以進(jìn)一步推斷影響遺傳結(jié)構(gòu)形成的各種演化因素。溯祖原理的"回溯"分析使得對(duì)群體進(jìn)化歷史的推測(cè)更加合理和可信。1983年, Tajima推導(dǎo)了核甘酸多樣度參數(shù)Pi(π)的數(shù)學(xué)期望值和方差值。此后, 隨著中性平衡的相關(guān)測(cè)驗(yàn)方法等的相繼提出, 分子群體遺傳學(xué)的理論及分析方法日趨完善。

近20年來, 在分子群體遺傳學(xué)的基礎(chǔ)上, 又衍生出一些新興學(xué)科分支, 如分子系統(tǒng)地理學(xué)(molecular phylogeography)等。系統(tǒng)地理學(xué)的概念于1987年由Avise提出, 其強(qiáng)調(diào)的是一個(gè)物種的基因系譜當(dāng)前地理分布方式的歷史成因, 同時(shí)對(duì)物種擴(kuò)散、遷移等微進(jìn)化歷史等進(jìn)行有效的推測(cè)。

2. 實(shí)驗(yàn)植物分子群體遺傳研究內(nèi)容及進(jìn)展

基于DNA序列變異檢測(cè)手段的實(shí)驗(yàn)分子群體遺傳學(xué)研究始于1983年, 以Kreitman發(fā)表的"黑腹果蠅的乙醇脫氫酶基因位點(diǎn)的核苷酸多態(tài)性"一文為標(biāo)志。以植物為研究對(duì)象的實(shí)驗(yàn)分子群體遺傳學(xué)論文最早發(fā)表于20世紀(jì)90年代初期, 但是由于當(dāng)時(shí)DNA測(cè)序費(fèi)用昂貴等原因, 植物分子群體遺傳學(xué)最初發(fā)展比較緩慢, 隨著DNA測(cè)序逐漸成為實(shí)驗(yàn)室常規(guī)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)之一以及基于溯祖理論的各種計(jì)算機(jī)軟件分析程序的開發(fā)和應(yīng)用, 實(shí)驗(yàn)分子群體遺傳學(xué)近10年來得到了迅速的發(fā)展, 相關(guān)研究論文逐年增多, 研究的植物對(duì)象主要集中在模式植物擬南芥(Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.)及重要的農(nóng)作物如玉米(Zea mays L.)、大麥(Hordeum vulgare L.), 水稻(Orazy sativa L.)、高粱(Sorghum bicolor L.)、向日葵(Helianthus annuus L.)等上。其研究內(nèi)容涵蓋了群體遺傳結(jié)構(gòu)(同源DNA分化式樣)、各種進(jìn)化力量如突變, 重組, 連鎖不平衡、選擇等對(duì)遺傳結(jié)構(gòu)的影響、群體內(nèi)基因進(jìn)化方式(中性或者適應(yīng)性進(jìn)化)、群體間的遺傳分化及基因流等。同時(shí), 通過對(duì)栽培物種與野生祖先種或野生近緣種的DNA多態(tài)性比較研究, 分子群體遺傳學(xué)在研究作物馴化的遺傳學(xué)原因及結(jié)果等也取得了重要的進(jìn)展, 如作物馴化的遺傳瓶頸, 人工選擇對(duì)"馴化基因"核苷酸多態(tài)性的選擇性清除(selective sweep)作用等等。

2.1 植物基因或基因組DNA多態(tài)性

分子群體遺傳學(xué)的研究基礎(chǔ)是DNA序列變異。同源DNA序列的遺傳分化程度是衡量群體遺傳結(jié)構(gòu)的主要指標(biāo), 其分化式樣則是理解群體遺傳結(jié)構(gòu)產(chǎn)生和維持的進(jìn)化內(nèi)在驅(qū)動(dòng)力諸如遺傳突變、重組、基因轉(zhuǎn)換的前提。隨著DNA測(cè)序越來越快捷便利及分子生物學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展, 越來越多的全基因組序列或者基因序列的測(cè)序結(jié)果被發(fā)表, 基因在物種或群體中的DNA多態(tài)性式樣也越來越多地被闡明。

植物中, 對(duì)擬南芥和玉米基因組的DNA多態(tài)性的調(diào)查最為系統(tǒng), 研究報(bào)道也較多。例如, Nordborg等對(duì)96個(gè)樣本組成的擬南芥群體中的876個(gè)同源基因片段(0.48 Mbp)的序列單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行了調(diào)查, 共檢測(cè)到17 000多個(gè)SNP, 大約平均每30 bp就存在1個(gè)SNP位點(diǎn)。而Schmid等的研究結(jié)果顯示: 擬南芥基因組核甘酸多態(tài)性平均為0.007( W)。Tenaillon等對(duì)22個(gè)玉米植株的1號(hào)染色體上21個(gè)基因共14 420 bp序列的分析結(jié)果顯示玉米具有較高的DNA多態(tài)性(1SNP/27.6 bp、 =0.0096)。Ching等研究顯示: 36份玉米優(yōu)系的18個(gè)基因位點(diǎn)的非編碼區(qū)平均核苷酸多態(tài)性為1SNP/31 bp, 編碼區(qū)平均為1SNP/124 bp, 位點(diǎn)缺矢和插入則主要出現(xiàn)在非編碼區(qū)。此外, 其他物種如向日葵、馬鈴薯(Solanum tuberosum)、高粱、火矩松(Pinus taeda L.)、花旗松(Douglas fir)等中部分基因位點(diǎn)的DNA多態(tài)性也得到調(diào)查, 結(jié)果表明不同的物種的DNA多態(tài)性存在較大的差異。

繁育方式是顯著影響植物基因組的DNA多態(tài)性重要因素之一。通常來說, 自交物種往往比異交物種的遺傳多態(tài)性低, 這已經(jīng)被一些親緣關(guān)系相近但繁育方式不同的物種如Lycopersicon屬植物和Leavenworthia屬植物的種間比較研究所證實(shí)。但是在擬南芥屬中則不然, Savolainen等比較了不同繁育方式的兩個(gè)近緣種Arabidopsis thaliana(自交種)和Arabidopsis lyrata(異交種)的乙醇脫氫酶基因(Alcohol Dehydrogenase)的核苷酸多態(tài)性, 結(jié)果發(fā)現(xiàn)A. thaliana的核苷酸多態(tài)性參數(shù)Pi值為0.0069, 遠(yuǎn)高于A. lyrata的核苷酸多態(tài)性(Pi=0.0038)。

2.2 連鎖不平衡

不同位點(diǎn)的等位基因在遺傳上不總是獨(dú)立的, 其連鎖不平衡程度在構(gòu)建遺傳圖譜進(jìn)行分子育種及圖位克隆等方面具有重要的參考價(jià)值。Rafalski和Morgante等在比較玉米和人類群體的連鎖不平衡和重組的異同時(shí)對(duì)連鎖不平衡的影響因素做了全面的闡述, 這些因素包括繁育系統(tǒng)、重組率、群體遺傳隔離、居群亞結(jié)構(gòu)、選擇作用、群體大小、遺傳突變率、基因組重排以及其他隨機(jī)因素等。物種的繁育系統(tǒng)對(duì)連鎖不平衡程度具有決定性的影響, 通常來說, 自交物種的連鎖不平衡水平較高, 而異交物種的連鎖不平衡水平相對(duì)較低。但是也有例外, 如野生大麥屬于自交物種, 然而它的連鎖不平衡水平極低。

擬南芥是典型的自交植物, 研究表明: 擬南芥組基因大多數(shù)位點(diǎn)的連鎖不平衡存在于15~25 kb左右的基因組距離內(nèi), 但是在特定位點(diǎn)如控制開花時(shí)間的基因及鄰接區(qū)域, 連鎖不平衡達(dá)到250 kb的距離。擬南芥基因組高度變異區(qū)段同樣具有較強(qiáng)的連鎖不平衡。這些研究結(jié)果說明擬南芥非常適合構(gòu)建連鎖圖譜, 因?yàn)橛蒙倭康臉颖揪涂梢越M成一個(gè)有效的作圖群體。除擬南芥外, 其它自交物種大多表現(xiàn)出較高的連鎖不平衡水平, 如大豆的連鎖不平衡大于50 kb; 栽培高粱的連鎖不平衡大于15 kb; 水稻的Xa位點(diǎn)連鎖不平衡可以達(dá)到100 kb以上。

與大多數(shù)自交物種相比, 異交物種的連鎖不平衡程度則要低得多。例如, 玉米的1號(hào)染色體的體連鎖不平衡衰退十分迅速,大約200 bp距離就變得十分微弱, 但是在特定的玉米群體如遺傳狹窄的群體或者特定基因位點(diǎn)如受到人工選擇的位點(diǎn), 連鎖不平衡水平會(huì)有所增強(qiáng)。野生向日葵中, 連鎖不平衡超過200 bp的距離就很難檢測(cè)到(r=0.10), 而栽培向日葵群體連鎖不平衡程度則可能夠達(dá)到約1 100 bp的距離(r=0.10)。馬鈴薯的連鎖不平衡在短距離內(nèi)下降迅速(1 kb降到r2=0.2左右), 但在1Kb以外下降卻十分緩慢(10 cM降到r2=0.1)。此外, 異交繁育類型的森林樹種如火矩松、花旗松等同樣顯示出低水平的連鎖不平衡。

2.3 基因組重組對(duì)DNA多態(tài)性的影響

基因組的遺傳重組是指二倍體或者多倍體植物或者動(dòng)物減數(shù)分裂時(shí)發(fā)生的同源染色體之間的交換或者轉(zhuǎn)換。它通過打破遺傳連鎖而影響群體的DNA多態(tài)性式樣, 其在基因組具點(diǎn)發(fā)生的概率與該位點(diǎn)的結(jié)構(gòu)有很大的關(guān)系, 基因組上往往存在重組熱點(diǎn)區(qū)域, 如玉米的bronze(bz)位點(diǎn), 其重組率高于基因組平均水平100倍以上; 并且重組主要發(fā)生在染色體上的基因區(qū)域, 而不是基因間隔區(qū)。同時(shí), 在基因密度高的染色體區(qū)段比基因密度低的染色體區(qū)段發(fā)生重組的頻率也要高得多; 在不同的物種中, 基因組重組率平均水平也有很大的差異。如大麥群體基因組的重組率為 =7~8×10-3,高于擬南芥( =2×10-4)40倍, 但只有玉米( =12~14×10-3)的一半左右。

