多中心生物樣本庫信息管理系統(tǒng)建設(shè)
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【摘要】生物樣本庫的主要功能是針對多病種、多主題、多種類、大規(guī)模的人類遺傳資源收集與保存，對樣本及其信息進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化收集，是基礎(chǔ)與臨床研究的重要基石。近10年以來，全國各個(gè)院校都在著眼于構(gòu)建多中心的生物樣本庫，并且配備了相應(yīng)的信息管理系統(tǒng)。通過施行標(biāo)準(zhǔn)信息化管理的舉措，能夠?qū)崿F(xiàn)全方位的生物樣本庫管理，達(dá)到了樣本定位準(zhǔn)確、信息實(shí)時(shí)交流的目的。在目前實(shí)踐中，有必要將信息化手段融入全過程的信息管理系統(tǒng)建設(shè)，從而達(dá)到全面建設(shè)多中心生物樣本庫的宗旨與目標(biāo)。
【關(guān)鍵詞】多中心生物樣本庫；信息管理系統(tǒng)；建設(shè)措施
1多中心生物樣本庫的基本構(gòu)架
多中心的生物樣本庫是一項(xiàng)體系化的龐大工程，具備集中部署的特征，并且包含樣本管理、樣本源管理、冰箱管理、耗材管理、安全管理及基礎(chǔ)性的服務(wù)器硬件管理等。與此同時(shí)，多中心樣本庫符合了當(dāng)前建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)化與體系化醫(yī)療服務(wù)機(jī)構(gòu)的宗旨與目標(biāo)[2]，也符合中國醫(yī)院經(jīng)過快速發(fā)展，醫(yī)院規(guī)模化、多院區(qū)發(fā)展化的現(xiàn)狀。具體在實(shí)踐中，與之相應(yīng)的管理信息系統(tǒng)涵蓋了轉(zhuǎn)化應(yīng)用層、數(shù)據(jù)資源層、訪問門戶層、平臺管理層、安全認(rèn)證體系與標(biāo)準(zhǔn)體系。在此前提下，多中心的生物樣本庫需要包括以下的基本系統(tǒng)要素：首先是系統(tǒng)管理。作為醫(yī)療機(jī)構(gòu)，妥善保護(hù)醫(yī)療數(shù)據(jù)以及醫(yī)療信息是醫(yī)院的首要職責(zé)，醫(yī)療信息涵蓋了各類醫(yī)療實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)及其相應(yīng)的臨床數(shù)據(jù)。轉(zhuǎn)化應(yīng)用管理可用于分析各類的生物樣本及其試驗(yàn)數(shù)據(jù)信息，并據(jù)此給出科學(xué)性的醫(yī)療診斷支持。在此前提下，現(xiàn)存的臨床醫(yī)療成果即可將其靈活轉(zhuǎn)變成相應(yīng)的醫(yī)療方法、醫(yī)學(xué)理論或者醫(yī)藥技術(shù)，從而搭設(shè)了病房與實(shí)驗(yàn)室之間相互溝通的渠道與橋梁[3]。其次是數(shù)據(jù)管理。醫(yī)療資源以及醫(yī)療數(shù)據(jù)形式涵蓋了采集各項(xiàng)臨床信息子系統(tǒng)、信息研究子系統(tǒng)與其他各類子系統(tǒng)。由此可見，數(shù)據(jù)管理并非單純局限于隨訪患者病例、追蹤調(diào)查問卷、處理與搜集生物樣本、開展硬件管理以及運(yùn)輸生物樣本等，還應(yīng)當(dāng)包含各類醫(yī)療信息的全方位管理與收集。第三是訪問門戶。訪問門戶的重要價(jià)值就在于確認(rèn)訪問者的基本權(quán)限，應(yīng)提供申請與注冊的流程、提供檢索或者查詢某些醫(yī)療信息的專用流程等。因此可見，訪問門戶本身包含了配套性的醫(yī)療樣本信息，并且還能實(shí)現(xiàn)協(xié)同轉(zhuǎn)化等相關(guān)的醫(yī)療項(xiàng)目操作。在此前提下，運(yùn)用訪問門戶還可達(dá)到有效連接各個(gè)區(qū)域與各個(gè)醫(yī)療機(jī)構(gòu)的目的。對于系統(tǒng)訪問者本身而言，應(yīng)當(dāng)依照特定的訪問流程及權(quán)限來訪問特定的醫(yī)療信息。
2建設(shè)管理信息系統(tǒng)的關(guān)鍵點(diǎn)
2.1管理臨床資料
根據(jù)規(guī)范化診療的宗旨與思路，醫(yī)院對院內(nèi)現(xiàn)存的臨床信息以及臨床樣本都應(yīng)納入規(guī)范化管理的范圍。通常來講，樣本臨床信息應(yīng)當(dāng)包含捐贈者的個(gè)體信息、出院與入院的相關(guān)信息、捐贈者目前所處的生活環(huán)境及其他隨訪信息等，除此之外，檢查與檢驗(yàn)信息也可看作樣本臨床信息的一部分，特別是各類影像檢查及病理檢查。由此可見，樣本臨床信息具有顯著的復(fù)雜特征，醫(yī)院有必要通過掛歷系統(tǒng)將其納入全方位的樣本管理過程中。通過信息技術(shù)的發(fā)展，醫(yī)院已經(jīng)能夠借助第三方系統(tǒng)用于實(shí)現(xiàn)上述的樣本信息管理，確保保留精準(zhǔn)的樣本信息。