目前有很多關(guān)于重組和DNA多態(tài)性之間的相關(guān)關(guān)系的研究, 但是沒有得到一致的結(jié)論。部分研究顯示重組對(duì)DNA多態(tài)性具有較強(qiáng)的影響。如Tenaillon等研究顯示玉米1號(hào)染色體的DNA多態(tài)性高低與重組率具有較高的相關(guān)性(r=0.65, P=0.007), 野生玉米群體、大麥及野生番茄也都存在同樣的現(xiàn)象。而在擬南芥中, 重組對(duì)DNA多態(tài)性的貢獻(xiàn)率就非常低。Schmid等用大量的基因位點(diǎn)對(duì)擬南芥群體的核苷酸多態(tài)性進(jìn)行調(diào)查后發(fā)現(xiàn): 重組率與核苷酸多態(tài)性相關(guān)關(guān)系不顯著; Wright等調(diào)查了擬南芥1號(hào)和2號(hào)染色體的6個(gè)自然群體序列變異式樣, 結(jié)果顯示, 在著絲粒附近重組被抑制的染色體區(qū)域, 核苷酸多態(tài)性并沒有隨之降低。說明了擬南芥基因組的重組率與DNA多態(tài)性并沒有必然的相關(guān)關(guān)系。Baudry等對(duì)番茄屬內(nèi)5個(gè)種進(jìn)行了比較研究, 結(jié)果也顯示重組對(duì)種群間的DNA多態(tài)性的影響也不明顯。

2.4 基因進(jìn)化方式(中性進(jìn)化或適應(yīng)性進(jìn)化)

分子群體遺傳學(xué)有兩種關(guān)于分子進(jìn)化的觀點(diǎn): 一種是新達(dá)爾文主義的自然選擇學(xué)說, 認(rèn)為在適應(yīng)性進(jìn)化過程中, 自然選擇在分子進(jìn)化起重要作用, 突變起著次要的作用。新達(dá)爾文主義的主要觀點(diǎn)包括: 任何自然群體中經(jīng)常均存在足夠的遺傳變異, 以對(duì)付任何選擇壓力; 就功能來說, 突變是隨機(jī)的; 進(jìn)化幾乎完全取決于環(huán)境變化和自然選擇; 一個(gè)自然群體的遺傳結(jié)構(gòu)往往對(duì)它生存的環(huán)境處于或者接近于最適合狀態(tài); 在環(huán)境沒有發(fā)生改變的情況下, 新突變均是有害的。另一種是日本學(xué)者Kimura為代表的中性學(xué)說, 認(rèn)為在分子水平上, 種內(nèi)的遺傳變異(蛋白質(zhì)或者DNA序列多態(tài)性)為選擇中性或者近中性, 種內(nèi)的遺傳結(jié)構(gòu)通過注入突變和隨機(jī)漂變之間的平衡來維持, 生物的進(jìn)化則是通過選擇性突變的隨機(jī)固定(有限群體的隨機(jī)樣本漂移)來實(shí)現(xiàn), 即認(rèn)為遺傳漂變是進(jìn)化的主要原因, 選擇不占主導(dǎo)地位。這兩種學(xué)說, 在實(shí)驗(yàn)植物分子群體遺傳學(xué)的研究中都能得到一定的支持。

對(duì)植物基因在種內(nèi)進(jìn)化方式的研究主要集中在擬南芥菜、玉米、大麥等農(nóng)作物及少數(shù)森林樹種。Wright和Gaut對(duì)2005以前發(fā)表的相關(guān)文章進(jìn)行詳細(xì)的統(tǒng)計(jì), 結(jié)果顯示: 擬南芥中大約有30%的基因表現(xiàn)為適應(yīng)性進(jìn)化; 玉米中大約有24%的基因表現(xiàn)為非中性進(jìn)化; 大麥的9個(gè)基因中, 有4個(gè)受到了選擇作用的影響。

選擇作用主要包括正向選擇、平衡選擇、背景選擇及穩(wěn)定選擇, 它們單獨(dú)或者聯(lián)合對(duì)特定基因的進(jìn)化方式產(chǎn)生影響。如花旗松中的控制木材質(zhì)量和冷硬性狀的基因、火炬松的耐旱基因、歐洲山楊(European aspen)的食草動(dòng)物誘導(dǎo)的蛋白酶抑制基因(Herbivore-induced Protease Inhibitor)等, 經(jīng)檢測(cè)在各自的群體受到了正向選擇、平衡選擇、背景選擇單獨(dú)或者多重影響。植物抗性基因(R基因)是研究得比較深入的一類基因, 大部分研究結(jié)果顯示抗性基因具有高度的多態(tài)性, 并經(jīng)受了復(fù)雜的選擇作用。Liu和Burke對(duì)栽培大麥和野生大麥群體中9個(gè)基因在調(diào)查顯示其中的8個(gè)基因受到穩(wěn)定選擇。Simko等對(duì)47份馬鈴薯66個(gè)基因位點(diǎn)調(diào)查表明, 大部分基因位點(diǎn)在馬鈴薯群體進(jìn)化過程中受到了直接選擇或者分化選擇作用。以上對(duì)不同物種的不同基因位點(diǎn)的研究都強(qiáng)調(diào)了分子進(jìn)化的非中性的結(jié)果, 這說明選擇在基因的進(jìn)化過程中具有非常重要的作用; 另一方面, 中性進(jìn)化的結(jié)果報(bào)道較少, 或被有意或者無意地忽略, 事實(shí)上即使在強(qiáng)調(diào)選擇作用的研究文獻(xiàn)中, 仍然有相當(dāng)一部分基因表現(xiàn)為中性進(jìn)化, 說明在種內(nèi)微觀進(jìn)化的過程中, 選擇作用和中性漂變作用可能單獨(dú)或者聯(lián)合影響了物種內(nèi)不同的基因位點(diǎn), 共同促進(jìn)了物種的進(jìn)化。

2.5 群體遺傳分化

分子群體遺傳學(xué)一個(gè)重要的研究內(nèi)容是闡明物種不同群體之間甚至不同物種群體之間(通常近緣種, 如栽培種及其近緣種或祖先野生種)遺傳結(jié)構(gòu)的差異即遺傳分化, 并推測(cè)形成這種差異的原因, 從而使人能夠更好地理解種群動(dòng)態(tài)。

第6篇:遺傳學(xué)的研究對(duì)象范文

【關(guān)鍵詞】染色體核型;Y染色體;大Y染色體;男性不育癥

【中圖分類號(hào)】R698+.2【文獻(xiàn)標(biāo)志碼】A

世界衛(wèi)生組織(WHO)規(guī)定,夫婦不采用任何避孕措施規(guī)律夫妻生活1年以上、由于男方因素造成女方不孕者稱為男性不育。據(jù)統(tǒng)計(jì),全球約有10%~15%的育齡夫婦受到不孕不育的困擾。生精功能障礙的分子調(diào)控機(jī)制目前仍有眾多未解之謎;男性不育的病因復(fù)雜,包括感染、精索靜脈曲張、免疫異常、理化因素及內(nèi)分泌紊亂等外,約30%男性不育患者是由基因突變或染色體畸形等遺傳因素引起\[1,2\],尤應(yīng)引起足夠重視。

染色體多態(tài)性是指在正常人群中可見各種染色體形態(tài)微小變異,如結(jié)構(gòu)、帶型及強(qiáng)度差異等。這種多態(tài)性在個(gè)體中恒定,但在群體中會(huì)發(fā)生變異。對(duì)于男性,Y染色體是一個(gè)小的近端著絲粒染色體,大部分是異染色質(zhì),容易發(fā)生形態(tài)學(xué)的變化,從而導(dǎo)致Y染色體的異常。Y染色體長度的變異通常被認(rèn)為是人類染色體多態(tài)性的一種,臨床上最常見的即是大Y染色體,診斷標(biāo)準(zhǔn)是:同一核型中Y與18號(hào)染色體長度比較,Y≥18即為大Y\[3,4\]。

關(guān)于大Y染色體對(duì)男性生育力的影響及其臨床效應(yīng),目前意見尚未統(tǒng)一。不可否認(rèn),Y染色體在性別決定和分化中起重要作用,Y染色體短臂上有決定因子(testis determining factor,TDF),而Y染色體長臂1區(qū)1帶(Yq11)上有產(chǎn)生的調(diào)控基因,所以有研究認(rèn)為大Y與子育異常特別是男性生殖功能有關(guān)聯(lián),有顯著的臨床效應(yīng);但是,基于人類Y染色體很大部分是異染色質(zhì),極易發(fā)生形態(tài)學(xué)變化,異染質(zhì)中DNA過多重復(fù)很容易造成這種Y染色體長度的增加\[5-7\],故也有的研究認(rèn)為大Y是一種正常的多態(tài)性變異,并無臨床意義\[7,8\]。隨著生殖醫(yī)學(xué)及男科學(xué)的進(jìn)展,對(duì)于重度少、弱精癥以及某些梗阻性無精癥的患者可以通過單卵泡漿內(nèi)注射技術(shù)(ICSI)解決生育難題\[9\],但同時(shí),從優(yōu)生優(yōu)育角度,潛在的遺傳風(fēng)險(xiǎn)對(duì)子代的影響加劇,對(duì)其進(jìn)行評(píng)估和干預(yù)顯得尤為重要。因此,大Y染色體對(duì)男性生殖力的影響及其效應(yīng)分析,值得深入探討。

本研究通過回顧分析大Y染色體核型的臨床效應(yīng)來探討其對(duì)男性生育力的影響,并分析在男性不育癥臨床診療中的指導(dǎo)意義。

1資料與方法

1.1研究對(duì)象與臨床資料

研究對(duì)象包括從2007年1月至2013年6月期間,在我院婦產(chǎn)科遺傳研究室進(jìn)行染色體核型分析的患者。本研究人群均為成年男性,分為兩組,A組包括配偶曾有不良孕產(chǎn)史或本次妊娠羊水穿刺發(fā)現(xiàn)胎兒染色體異常者,不良妊娠史包括自然流產(chǎn)史、胚胎停育、多發(fā)流產(chǎn)、畸形兒生育史、死胎死產(chǎn)史等,胎兒染色體異常包括大Y及其他異常核型等;B組是男性不育患者(包括重度少、弱精癥、無精癥、畸形癥等)。所有病例均在??崎T診就診,經(jīng)??漆t(yī)師進(jìn)行詳細(xì)詢問病史及常規(guī)化驗(yàn)及檢查排除內(nèi)分泌、免疫、感染及外生殖器解剖異常等器質(zhì)性病因后,診斷具備進(jìn)行細(xì)胞遺傳學(xué)核型分析的指征,常規(guī)抽取外周血,進(jìn)行染色體核型分析。

1.2研究方法

外周血淋巴細(xì)胞常規(guī)培養(yǎng)68~72h,收獲前加秋水仙素作用于細(xì)胞3~4h后常規(guī)方法制片。標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)Trysin-Giemsa染色, G顯帶。計(jì)數(shù)30個(gè)細(xì)胞中期分裂相,分析5個(gè)核型;染色體異常者分析10個(gè)核型。根據(jù)人類細(xì)胞遺傳學(xué)國際命名體制(ISCN)對(duì)染色體進(jìn)行命名。Y染色體的多態(tài)性多表現(xiàn)在有高度重復(fù)順序的DNA區(qū)域,為異染色質(zhì)區(qū)。判斷標(biāo)準(zhǔn):同一核型中,Y染色體長度≥18號(hào)染色體長度診斷為大Y。診斷結(jié)果經(jīng)本院研究室2名遺傳學(xué)家進(jìn)行分析、認(rèn)定及復(fù)核。

1.3統(tǒng)計(jì)分析

使用SPSS 13.0 Windows統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)所得數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,χ2檢驗(yàn)分析不同組別之間的大Y檢出率有無差別,P

2結(jié)果

2.1總體檢測(cè)結(jié)果

2007年1月至2013年6月,共有2139例男性受檢者,包括A組1326例,B組813例,共檢出68例大Y染色體核型。其中,A組檢出大Y核型47例,檢出率為3.54%(本組大Y核型檢出者的配偶同時(shí)行染色體核型分析:除1例核型表現(xiàn)為45,XX,rob(13;14)(q10;q10)外,其余均無異常,統(tǒng)計(jì)結(jié)果已剔除該例);在B組,檢出大Y核型21例,檢出率為2.58%。

2.2不同組別間大Y檢出率的比較

對(duì)兩組間的大Y核型檢出率進(jìn)行比較,χ2=1.217,P>0.05,無統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著差異,具體結(jié)果見表1。

2.3大Y核型臨床效應(yīng)分析

對(duì)所有大Y核型檢出者進(jìn)行臨床分析,不僅僅表現(xiàn)出無精癥、少、弱精癥等臨床效應(yīng),導(dǎo)致男性不育;同時(shí),在A組,研究對(duì)象已排除配偶的內(nèi)分泌、免疫、感染及外生殖器解剖異常等器質(zhì)性病因,并基于配偶的染色體核型分析正常,大Y核型對(duì)男性生育力的影響還間接地體現(xiàn)在其配偶胚胎停育、自然流產(chǎn)等不良妊娠結(jié)局上。結(jié)果見表2。

3討論

環(huán)境污染的加劇及各種不良生活方式的影響,導(dǎo)致男性生育力呈現(xiàn)下降趨勢(shì)。但隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的進(jìn)步,對(duì)于嚴(yán)重男性生育力低下的患者,如無精癥及重度少、弱精癥等患者,胞漿內(nèi)單注射技術(shù)(ICSI)使其有希望擁有生物學(xué)意義上的后代;與之相伴隨,潛在的遺傳風(fēng)險(xiǎn)對(duì)子代的影響也相應(yīng)提高,目前的胚胎移植前遺傳學(xué)診斷技術(shù)(PGD)并不能完全篩查所有的遺傳疾病。男性不育癥患者特別是重度生育力低下的患者臨床表現(xiàn)多數(shù)是無精癥、少精癥、弱精癥等,許多非梗阻性無癥和嚴(yán)重少癥患者的病因及發(fā)病機(jī)制尚不清楚,約30%患者是由染色體畸形或基因突變等遺傳因素引起的不育\[1\]。因此,本研究探討大Y染色體這種遺傳多態(tài)性對(duì)男性生育力的影響及效應(yīng)分析,具有很強(qiáng)的臨床針對(duì)性。

Y染色體的長度只有X染色體的1/3,并且在重要區(qū)域缺乏與X染色體的重組,這將會(huì)導(dǎo)致Y染色體遺傳性狀慢慢衰退。關(guān)于人類Y染色體上的基因是否會(huì)因?yàn)槿狈χ亟M而導(dǎo)致基因的大量丟失最終導(dǎo)致Y染色體的消亡以至影響到雄性個(gè)體的存在?這一命題曾經(jīng)在科學(xué)界引起了很大的爭議。關(guān)于大Y染色體核型是否對(duì)男性生育力造成影響,正是隨著這種對(duì)Y染色體遺傳變遷趨勢(shì)的爭議而逐漸被研究學(xué)界所關(guān)注?;谌祟怸染色體很大部分是異染色質(zhì),極易發(fā)生形態(tài)學(xué)變化,異染質(zhì)中DNA過多重復(fù)很容易造成這種Y染色體長度的增加\[5-7\],故也有的研究認(rèn)為大Y是一種正常的多態(tài)性變異,并無臨床意義\[7,8\]。但是,細(xì)胞遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn),Y染色體長臂的變異與男性生精障礙有密切關(guān)系\[13,14\],因?yàn)镈NA的過多重復(fù)可能產(chǎn)生劑量效應(yīng),影響正常的有絲分裂發(fā)生程序,基因調(diào)節(jié)及細(xì)胞分化異常。因此,也有觀點(diǎn)認(rèn)為大Y表現(xiàn)出臨床效應(yīng)。由于正常生育子代的男性很少去做染色體檢查,故正常人群中大Y的發(fā)生率文獻(xiàn)報(bào)道非常不一致,所以,關(guān)于大Y的臨床意義如何目前并沒有定論。

本研究在男性不育組共檢出大Y核型21例,占大Y檢出總數(shù)的30.87%,臨床效應(yīng)主要表現(xiàn)為少、弱精癥及無精癥等。在不良孕產(chǎn)結(jié)局組檢出大Y核型47例,占大Y檢出總數(shù)的69.13%,臨床效應(yīng)為胚胎停育、自然流產(chǎn)等。兩組大Y的檢出率分別為2.58%及3.54%,比較并不存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。事實(shí)上,廣義的男性生殖功能障礙包括患者能使得女方受孕但不能生產(chǎn)健康活嬰。因此,大Y對(duì)不良孕產(chǎn)結(jié)局有否影響也值得關(guān)注。

本研究發(fā)現(xiàn)大Y核型者臨床表現(xiàn)為生育力低下,如弱精癥、少精癥及無精癥等,以及配偶的自然流產(chǎn)及胚胎停育等不良妊娠結(jié)局(詳見研究結(jié)果表1)。提示大Y核型可能具有一定的臨床效應(yīng)。調(diào)控機(jī)制可能與大Y長臂異染色質(zhì)區(qū)的串聯(lián)重復(fù)序列DNA過多的重復(fù)導(dǎo)致基因調(diào)控及細(xì)胞生長分化異常有關(guān)\[10\]。大Y核型的臨床效應(yīng)值得深入分析。何湘嬌等\[10-13\]的研究提示,有一部分大Y核型并沒有明顯臨床表現(xiàn),本研究亦是發(fā)現(xiàn)有11例大Y核型者的配偶羊水穿刺顯示胎兒亦是大Y核型(占大Y總數(shù)的16%),雖然親代沒有明顯的臨床表現(xiàn)。但是,相關(guān)報(bào)道提示大Y核型與癲癇,先天性智力低下、大腦發(fā)育不全、多動(dòng)癥等疾病都有密切關(guān)系\[14,15\]。所以,從優(yōu)生優(yōu)育的角度,即使夫妻雙方臨床表型無異常,羊水穿刺顯示胎兒大Y核型者也應(yīng)引起足夠重視,需要通過后續(xù)深入研究解析大Y對(duì)子代健康的長期影響。

但是,大Y遺傳多態(tài)性對(duì)生精功能調(diào)控的詳細(xì)機(jī)制還有待于進(jìn)一步解析,具體的分子生物學(xué)機(jī)制并不清楚。隨著遺傳學(xué)、基因組學(xué)、細(xì)胞及分子生物學(xué)等各學(xué)科的相互交叉與滲透,對(duì)大Y染色體與男性不育的關(guān)聯(lián)將會(huì)有更深入的認(rèn)識(shí),同時(shí)也將為男性不育的治療提供新的思路。大Y染色體對(duì)男性生育力及妊娠過程的調(diào)控機(jī)制還有待于在分子生物學(xué)層面進(jìn)行深入研究\[16,17\]。

由于缺乏正常人群中大Y檢出率的詳實(shí)數(shù)據(jù),因?yàn)檎I】祷顙氲哪行院苌偃プ鋈旧w分析,所以男性不育及不良孕產(chǎn)結(jié)局中大Y檢出率與正常人群攜帶者的比較還有待于深入探討。但本研究基于回顧性臨床分析發(fā)現(xiàn),大Y核型可能表現(xiàn)出一定的臨床效應(yīng),如男性不育癥、配偶的不良妊娠結(jié)局等,值得臨床上深入研究。

綜上所述,大Y核型也許不僅僅是一種遺傳多態(tài)性,而是可能具備一定的臨床效應(yīng)。大Y對(duì)男性不育及不良妊娠結(jié)局的關(guān)聯(lián)需要在更多樣本量及更高證據(jù)級(jí)別的研究中進(jìn)一步論證及評(píng)估。

(致謝:感謝北大醫(yī)院統(tǒng)計(jì)教研室李雪迎教授、華東師范大學(xué)醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)中心執(zhí)行副主任徐進(jìn)副教授及趙華東博士在統(tǒng)計(jì)學(xué)方面給予的幫助。)

參考文獻(xiàn)

\[1\]姜輝,田楊,黃錦,等.重視染色體基因缺陷對(duì)男性生育的影響.北京大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版),2012,44(4):504-506.

\[2\]Skaletsky H,Kuroda-Kawaguchi T,Minx PJ,et al. The male-specific region of the human Y chromosome is a mosaic of discrete sequence classes. Nature,2000(423):825-837.

\[3\]Chang PL,Saner MV,Brown S.Y chromosome microdeletionin a father and his four infertile soils.Hum Repred,1999,14(11):2689-2694.

\[4\]董媛,武婧,杜日成,等.男性生殖異常患者Y染色體異常及AZF微缺失分析.中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2013,36(1):50-52.

\[5\]張清健,鄭立新,田佩玲,等.人類男性Y染色體變異對(duì)男性生育力影響的臨床分析.中國計(jì)劃生育學(xué)雜志,2006,5(127):289-292.