2.2管理樣本信息
生物樣本庫通常都會包含各類不同的醫(yī)療樣本信息，其中主要含有樣本的有關(guān)信息、臨床樣本信息與其他類型的信息。如臨床樣本的所有者、臨床樣本的編碼、樣本的具體儲存位置、樣本保存條件信息、樣本總量與其他各類信息，醫(yī)院都應(yīng)當(dāng)將其納入樣本庫管理范疇。除此以外，樣本庫管理還應(yīng)延伸至更廣的管理視角與管理范圍，確保運(yùn)用實(shí)時(shí)追蹤的方式來開展綜合性的樣本庫管理。
2.3依照相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范來開展信息系統(tǒng)建設(shè)
經(jīng)過十幾年的高速發(fā)展，各地醫(yī)療院所都致力于建設(shè)醫(yī)療信息化，該措施不能缺少與之有關(guān)的系統(tǒng)建設(shè)基本規(guī)范。在此前提下，醫(yī)院生物樣本庫管理系統(tǒng)的重要特點(diǎn)是確保樣本庫各項(xiàng)運(yùn)行步驟符合特地那個(gè)的流程及規(guī)范，達(dá)到保證樣本質(zhì)量，及時(shí)信息搜集、明確捐贈者選擇、確保知情同意的簽署等。唯有如此，醫(yī)院才能確保建成符合相關(guān)指標(biāo)的數(shù)字化樣本庫。
3探析具體技術(shù)運(yùn)用
從本質(zhì)上講，生物樣本庫能夠用于容納多種多樣的綜合數(shù)據(jù)資源，其中包含各類的生物分子信息、實(shí)體的生物樣本、表型數(shù)據(jù)、組學(xué)數(shù)據(jù)與其他相關(guān)數(shù)據(jù)或者信息。在此前提下，運(yùn)用多中心樣本庫應(yīng)達(dá)到全方位的采集生物樣本及臨床信息，從而達(dá)到診斷疾病與防控疾病目的，進(jìn)而體現(xiàn)為不可忽視的臨床與科研重要價(jià)值。在目前的建設(shè)階段中，建設(shè)生物樣本庫的手段與措施日益趨向于網(wǎng)絡(luò)化與多中心化，而不再局限于單中心的傳統(tǒng)建設(shè)模式。與此同時(shí)，多中心樣本庫還能用于管理并且收集不同類型、不同疾病的各類樣本資源，并且輔助實(shí)現(xiàn)綜合性的規(guī)劃管理目的。對于各地醫(yī)院之間的科研協(xié)作來講，通過調(diào)用多中心的樣本庫信息能夠達(dá)到實(shí)時(shí)性的醫(yī)療信息共享。這是由于，生物樣本庫本身包含了多樣化的醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)流程，并且包含團(tuán)隊(duì)收集或者個(gè)人收集的所有生物信息樣本。在此前提下，運(yùn)用上述的中心樣本庫即可協(xié)助各地醫(yī)院共同致力于某個(gè)醫(yī)學(xué)課題的全面研發(fā)。由此可見，醫(yī)院信息管理系統(tǒng)有必要運(yùn)用于全過程的生物樣本庫操作過程中。在此基礎(chǔ)上，醫(yī)院內(nèi)部設(shè)置的生物樣本庫可形成完整程度較高的醫(yī)療領(lǐng)域產(chǎn)業(yè)鏈。運(yùn)用信息化手段來輔助完成生物樣本庫的全方位建設(shè)，還能實(shí)現(xiàn)綜合性的醫(yī)療成果轉(zhuǎn)化，從而做到了緊密銜接科研領(lǐng)域、臨床醫(yī)療領(lǐng)域、生物制藥領(lǐng)域與其他相關(guān)領(lǐng)域。
4結(jié)論
近些年以來，多中心的生物樣本庫正在陸續(xù)予以建成。與此同時(shí)，信息管理系統(tǒng)也要將其靈活運(yùn)用于現(xiàn)階段的樣本庫建設(shè)。截至目前，信息化手段已經(jīng)能適用于各地全面建成生物樣本庫的進(jìn)程中，而與之有關(guān)的樣本庫建設(shè)模式也體現(xiàn)為多樣性。因此在該領(lǐng)域的具體實(shí)踐中，信息管理系統(tǒng)應(yīng)當(dāng)其緊密結(jié)合于當(dāng)前的樣本庫建設(shè)過程，從而確保達(dá)到優(yōu)化生物樣本庫建設(shè)的目的，并據(jù)此推進(jìn)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的全面發(fā)展。
參考文獻(xiàn)
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作者：郭義雄 張妍樂 李唯 何梅 周斌 單位：四川大學(xué)華西第二醫(yī)院出生缺陷與相關(guān)婦兒疾病教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室