\[6\]楊元,張思仲.Y染色體變異與男性不育.中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志,2010,27(3):276-280.

\[7\]沈婉英.漢族男性Y染色體相對(duì)長度152例分析.遺傳與疾病, 1990,7(1): 37.

\[8\]周煥庚,等.人類染色體.北京:科學(xué)出版社,1987.

\[9\]唐文豪,姜輝,馬潞林,等.非梗阻性無癥患者活檢組織細(xì)胞懸液檢查與病理組織學(xué)檢查檢出率的差異性研究.中華男科學(xué)雜志,2013,19(1):68-71.

\[10\]何湘嬌,吳嵩齡,陳勇,等.長沙地區(qū)大Y染色體核型98例臨床效應(yīng).中國優(yōu)生與遺傳雜志,2010,18(2):51,136.

\[11\]張鳳芹,張清泉.80例不育男性大Y染色體初步分析.生殖醫(yī)學(xué)雜志,2012,21(2):173-174.

\[12\]范玲玲.大Y染色體臨床效應(yīng)及其形成機(jī)理初步研究.山東大學(xué):婦產(chǎn)科學(xué)(生殖醫(yī)學(xué))學(xué)位論文,2010.

\[13\]田二坡,秦達(dá)念. Y染色體與男性不育關(guān)系的研究進(jìn)展.中華男科學(xué)雜志,2007,13(6):542-545.

\[14\]張靜,劉俊俊,霍滿鵬,等.大Y染色體的細(xì)胞遺傳學(xué)研究及其臨床效應(yīng)分析.延安大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)科學(xué)版),2009,7(2):5-6.

\[15\]田佩玲,葉嘉玲,陳平樂,等.大Y色體核型376例分析.中國男科學(xué)雜志,2004,18(2):32-33.

\[16\]Balkan M,Tekes S,Gedik A. Cytogenetic and Y chromosome microdeletion screening studies in infertile males with Oligozoospermia and Azoospermia in Southeast Turkey. J Assist ReprodGenet,2008(25):559-565.

第7篇:遺傳學(xué)的研究對(duì)象范文

關(guān)鍵詞:應(yīng)用型本科;園林植物遺傳育種學(xué);教學(xué)改革

基金項(xiàng)目:吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院2016年高等教育教學(xué)改革研究課題項(xiàng)目(項(xiàng)目編號(hào):110092016019)

中圖分類號(hào):S68-4 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: A DOI編號(hào): 10.14025/ki.jlny.2016.20.041

應(yīng)用型本科是以培養(yǎng)技能型人才為主的本科教育,面向區(qū)域經(jīng)濟(jì)社會(huì),以學(xué)科為依托,以應(yīng)用型專業(yè)教育為基礎(chǔ), 以社會(huì)人才需求為導(dǎo)向,培養(yǎng)高層次的應(yīng)用型人才。時(shí)下正處于本科教育應(yīng)用轉(zhuǎn)型的大背景下,如何高效高質(zhì)量地完成轉(zhuǎn)型,實(shí)現(xiàn)高層次應(yīng)用型人才培養(yǎng)的目標(biāo),成為各高等院校研究探索的首要任務(wù)。借鑒德國和瑞士先進(jìn)的經(jīng)驗(yàn),不難發(fā)現(xiàn)課程的改革是本科院校轉(zhuǎn)型發(fā)展的核心和切入點(diǎn),構(gòu)建應(yīng)用型課程是實(shí)現(xiàn)本科院??焖俎D(zhuǎn)型的有效路徑。

《園林植物遺傳育種學(xué)》是園林專業(yè)本科生的一門重要專業(yè)課,通過該課程的學(xué)習(xí),使學(xué)生了解園林植物遺傳和變異的基本規(guī)律,懂得如何對(duì)園林觀賞植物進(jìn)行品種培育和品種研究,從而為今后從事園林專業(yè)工作打下基礎(chǔ)。隨著遺傳學(xué)研究的深入、植物育種技術(shù)的迅猛發(fā)展,以及園林植物新品種的不斷涌現(xiàn),《園林植物遺傳育種學(xué)》課程的知識(shí)體系不斷地發(fā)生變化,因此該課程的教學(xué)難度增加,給教師帶來了極大的挑戰(zhàn)。本課程組結(jié)合該校實(shí)際情況從教材、教學(xué)內(nèi)容與方法、實(shí)踐教學(xué)、課程考核等幾個(gè)方面進(jìn)行了教學(xué)改革初步探索,以期更好地實(shí)現(xiàn)教學(xué)及人才培養(yǎng)目標(biāo)。

1精選教材

《園林植物遺傳育種學(xué)》發(fā)展迅速,課程內(nèi)容大大增加,需選用配套的、合適的新版教材,以避免知識(shí)內(nèi)容的陳舊。選取的教材應(yīng)該具有系統(tǒng)性、科學(xué)性、先進(jìn)性和實(shí)用性。在教學(xué)中還應(yīng)把教材中沒有的、最新國內(nèi)外研究進(jìn)展講授給學(xué)生,以補(bǔ)充和完善教學(xué)內(nèi)容。此外再以經(jīng)典教材為參考,如程金水主編的《園林植物遺傳育種學(xué)》、戴思蘭主編的《園林植物遺傳學(xué)》和《園林植物育種學(xué)》等,這些優(yōu)秀的教材可為教師和學(xué)生提供必要的參考,滿足專業(yè)需要。

2優(yōu)化調(diào)整教學(xué)內(nèi)容

《園林植物遺傳育種學(xué)》課程實(shí)質(zhì)是由《園林植物遺傳學(xué)》和《園林植物育種學(xué)》兩門課程合并而來。兩門課程分開來講授,通常先開設(shè)遺傳學(xué)再開設(shè)育種學(xué),這種模式易于造成課程整體的知識(shí)點(diǎn)不連貫,從而造成學(xué)生學(xué)習(xí)脫節(jié)。在育種學(xué)的學(xué)習(xí)與實(shí)踐過程中,學(xué)生不能很好的應(yīng)用所涉及的遺傳學(xué)規(guī)律,必然造成一些知識(shí)的重復(fù)性學(xué)習(xí)。合并后的課程知識(shí)連貫性好,但存在內(nèi)容多學(xué)時(shí)少的問題,因此根據(jù)學(xué)生的知識(shí)基礎(chǔ)與背景、授課學(xué)時(shí),結(jié)合本校實(shí)際情況,適應(yīng)轉(zhuǎn)型發(fā)展的需要,由課題組進(jìn)行教學(xué)內(nèi)容論證,逐章逐節(jié)對(duì)教材內(nèi)容進(jìn)行合理的取舍與組織,更好地整合課程內(nèi)容使教學(xué)內(nèi)容精簡優(yōu)化。如該課程的遺傳學(xué)部分知識(shí)內(nèi)容與高中生物學(xué)存在交叉和重復(fù),為避免學(xué)生的重復(fù)學(xué)習(xí),可減少相關(guān)內(nèi)容的學(xué)時(shí)分配,教學(xué)中要以高中生物學(xué)為基礎(chǔ),并改變教學(xué)側(cè)重點(diǎn)。孟德爾遺傳規(guī)律在大學(xué)階段的教授需要讓學(xué)生掌握“發(fā)現(xiàn)問題分析問題試驗(yàn)驗(yàn)證”這種嚴(yán)謹(jǐn)?shù)目蒲蟹椒ㄅc態(tài)度,而規(guī)律本身內(nèi)容可通過實(shí)驗(yàn)實(shí)踐來讓學(xué)生掌握。另外,遺傳學(xué)與育種學(xué)的部分知識(shí)內(nèi)容也要有機(jī)地結(jié)合,如基因突變、染色體變異與誘變育種相結(jié)合,染色體數(shù)目變異與倍性育種相結(jié)合,既避免重復(fù)學(xué)習(xí),又防止知識(shí)脫節(jié)現(xiàn)象的發(fā)生。

3改良教學(xué)方法

教學(xué)中需從傳統(tǒng)教學(xué)方法的應(yīng)用中總結(jié)經(jīng)驗(yàn)和不足,根據(jù)《園林植物遺傳育種學(xué)》課程的特點(diǎn),精心進(jìn)行教學(xué)設(shè)計(jì)、教學(xué)手段與方法的選擇。如將現(xiàn)代化教學(xué)手段與傳統(tǒng)教學(xué)手段相結(jié)合,在使用多媒體的同時(shí)使用黑板輔助教學(xué)。根據(jù)具體教學(xué)內(nèi)容采用適宜的教學(xué)方式,不同的教學(xué)內(nèi)容選取不同的教學(xué)手段與方法,可以有效提高教學(xué)質(zhì)量和教學(xué)效果。針對(duì)一些未能設(shè)置實(shí)驗(yàn)課的內(nèi)容,若要學(xué)生掌握其相關(guān)技能,教學(xué)方法應(yīng)用得當(dāng)尤為重要,如在課堂講解的同時(shí),結(jié)合啟發(fā)式教學(xué)、組織學(xué)生分組討論等方法,或使用多媒體視頻、動(dòng)畫直接展示,都能獲得較好的教學(xué)效果。雖然《園林植物遺傳育種學(xué)》課程的教學(xué)需要多種教學(xué)手段與方法共同使用,但仍需要以多媒體教學(xué)為主導(dǎo),因此多媒體課件的質(zhì)量十分重要。課件制作既要避免電子書式課件,又要防止課件太過花哨,缺少主題。

4注重培養(yǎng)實(shí)踐應(yīng)用能力

為了更好地培養(yǎng)學(xué)生實(shí)踐能力和創(chuàng)新能力,將該課程的實(shí)驗(yàn)部分設(shè)置為獨(dú)立實(shí)驗(yàn),與之前相比,實(shí)驗(yàn)課程的學(xué)時(shí)和學(xué)分增加了,相對(duì)重要性大大提高,學(xué)生的學(xué)習(xí)主動(dòng)性增強(qiáng)。課題組合理分配了實(shí)驗(yàn)學(xué)時(shí),如遺傳實(shí)驗(yàn)和育種實(shí)驗(yàn)比例合理,驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)、設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)和綜合性實(shí)驗(yàn)比例合理,并針對(duì)開課學(xué)期的不同合理設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)內(nèi)容。實(shí)驗(yàn)教學(xué)的目的是通過有限的實(shí)驗(yàn)課使學(xué)生掌握相關(guān)實(shí)踐技能,提高學(xué)生動(dòng)手與創(chuàng)新能力,因此要從提高學(xué)生學(xué)習(xí)和動(dòng)手的興趣出發(fā),改革實(shí)驗(yàn)教學(xué)。讓學(xué)生從實(shí)驗(yàn)課的準(zhǔn)備階段就開始動(dòng)手參與,如實(shí)驗(yàn)材料的采取,藥品配制等;打破學(xué)時(shí)限制,除完成課上的操作部分,還應(yīng)讓學(xué)生完成后期效果的觀察與記錄,如雜交、選種等。除上述改革外還應(yīng)注意該課程為“園林植物遺傳育種學(xué)”,這是一門以園林植物為研究對(duì)象的科學(xué),因此,無論是理論課堂的舉例還是實(shí)驗(yàn)課堂的實(shí)驗(yàn)材料都要盡量以園林植物為主,從而提高學(xué)生學(xué)習(xí)興趣,取得更好的教學(xué)效果。

5改進(jìn)課程考核的方式

通過考核方式的優(yōu)化,達(dá)到綜合考核學(xué)生知識(shí)、能力及素質(zhì)的目的。以往教學(xué)中對(duì)學(xué)生的考核主要是將平時(shí)表現(xiàn)、實(shí)驗(yàn)報(bào)告、小考、作業(yè)和期末考試等項(xiàng)目綜合得出的成績,以此反映學(xué)生對(duì)課程知識(shí)掌握情況,這種方式不能客觀地評(píng)價(jià)學(xué)生的實(shí)踐能力,因此要進(jìn)行重要實(shí)踐技能的操作考核,特別是獨(dú)立實(shí)驗(yàn)課的考評(píng)更要包括實(shí)驗(yàn)原理與實(shí)際操作兩個(gè)方面的考評(píng),從而正確評(píng)價(jià)學(xué)生的學(xué)習(xí)情況。通過改進(jìn)課程考核的方式,亦可促使學(xué)生對(duì)實(shí)踐的重視,從而實(shí)現(xiàn)應(yīng)用型專業(yè)人才的培養(yǎng)。

綜上所述,《園林植物遺傳育種學(xué)》課程教學(xué)改革的終極目的是為我國園林事業(yè)的發(fā)展培養(yǎng)高層次的專業(yè)技術(shù)人才。該課程的教學(xué)改革是本科教育應(yīng)用轉(zhuǎn)型的需要,是專業(yè)發(fā)展的需要,需要在不斷的實(shí)踐過程中逐步提升和完善。學(xué)生的綜合能力(動(dòng)手能力、創(chuàng)新能力以及解決實(shí)際問題的能力)仍有很大的提高空間,這需要在今后的教學(xué)中不斷進(jìn)行課程教學(xué)改革的探索和總結(jié),以充分開發(fā)學(xué)生的綜合能力。相信《園林植物遺傳育種學(xué)》的教學(xué)改革對(duì)園林花卉事業(yè)的發(fā)展,必定會(huì)起到積極的促進(jìn)作用。

參考文獻(xiàn)

[1]孟凡娟,王愛芝.高校《遺傳學(xué)》和高中《生物學(xué)》教學(xué)中的沖突和調(diào)和[J].高教論壇,2015,(11):86-88.

[2]劉志文,王英.提高遺傳學(xué)教學(xué)效果的措施分析[J].科技創(chuàng)新導(dǎo)報(bào),2011,(23):141-142.

[3]秦紅玫.園林植物遺傳育種學(xué)課程教學(xué)方法探討[J].綠色科技,2011,(07):243-244.

[4]顧翠花,王守先.關(guān)于園林植物遺傳育種學(xué)教學(xué)改革的幾點(diǎn)探索[J].黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué),2011,(09):133-135.

[5]吳建慧,王占斌.在“園林植物育種學(xué)”教學(xué)中培養(yǎng)學(xué)生創(chuàng)新能力的探討[J].中國林業(yè)教育,2005,(03):64-65.

第8篇:遺傳學(xué)的研究對(duì)象范文

論文摘要:為了改變傳統(tǒng)的將兩棲類動(dòng)物處死后再從肌肉提取 DNA的取樣方法,采用非傷害性取樣方法分別采集了虎紋蛙的血液和趾提取 DNA,并與從其肌肉中提取的DNA進(jìn)行了比較,結(jié)果顯示:使用血液和趾提取的DNA產(chǎn)量與肌肉樣本的 DNA產(chǎn)量相當(dāng);隨后,分別對(duì)3種方法取樣的樣本進(jìn)行了線粒體 16S rRNA和核 DNA的微衛(wèi)星 PCR分析,結(jié)果表明:3種取樣方法所獲得的擴(kuò)增效果相當(dāng),均能滿足虎紋蛙的保護(hù)遺傳學(xué)研究.因此認(rèn)為,用非傷害性取樣技術(shù)替代傳統(tǒng)的肌肉取樣的方法在無尾兩棲類的保護(hù)遺傳學(xué)研究中是切實(shí)可行的。

保護(hù)遺傳學(xué)與分子生態(tài)學(xué)的研究已經(jīng)成為現(xiàn)代生物學(xué)研究的熱點(diǎn),作為研究基礎(chǔ)的 DNA,其質(zhì)量的好壞成為影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的一個(gè)至關(guān)重要的因素.DNA的獲得通常采用的取樣方法有 3種:傷害性取樣(Destructive sampling)、非傷害性取樣(Nondestructive sampling)和非損傷性取樣(Non-invasive sampling)….傷害性取樣是指通過獲得研究對(duì)象的新鮮肌肉、肝臟或者脾等組織提取DNA.這種取樣方式對(duì)于物種的破壞極大,特別是對(duì)于珍稀瀕危物種而言,它的破壞力是毀滅性的因此,許多研究者已經(jīng)放棄了這種取樣方法.非損傷性取樣則是在不觸及或不傷害野生動(dòng)物本身的前提下,通過收集脫落的毛發(fā)或羽毛、糞便、尿液、食物殘?jiān)?含有口腔脫落細(xì)胞)、鹿角、魚鱗和卵殼等不同形式的樣品進(jìn)行遺傳分析的一種取樣方法.該方法的一個(gè)很大的特點(diǎn)是采樣不會(huì)對(duì)動(dòng)物本身產(chǎn)生傷害,但卻很難收集到完整的DNA,目前該方法比較多地應(yīng)用于大型獸類和鳥類的研究中.非傷害性取樣則是通過抽取動(dòng)物的血液、采集毛發(fā)或羽毛、耳、尾或趾等來用以分析無尾兩棲類作為生態(tài)系統(tǒng)中的一個(gè)重要組成部分,在農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)、水域生態(tài)系統(tǒng)以及森林生態(tài)系統(tǒng)中都起到非常重要的作用.然而,由于生境的喪失、外來種的入侵、過度的捕獵、紫外光的作用、化學(xué)物質(zhì)的影響H 和疾病,以及全球氣候的變化,使得無尾兩棲類的種群急劇減少因此,對(duì)無尾兩棲類的保護(hù)迫在眉睫.目前國內(nèi)對(duì)于無尾兩棲類的遺傳結(jié)構(gòu)、線粒體序列以及遺傳多樣性等方面的研究仍然采用傷害性取樣方法.采用非傷害性取樣甚至是非損傷性取樣策略在無尾兩棲類的研究中勢(shì)在必行.基于此,本文采用非傷害性取樣方法從無尾兩棲類的血液、腳趾提取 DNA樣本,探討了非傷害性取樣技術(shù)在無尾兩棲類保護(hù)遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及其處理

以采 自浙江金華的虎紋蛙 (Hoplobatrachurugulosus)3只作為實(shí)驗(yàn)材料.使用注射器對(duì)每一個(gè)體的活體從心臟抽取血液,同時(shí)剪下不同的趾作為標(biāo)記,然后處死,并剪下腿部肌肉作為實(shí)驗(yàn)的對(duì)照樣本.采集到的血樣使用酸性檸檬酸葡萄糖溶液 B(ACD)以體積比5:1混合抗凝,剪下的趾用95%乙醇液浸泡,所有的樣本均置于 一70℃超低溫冰箱保存.

1.2 方法

1.2.1 DNA的提取

根據(jù)文獻(xiàn)[10]的方法略作改動(dòng),具體如下:血液樣本:在常溫下解凍含有抗凝劑的血液樣本,取 100 IxL于離心管中,加入250 txL抽提緩沖液 (0.01 mol/L的 Tris-HC1(pH 8.0),0.mol/L的乙二胺 四乙酸二鈉 (EDTA,pH 8.0)5 g/L十二烷基硫酸鈉 ),離心(5 000 r/min,10rain),去上清液,在沉淀物中加人 100 IxL抽提緩沖液和5 L蛋白酶 K溶液(pK),37℃水浴 4 h.趾樣本:取 0.1 g 95%乙醇液浸泡的趾組織使用雙蒸水反復(fù)沖洗掉表面的乙醇并剪碎,加入500 L抽提緩沖液和5 L pK,55℃水浴4 h,離心(9 000 r/min,10 min)后取上清液. 肌肉樣本:常溫下解凍肌肉樣本,取 0.1 g肌肉組織剪碎于離心管中,加入 500 IxL抽提緩沖液和5 L pK,55℃水浴4 h,離心(9 000 r/min,10rain)后取上清液.

在上述處理過的樣本中加入等體積的飽和苯酚溶液,混勻(500 r/rain,15 rain),離心(9 000r/min,15 min),取上清液;之后,加入等體積的氯仿-異戊醇(體積比24:1),混勻(500 r/min,15min),離心(9 000 r/min,15 min),取上清液并加入 2.5倍體積的預(yù)冷的無水乙醇,置于 一20℃冰箱沉淀 DNA 2 h或以上;棄上清液后用70%乙醇液洗滌 DNA,真空干燥,加入 100 L TE(0.01moVL Tris—HC1,0.1 mol/L EDTA)溶解 DNA,于一20℃保存.

1.2.2 DNA的檢測(cè)

選擇線粒體 16S rRNA和核 DNA的微衛(wèi)星位點(diǎn)引物 Hrug 01進(jìn)行 PCR擴(kuò)增反應(yīng),以檢驗(yàn) DNA在遺傳分析中的可用性.PCR反應(yīng)體系為 25 含2 mmoL/L或 1.5 mmo~L MgC12,0.15 mmol/L三磷酸脫氧核糖核苷,0.06 mmo~L引物,0.75 UTaq聚合酶,模板 DNA 50 ng,10 mmoVL TrisHCI,50 mmoVL KC1,雙蒸水補(bǔ)足到 25 L.反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性4 min;95 變性30 s,55 oC或50℃退火 30 s,72℃延伸 40 s,循環(huán) 35次;72℃再延伸 10 min.?dāng)U增產(chǎn)物在溴化乙錠染色的1%瓊脂糖凝膠中電泳,紫外燈下觀察電泳結(jié)果.

2 結(jié)果

對(duì)所提取的DNA和 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物使用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果顯示:從血液和趾提取的DNA含量與從肌肉提取的 DNA含量相當(dāng),均能獲得較高的 DNA產(chǎn)量(見圖 1).此外,使用 3種樣本進(jìn)行 16S rRNA和微衛(wèi)星 PCR擴(kuò)增均能獲得明顯的擴(kuò)增產(chǎn)物,產(chǎn)物條帶晰,產(chǎn)量高,能夠很好地滿足遺傳學(xué)分析(見圖2和圖3).

3 討論

3.1 血液樣本的提取及保存

本文采用活體心臟采血,能夠較好地從動(dòng)物體內(nèi)采集到新鮮血液,采血量僅為 50 L.由于動(dòng)物體內(nèi)的血液含量約占身體質(zhì)量的5% ~8%,所以對(duì)于任何一只大于50 g的個(gè)體,采集 5O L血液不會(huì)對(duì)動(dòng)物體產(chǎn)生較大的傷害.此外,本實(shí)驗(yàn)選擇酸性檸檬酸葡萄糖溶液 B(ACD)作為血液的抗凝劑,是由于經(jīng) B(ACD)抗凝后的血液在 DNA的提取和 PCR擴(kuò)增中均無明顯的影響.而以肝素抗凝則會(huì)對(duì)后期的 DNA提取以及 PCR擴(kuò)增產(chǎn)生一定程度 的抑制作用;以 EDTA抗凝則會(huì)使樣本DNA出現(xiàn)降解 .使用血液中的 DNA作為模板的不足之處,在于血液的保存時(shí)間不能太長,時(shí)間過長會(huì)造成 DNA的降解.在 一85℃的條件下保存,保存期限不能超過 3個(gè)月;在 一70℃下保存 ,保存期限則不超過 2個(gè)月 .另外,為了在實(shí)驗(yàn)時(shí)獲得較好的液體狀態(tài)的血液,還應(yīng)該在凍存前對(duì)經(jīng) B(ACD)抗凝的血樣以體積10:1加入細(xì)胞裂解液 .

3.2 趾樣本的提取及保存

剪趾法目前在國外廣泛地應(yīng)用于無尾兩棲類的研究中.采用剪趾法對(duì)所采集的動(dòng)物個(gè)體進(jìn)行標(biāo)記,并將剪下的趾浸泡到乙醇液中保存,不僅可以通過趾提取 DNA進(jìn)行遺傳分析,同時(shí)還可以將標(biāo)記過的個(gè)體進(jìn)行標(biāo)志重捕,進(jìn)而研究物種的種群生態(tài)學(xué)問題.此外,從本實(shí)驗(yàn)結(jié)果來看,使用趾提取的DNA是完全可以滿足遺傳分析需要的.使用乙醇液浸泡趾組織的優(yōu)點(diǎn)在于:乙醇液浸泡會(huì)使蛋白質(zhì)變性,從而達(dá)到防腐的目的;與此同時(shí),動(dòng)物體內(nèi)的DNA酶也會(huì)喪失活性,從而能夠較好地保存 DNA;其次,使用乙醇液保存樣本,對(duì)樣本的影響比較小,保存期限比較長,完全能夠滿足在較長一段時(shí)間里的 DNA提取和對(duì)該物種的遺傳分析。

3.3 取樣方法比較

在無尾兩棲類分子遺傳學(xué)的研究中,剪趾法在國外被廣泛地應(yīng)用于相關(guān)研究中,而使用血液為樣本提取 DNA研究無尾兩棲類的分子遺傳學(xué)還未見報(bào)道,本文是對(duì)該方法的一次探討和嘗試.從兩棲類動(dòng)物的體內(nèi)抽取血液能夠獲得高質(zhì)量的 DNA,但由于在取樣過程中需要使用無菌注射器以及一個(gè)相對(duì)沒有污染的環(huán)境,并且血樣的保存時(shí)間有限,而且由于活體心臟取血技術(shù)有一定的難度,取血的過程也需要耗費(fèi)一定的時(shí)間,所以在野外對(duì)無尾兩棲類的大量取樣中使用血液作為樣本并不是一個(gè)首選的方法,但在僅取少量樣本做快速分析時(shí)則是一個(gè)比較好的取樣方法.使用剪趾法獲得的趾樣本,不僅保存方便,保存時(shí)間長,并且所需的試劑和工具相對(duì)簡單,取樣過程方便快捷,其 DNA產(chǎn)量也高,能很好地滿足分子遺學(xué)的分析,因而剪趾取樣應(yīng)該是野外采樣中的首選方法.通過血液和趾 DNA與肌肉 DNA的比較分析,筆者認(rèn)為對(duì)無尾兩棲類完全可以用非傷害性取樣替代原來的肌肉取樣.

參考文獻(xiàn):

[1]Taberlet P,Waits L P,Luikart G.Noninvasive genetic sampling:look before you leap[J].Trends in Ecol and Evol,1999,14(8):323.327.

[2]Morin P A,Woodruff D S.Noninvasive genotyping for vertebrate conservation[M]//Smith T B,Wayne R K.Molecular Genetic Approaches iConservation.New York:Oxford University PlCSS,1996:293-313.

[3]Kats L B,F(xiàn)errerR P.Alien predators and amphibian declines:review oftwo decades of science andthetransitionto conservation[J].Diversitand Distributions,2003,9(2):99—110.

[4]Blaustein A R,Romansic J M,Kieseeker J M,et a1.Ultraviolet radiation,toxic chemicals and amphibian population declines[J].Diversity anDistributions,2003,9(2):123—140.

[5]Daszak P,Cunningham A A,Hyatt A D.Infectious disease and amphibian population declines[J].Diversity and Distributions,2003,9(2)141—150.

[6]Carey C,Alexander M.Climate change and amphibian declines:is there a link?[J].Diversity and Distributions,2003,9(2):111-121.

[7]Su Xia,Wu Xiaobing,Yan Peng,et a1.Rearrangement of a mitochondrial tRNA gene of the concave—eared torrent frog,Amolops tormotus[J]Gene,2007,394(1/2):25-34.

[8]楊玉慧,張德興,李義明,等.中國黑斑蛙種群的線粒體 DNA多樣性和生物地理演化過程的初探[J].動(dòng)物學(xué)報(bào),2004,50(2):193201.

[9]張際峰,聶劉旺,彭巧玲,等.從線粒體基因探討中國大頭蛙群的分類及其屬內(nèi)地位[J].動(dòng)物學(xué)報(bào),2005,51(2):354-359.

[10]Sambrook J,F(xiàn)ritsch E F,Maniatis T.Molecular Cloning:A Laboratory Manual[M].2nd ed.New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press1989:465-467.

[11]魯云風(fēng),文禎中,原國輝,等.3種血液抗凝劑的抗凝效果及對(duì) RAPD反應(yīng)影響的研究[J].南陽師范學(xué)院學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2004,3(12):55-57.

[12]蘇光華,張?jiān)S,肖兵南,等.奶牛血液保存條件和DNA提取方法的優(yōu)化[J].中國奶牛,2007(5):7-9.

[13]陳啟龍,聶劉旺,程雙懷.福爾馬林保存的龜鱉動(dòng)物基因組 DNA的提取方法[J].黃山學(xué)院學(xué)報(bào),2004,6(6):91-92.

第9篇:遺傳學(xué)的研究對(duì)象范文

關(guān)鍵詞:基因 基因概念 歷史淵源

中圖分類號(hào):Q3 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1672-3791(2012)08(b)-0234-03

遺傳學(xué)是研究生物起源,基因和基因組結(jié)構(gòu)、功能及其演變規(guī)律的學(xué)科,而基因的研究對(duì)促進(jìn)遺傳學(xué)發(fā)展具有重要意義。自20世紀(jì)開始以來,基因的發(fā)展經(jīng)歷了理論水平、細(xì)胞水平的遺傳學(xué)階段和分子水平上的遺傳學(xué)階段,在前人大量實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,人們對(duì)基因的認(rèn)識(shí)不斷深入,特別是隨著人類基因組計(jì)劃和“DNA元件百科全書”計(jì)劃(Encyclopedia of DNA Elements, ENCODE)的完成,人們對(duì)基因的認(rèn)識(shí)又有了新的變化,并將遺傳學(xué)中基因的概念和理論應(yīng)用到了計(jì)算機(jī)、商業(yè)和信息技術(shù)等領(lǐng)域。

如今的21世紀(jì),隨著學(xué)科交叉研究的發(fā)展,一些科學(xué)研究者開始利用物理化學(xué)工具來研究核酸結(jié)構(gòu),從分子水平上闡述遺傳現(xiàn)象背后的化學(xué)本質(zhì)。本文結(jié)合大量文獻(xiàn)綜述了基因的發(fā)展歷程以及現(xiàn)階段物理化學(xué)方法在遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用,并展望了量子化學(xué)理論在遺傳學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用前景。

1 基因概念的歷史淵源

19世紀(jì),由于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)發(fā)展的需要,人們開始重視動(dòng)植物的遺傳變異現(xiàn)象并對(duì)這些現(xiàn)象進(jìn)行了系統(tǒng)研究,這為基因概念的產(chǎn)生創(chuàng)造了條件。1868年,Darwin C.受Hippocrates和Anaxagoras的生源說影響提出了泛生論的假說,認(rèn)為生物體的細(xì)胞能產(chǎn)生自我繁殖的微粒,這些微??梢詤R聚于生殖細(xì)胞并決定后代的遺傳性狀,這種觀點(diǎn)缺乏實(shí)驗(yàn)論證,不過它充分肯定了生物體內(nèi)部存在特殊的物質(zhì)負(fù)責(zé)遺傳性狀的傳遞。之后,Weismann A.又在前人基礎(chǔ)上提出了種質(zhì)論(Germpiasm),認(rèn)為種質(zhì)是生物體的遺傳物質(zhì),它可能作為遺傳單位存在于染色體上,這對(duì)基因概念的形成奠定了理論基礎(chǔ)[1]。

2 基因的研究發(fā)展

2.1 基因概念的提出

在前人的遺傳學(xué)理論研究基礎(chǔ)上,Mendel G.J.第一個(gè)對(duì)遺傳現(xiàn)象做了系統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)研究。通過豌豆雜交實(shí)驗(yàn),他認(rèn)為生物性狀是由“遺傳因子”來控制的,這些遺傳現(xiàn)象符合分離定律和自由組合定律。之后,Devries H、Correns C.和Tschermak E.分別證實(shí)了孟德爾的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,到1909年,丹麥的Johannsen W.L.首次用“基因”一詞表示遺傳因子。不過,當(dāng)時(shí)的遺傳因子沒有涉及到基因的具體物質(zhì)概念,只是一個(gè)經(jīng)過統(tǒng)計(jì)學(xué)分析的理論概念。

2.2 基因?qū)W說的創(chuàng)立

Mendel的遺傳因子學(xué)說是宏觀水平上的發(fā)現(xiàn),其所提出的遺傳因子到底是否存在于細(xì)胞中需要進(jìn)行細(xì)胞水平上的研究。隨著當(dāng)時(shí)工業(yè)生產(chǎn)的發(fā)展,用以研究生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的儀器設(shè)備有了極大的改進(jìn)。20世紀(jì)初,Boveri T.[2]和Sutton W.S.[3]各自在研究減數(shù)分裂時(shí),發(fā)現(xiàn)遺傳因子的行為與染色體行為呈平行關(guān)系,提出了基因就在染色體上的假說。然后,1910年,Morgan T. H.等[4]用果蠅作材料,進(jìn)行了一系列雜交實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)了伴性遺傳現(xiàn)象和基因連鎖互換定律,直接證實(shí)了基因在染色體上,建立了染色體遺傳理論。1926年,Morgan T.H.正式提出了基因?qū)W說,即“三位一體”的基因概念,基因首先是決定性狀的功能單位,能控制蛋白質(zhì)的表達(dá),決定一定的表型效應(yīng);其次是一個(gè)突變單位,可以發(fā)生在等位基因之間,表現(xiàn)出變異類型;最后它是一個(gè)重組單位,只發(fā)生在基因之間,可以產(chǎn)生與親本不同的基因型[5]。這把染色體和基因聯(lián)系了起來,說明了基因具有物質(zhì)性,不過,Morgan在其著作中并沒有涉及基因的本質(zhì)是什么以及基因的功能是如何發(fā)揮等問題。

2.3 基因化學(xué)本質(zhì)的研究

對(duì)于基因的化學(xué)本質(zhì)和功能等問題,早在1909年,英國Garrod A.E.就提出過基因產(chǎn)生酶的觀點(diǎn)。之后,1941年斯坦福大學(xué)Beadle G.和Tatum E.[6]在研究真菌過程中,提出了“一個(gè)基因一個(gè)酶”的假說,認(rèn)為一個(gè)基因控制一個(gè)酶的合成,基因通過酶控制生物的代謝途徑,這從生物化學(xué)角度闡述了基因的功能,不過這種基因的概念仍然沒有揭示基因的化學(xué)本質(zhì),只是解釋了基因發(fā)揮功能的途徑。到1944,Avery等通過肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)證明了遺傳物質(zhì)的化學(xué)本質(zhì)是DNA,然后,1956年,美國的Fraenkel又通過煙草花葉病毒實(shí)驗(yàn)證明了RNA也可以作為遺傳物質(zhì)進(jìn)行傳遞[7]。

2.4 基因功能的研究

1953年,Watson J.D.和Crick F.H.C.[8]提出了DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu),人們開始從分子水平上認(rèn)識(shí)基因的本質(zhì),即基因是DNA分子中含有特定遺傳信息的一段核苷酸序列,是遺傳物質(zhì)的最小功能單位[9],從此以后,人們對(duì)基因功能的認(rèn)識(shí)開始有了深入的了解。1955年,Benzer S.[10]通過T4噬菌體感染大腸桿菌的互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)提出了順反子學(xué)說,認(rèn)為基因就是順反子,即一個(gè)遺傳功能單位,一個(gè)順反子決定一條多肽鏈,它并不是一個(gè)突變單位和交換單位。一個(gè)順反子可以包含一系列突變子,突變子是DNA中構(gòu)成的一個(gè)或若干個(gè)核苷酸,由于基因內(nèi)的各個(gè)突變子之間有一定距離,所以突變子彼此之間能發(fā)生重組,重組頻率與突變子之間的距離成正比[11]。

20世紀(jì)60年代之前,人們已經(jīng)認(rèn)識(shí)到基因是有著精細(xì)結(jié)構(gòu)的DNA分子,其結(jié)構(gòu)可以繼續(xù)分割,不過,當(dāng)時(shí)對(duì)于基因功能表達(dá)及其具體作用等問題的研究依然局限于傳統(tǒng)的“一個(gè)基因一個(gè)酶”的學(xué)說。1961年,法國遺傳學(xué)家Jacob F.和Monod J.L.[12]根據(jù)對(duì)大腸桿菌的試驗(yàn),提出了大腸桿菌操縱子模型,認(rèn)為DNA的不同區(qū)域存在一個(gè)調(diào)節(jié)基因和一個(gè)操縱子,操縱子模型包括若干結(jié)構(gòu)基因、操縱基因和啟動(dòng)基因。這一模型進(jìn)一步說明了基因是可分的,通過基因間的密切協(xié)作,細(xì)胞才能表現(xiàn)出獨(dú)特的功能[13]。此后,隨著DNA重組技術(shù)和DNA測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,人們對(duì)基因的研究更加深入,發(fā)現(xiàn)了許多基因的其他功能和特點(diǎn),極大地完善了人們對(duì)生物體各種遺傳現(xiàn)象的認(rèn)識(shí)。

2.5 基因概念的新發(fā)展

20世紀(jì)70年代以后,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展,人們對(duì)基因的結(jié)構(gòu)和功能上的特征有了更多的認(rèn)識(shí),其中比較重要的發(fā)現(xiàn)有假基因、重疊基因、跳躍基因、斷裂基因、反轉(zhuǎn)錄基因、印記基因等。結(jié)合基因的這些新發(fā)現(xiàn),現(xiàn)今人們認(rèn)識(shí)基因有以下幾種特點(diǎn)[5]:(1)基因不都是離散的,因?yàn)橛兄丿B基因;(2)基因不一定是連續(xù)的,如斷裂基因;(3)基因可以移動(dòng),其位置可以改變,如跳躍基因;(4)基因不是全能的結(jié)構(gòu)單位,有很多順式作用元件影響轉(zhuǎn)錄或剪接;(5)基因也不是簡單的功能單位,因?yàn)榛蚩梢酝ㄟ^順式或反式剪接,產(chǎn)生多種蛋白質(zhì)。那么,到底應(yīng)該怎樣給一個(gè)基因準(zhǔn)確定義呢?近年來,有很多人對(duì)此提出了看法。

Gerstein等[14]提出,基因的定義應(yīng)該和原來的定義有兼容,建立在已有的生物術(shù)語基礎(chǔ)之上。他們認(rèn)為,基因是基因組序列的聯(lián)合體,這些序列可以編碼具有潛在重疊功能的產(chǎn)品(蛋白質(zhì)或RNA),基因與其調(diào)節(jié)序列是多對(duì)多關(guān)系。在此基礎(chǔ)上,Pesole[15]則認(rèn)為基因是一個(gè)離散的基因組區(qū)域,其轉(zhuǎn)錄可以被一個(gè)或多個(gè)啟動(dòng)子和遠(yuǎn)端調(diào)節(jié)成分調(diào)控,并含有合成功能蛋白質(zhì)或非編碼RNA的信息?;蛟谧罱K功能產(chǎn)物上有共同性質(zhì),這個(gè)定義主要針對(duì)真核生物基因組,強(qiáng)調(diào)每個(gè)基因都分布于基因組的連續(xù)區(qū)域,基因序列包含5′UTR和3′UTR。此外,還有學(xué)者從計(jì)算機(jī)角度對(duì)基因的定義做了描述,他們把基因組比喻為一個(gè)生命體的大的操作系統(tǒng),而基因就是其中的一個(gè)子程序??傊?,隨著當(dāng)今科技水平的發(fā)展,人們通過對(duì)DNA、RNA和蛋白質(zhì)新功能的研究,發(fā)現(xiàn)基因并不是以前想得那么簡單,其概念、功能和特征是隨著一些特殊的生命遺傳現(xiàn)象可以改變的。

如阮病毒的發(fā)現(xiàn),朊病毒是一種只有蛋白質(zhì)而沒有核酸的病毒,就之前生物學(xué)家對(duì)基因的概念而言,朊病毒的復(fù)制并非以核酸為模板,而是以蛋白質(zhì)為模板,這又重現(xiàn)了20世紀(jì)遺傳物質(zhì)本質(zhì)問題的爭議,是現(xiàn)階段基因概念的新挑戰(zhàn)。此外,2006年,《自然》雜志在New Feature欄目上刊登了“什么是基因?”一文,這篇文章結(jié)合最近的研究成果對(duì)基因的概念做了新的詮釋,一些研究發(fā)現(xiàn),RNA不是被動(dòng)的將基因信息傳遞下去,而是主動(dòng)地調(diào)控細(xì)胞的活動(dòng),有的RNA鏈不是傳統(tǒng)認(rèn)為的只由DNA的一條鏈轉(zhuǎn)錄,而是由兩條鏈轉(zhuǎn)錄得來,還有一些RNA可以通過某種途徑使正?;虺聊?,在必要時(shí)還會(huì)作為模板糾正某些異?;?,跨世代地?cái)y帶生物體遺傳信息[16]。這些研究發(fā)現(xiàn)加深了我們對(duì)RNA的認(rèn)識(shí),深化了我們對(duì)生物體遺傳現(xiàn)象的了解。又20世紀(jì)90年代,美籍華人牛滿江教授又發(fā)現(xiàn)了“外基因”,即一些生物體細(xì)胞質(zhì)中mtRNA能激活一些特定基因,使生物體表達(dá)特定的蛋白質(zhì),還有,2008年《自然》雜志上報(bào)告,美國科學(xué)家確認(rèn)了一種可導(dǎo)致乳腺癌轉(zhuǎn)移的超級(jí)基因,這種基因可控制腫瘤細(xì)胞中其他基因的表達(dá),它的表達(dá)與癌癥發(fā)生有密切的聯(lián)系[17]。

總之,隨著科學(xué)的不斷發(fā)展,人們對(duì)于生物遺傳現(xiàn)象的認(rèn)識(shí)越來越深入,基因的概念也隨著生物學(xué)的發(fā)展不斷變化和完善。由于其他非生命領(lǐng)域的研究對(duì)象顯示出了生命力及與生物基因相似的特征,現(xiàn)今,經(jīng)濟(jì)領(lǐng)域和計(jì)算機(jī)領(lǐng)域中又出現(xiàn)了企業(yè)基因[18]、產(chǎn)品基因[19]、數(shù)據(jù)基因[20]等新的定義,基因概念的基本理論已經(jīng)發(fā)展到更多學(xué)科中了,對(duì)基因本質(zhì)和特征的研究越來越有必要。

3 量子化學(xué)作為研究核酸方法的應(yīng)用

當(dāng)前,遺傳學(xué)的研究已經(jīng)發(fā)展到了分子水平,然而對(duì)于生物遺傳現(xiàn)象中一些酶、核酸、激素等活性物質(zhì)的構(gòu)象、生物活性和其具體作用機(jī)制依然存在爭議。生物系統(tǒng)研究的最大難題是生物分子的復(fù)雜性,常規(guī)的實(shí)驗(yàn)方法只能得到實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象的宏觀方面解釋,而不能從微觀方面對(duì)實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象的化學(xué)本質(zhì)做出解釋。目前有一些研究者將物理化學(xué)方法應(yīng)用到了生命科學(xué)領(lǐng)域,建立了從理論分析到實(shí)驗(yàn)優(yōu)化的方法模式,他們根據(jù)實(shí)際體系在計(jì)算機(jī)上進(jìn)行實(shí)驗(yàn),通過比較模擬結(jié)果和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)檢驗(yàn)理論模型的準(zhǔn)確性,并在此基礎(chǔ)上模擬生物大分子的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和反應(yīng)過程。

隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)和物理化學(xué)理論的發(fā)展,以及X射線、NMR等技術(shù)的應(yīng)用,人們可以利用一些物理化學(xué)工具在計(jì)算機(jī)上進(jìn)行分子模擬,以此來模擬DNA、RNA和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)與核酸的功能和性質(zhì)。而且,隨著計(jì)算方法的改進(jìn),高度變化的核酸體系的精確分子模擬已成為可能,依賴強(qiáng)大的計(jì)算機(jī)就能模擬一些更復(fù)雜的反應(yīng),如DNA、RNA和蛋白質(zhì)的催化及折疊等[21]。

其中應(yīng)用比較廣泛的物理化學(xué)工具就是量子化學(xué)方法,量子化學(xué)方法是應(yīng)用量子化學(xué)基本原理和方法來研究化學(xué)體系的結(jié)構(gòu)和化學(xué)反應(yīng)性能的科學(xué),其基本理論主要有價(jià)鍵理論(VB)、分子軌道理論(MO)、密度泛函理論(DFT),基本的計(jì)算方法有從頭算方法(ab initio)、半經(jīng)驗(yàn)方法(semi-empirical method)、密度泛函方法(Density Functional Theory)[22]。量子化學(xué)的原理和方法在物理化學(xué)、藥學(xué)計(jì)算和生命科學(xué)領(lǐng)域有廣泛的應(yīng)用,可以很好地分析分子間相互作用的機(jī)理,解釋實(shí)驗(yàn)中一些宏觀現(xiàn)象的物理化學(xué)本質(zhì)。如李梅杰[23]利用量子化學(xué)方法中的高精度組合從頭算方法(ONIOM-G3B3)研究了核酸自由基性質(zhì)和損傷機(jī)理,很好地解釋了生命過程中由于自由基和電子轉(zhuǎn)移導(dǎo)致DNA的斷鏈損傷而引起的衰老、癌癥、神經(jīng)紊亂等疾病的發(fā)生。又如2002年,Starikov E.B.[24]總結(jié)了核酸中量子化學(xué)方法的應(yīng)用,闡述了核酸中電荷轉(zhuǎn)移過程的量子化學(xué)描述及其化學(xué)機(jī)理,并詳細(xì)地討論了不同量子化學(xué)方法在研究核酸電子構(gòu)型中的優(yōu)缺點(diǎn)。此外,于芳[25]運(yùn)用量子化學(xué)工具對(duì)胞嘧啶與丙烯酰胺組成的分子體系進(jìn)行了計(jì)算,以此來模擬核酸與蛋白質(zhì)相互作用的反應(yīng)過程,分析了DNA與蛋白質(zhì)的作用形式。

對(duì)于利用量子化學(xué)方法研究蛋白質(zhì)的應(yīng)用,國外在這方面做得比較深入。如紐約州立大學(xué)石溪分校Simmerling C.等[26]應(yīng)用量子化學(xué)方法研究了一種小分子量蛋白質(zhì),僅有20個(gè)色氨酸構(gòu)成,準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)了蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的折疊過程。又如Berriz和Shakhnovich[27]模擬了小的三螺旋束蛋白的折疊,Daggett和Fersht[28]模擬了小的單結(jié)構(gòu)域蛋白的動(dòng)力學(xué)折疊.還有Akira Shoji等[29]采用密度泛函理論方法優(yōu)化了右手α-螺旋的PLA(聚L-丙氨酸)分子(如圖1所示,即H-Ala18-OH分子),分析了αR-螺旋的PLA形成的機(jī)制,獲得優(yōu)化的αR-螺旋H-Ala18-OH構(gòu)型外側(cè)的1H、13C、15N、17O原子的化學(xué)位移與用高分辨率固相NMR檢測(cè)的相同。

4 展望

近年來,國內(nèi)外量子化學(xué)在分子生物學(xué)中的應(yīng)用日趨廣泛,如利用量子化學(xué)方法研究納米微粒促進(jìn)靶向給藥、純化核酸以及處理廢氣等技術(shù)的發(fā)展;應(yīng)用量子化學(xué)方法優(yōu)化生物活性分子結(jié)構(gòu),研發(fā)新型抗疾病藥物;采用分子模擬的量子化學(xué)計(jì)算方法探究激素與受體以及其他活性分子與核酸的作用機(jī)理等等,很大程度上促進(jìn)了分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的發(fā)展。從目前所作的科學(xué)研究看,量子化學(xué)完全可以作為遺傳學(xué)工具來研究生物體遺傳現(xiàn)象背后的化學(xué)本質(zhì),其在遺傳學(xué)的研究中有廣闊的應(yīng)用前景。

參考文獻(xiàn)

[1] 光曉元.基因概念的歷史淵源及其歷史發(fā)展[J].安慶師范學(xué)院學(xué)報(bào),2002,8(4):95-97.

[2] Boveri T.ber mehrpolige Mitosen als Mittel zur Analyse des Zellkerns[J]. Verh Phys.Med Ges Würzburg,1902, 35:67-90.

[3] Sutton W S.The chromosomes in heredity[J].Bio Bull,1903,4:231-251.

[4] Morgan T H.Sex-limited inheritance in Drosophila[J].Science,1910,32(812):120-122.

[5] 謝兆輝.基因概念的演繹[J].遺傳,2010,32(5):449-454.

[6] Beadle G W,Tatum E L.Genetic control of biochemical reactions in neurospora[J].Proc Natl Acad Sci USA, 1941,27(11):499-506.

[7] 高汝勇.基因概念的發(fā)展歷程[J].科技風(fēng),2009(11):128-128.

[8] Watson J D,Crick H F C.A structure for deoxyribosenucleic acid[J].Nature,1953:171,737.

[9] 趙亞華.基礎(chǔ)分子生物學(xué)教程.2版.北京:科學(xué)出版社,2007,7:1-10.

[10] Benzer S.Fine structre of a genetic region in bacteriophage[J].Proc Natl Acad Sci USA,1955,41(6):344-354.

[11] 張勇.基因概念之演變[J].生物學(xué)通報(bào),2002,37(10):52,54.

[12] Jacob F,Monod J.Genetic vegulator ymechanisms in the synthesis of proteins[J].J.Mol.Biol,1961(3):318.

[13] 劉元,陳國梁,梁凱.基因概念的演變[J].延安大學(xué)學(xué)報(bào),2005,24(4):80-83.

[14] Gerstein M B,Bruce C,Rozowsky J S,et al.What is a gene,post-ENCODE?History and updated definition[J].Genome Res,2007,17(6):669-681.

[15] 施江,辛莉,郭永新,等.現(xiàn)代生物學(xué)基因研究進(jìn)展—— 從遺傳因子到超級(jí)基因(2)[J].生物學(xué)通報(bào),2009,44(4):4-7.

[16] 唐捷.基因是什么[J].生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展,2006,33(7):607-608.

[17] 歐陽芳平,徐慧,郭愛敏,等.分子模擬方法及其在分子生物學(xué)中的應(yīng)用[J].生物信息學(xué),2005(1):33-36.

[18] 許曉明,戴建華.企業(yè)基因理論的演化及其順反子系統(tǒng)新模型的構(gòu)建[J].上海管理科學(xué),2008,30(2):86-90.

[19] 楊金勇,黃克正,尚勇,等.產(chǎn)品基因研究綜述[J].機(jī)械設(shè)計(jì),2007,24(4):1-4.

[20] 奚建清,湯德佑,郭玉彬.數(shù)據(jù)基因:數(shù)據(jù)的遺傳信息載體[J].計(jì)算機(jī)工程,2006,32(17):7-9.

[21] Pesole G.What is a gene?An updated operational definition[J].Gene,2008,417(1-2):1-4.

[22] 趙艷麗,許炎,李遙潔,等.量子化學(xué)在金屬配合物中的應(yīng)用進(jìn)展[J].廣東化工,2010,37(9):75-76.

[23] 李梅杰.核酸自由基性質(zhì)和損傷機(jī)理的量子化學(xué)研究[D].合肥:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)化學(xué)與材料科學(xué)學(xué)院,2007.

[24] Starikov E B.Quantum chemistry of nucleic acids:how it could help and when it is necessary[J].Journal of Photochemistry and Photobiology C:Photochemistry Reviews,2002,3:147-164.

[25] 于芳.酰胺類化合物與DNA堿基相互作用的理論研究[M].江蘇:江南大學(xué)應(yīng)用化學(xué)系,2009.

[26] Simmerling C,Strockbine & Roitberg A E.All-atom structure prediction and folding simulations of a stable protein[J].Journal of the American Chemical Society,2002,124:11258-11259.

[27] Berriz G F,Shakhnovich E I. Characterization of the folding kinetics of three-helix bundle protein via a minimalist Langevin model[J].Journal of Molecular Biology,2001,310:673-685.

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