基因組學(xué)發(fā)展精選(九篇)

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第1篇：基因組學(xué)發(fā)展范文

在提倡各民族和諧共處的今天，多元文化聚集的高校中不同民族學(xué)生間保持和諧的人際關(guān)系顯得尤為重要。本研究選取的延邊大學(xué)是一所具有鮮明民族特色的綜合性大學(xué)，不同于內(nèi)地的民族分布刺激著大學(xué)生的生活，增加他們?nèi)穗H交往機(jī)會的同時(shí)也使他們面臨著更多的人際沖突。民族身份、文化傳統(tǒng)等的差異，特殊的家庭人際關(guān)系網(wǎng)構(gòu)成朝漢大學(xué)生人際沖突的重要原因，形成了與一般高校的鮮明對比，也是大學(xué)生族際沖突的一種折射與縮影。因此，本文借探究朝漢大學(xué)生人際沖突的影響因素，以幫助朝漢大學(xué)生增強(qiáng)心理適應(yīng)能力，提高大學(xué)素質(zhì)教育質(zhì)量，加強(qiáng)各民族文化共生共享，補(bǔ)充朝漢大學(xué)生人際沖突解決辦法的理論建議。

一 大學(xué)生人際沖突的影響因素的研究

對于人際沖突的定義，國內(nèi)外學(xué)者并無統(tǒng)一意見。在此，我們認(rèn)為人際沖突是一種廣泛存在的社會現(xiàn)象，是人際關(guān)系中的一種對立行為，表現(xiàn)為人際關(guān)系雙方之間的緊張和對抗，包括互相不理解、不信任、懷疑、敵意和對抗。人際沖突的雙方都有的主觀感受會產(chǎn)生帶有主觀體驗(yàn)的沖突行為，常表現(xiàn)為人與人之間排斥、敵視和侵犯。

1.大學(xué)生人際沖突的影響因素

人際沖突的過程是一個(gè)動(dòng)態(tài)、不斷改變的歷程，也是客觀存在的，是人際互動(dòng)過程中不可避免的現(xiàn)象。本文所探究的朝漢大學(xué)生人際沖突是指朝鮮族大學(xué)生和漢族大學(xué)生之間由于差異、被侵犯、個(gè)性、溝通方面的不協(xié)調(diào)所引發(fā)的交往緊張狀態(tài)和對抗過程。

第一，人際交往中氣質(zhì)、個(gè)性的差異常使人產(chǎn)生不愉快的感覺，當(dāng)代青年“自我為中心”的特征也嚴(yán)重阻礙了人際交往，誘發(fā)沖突。研究表明，在個(gè)性和性格中存在心理偏差或者人格障礙的人更容易產(chǎn)生人際沖突。第二，對溝通技巧知之甚少的大學(xué)生不敢、不愿、不懂、不善溝通，因此而產(chǎn)生的溝通障礙時(shí)有發(fā)生。受電子科技的影響，沉迷于虛擬世界的“宅男、宅女”面對面的交流越發(fā)困難，使得雙方想法被壓抑、溝通質(zhì)量欠佳。而且，在跨民族溝通中，由相異語言造成的溝通障礙也成為影響跨民族人際沖突的重要因素。第三，在校內(nèi)外有限資源的分配上因競爭而產(chǎn)生的利益爭奪也是誘發(fā)因素之一。為了這些無法增加的資源，雙方一旦成為競爭者，沖突就在所難免，難以調(diào)和。第四，由習(xí)慣、認(rèn)知的差異，民族間宗教、文化傳統(tǒng)的差異帶來的人際沖突也占據(jù)了一定的分量。如果成員彼此行為模式差異過大，就會產(chǎn)生不理解、拒絕的現(xiàn)象，形成一種主觀體驗(yàn)的對立行為，即沖突。

2.大學(xué)生人際沖突的應(yīng)對方式及效果

托馬斯提出回避、強(qiáng)迫、遷就、合作、折中方式五種應(yīng)對人際沖突的策略。而中國大學(xué)生多采用“合作、折中”“遷就、回避”和“抗?fàn)帯辈呗裕{(diào)解能力并不強(qiáng)，這與大學(xué)生人際交往區(qū)域限制、缺乏人際沖突調(diào)解的訓(xùn)練與實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)有關(guān)。

二 研究對象、方法與過程

1.研究對象

本研究采取分層抽樣方式對延邊大學(xué)535名被試進(jìn)行問卷調(diào)查，通過專業(yè)、年級、性別、民族、是否為獨(dú)生子女和地域來劃分。實(shí)發(fā)問卷535份，回收492份，回收率91.96%，有效問卷456份，有效率92.68%。所有被試均未接受過系統(tǒng)的相關(guān)測驗(yàn)。

本研究被試頻率分布如下：以專業(yè)分，人文社科類121人（26.5%），理工農(nóng)醫(yī)類111人（24.3%），語言類111人（24.3%），體育藝術(shù)類113人（24.8%）；以年級分，2011級153人（33.6%），2012級171人（37.5%），2013級132人（28.9%）；以性別分，男性168人（36.8%），女性288人（63.2%）；以民族分，朝鮮族235人（51.5%），漢族204人（44.7%），其他民族17人（3.7%）；以是否為獨(dú)生子女分，獨(dú)生子女317人（69.5%），非獨(dú)生子女139人（30.5%）；以地域分，來自城市237人（52.0%），來自縣城118人（25.9%），來自農(nóng)村101人（22.1%）。

2.研究工具

第一，本研究使用自編的朝漢大學(xué)生人際沖突來源問卷，采用5點(diǎn)計(jì)分法，包含差異、被侵犯、溝通、個(gè)性4項(xiàng)因素。

第二，數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)使用SPSS17.0。

三 研究結(jié)果與分析

1.朝漢大學(xué)生人際沖突影響因素的因子分析

對問卷進(jìn)行因子分析，最終生成差異、被侵犯、個(gè)性、溝通4個(gè)因子。（1）差異：由于在語言、習(xí)慣、行為上存在差異，或由認(rèn)知差異而引發(fā)的沖突。（2）被侵犯：為保護(hù)被侵犯的權(quán)益或精神、物質(zhì)而引發(fā)的沖突。（3）個(gè)性：由于個(gè)性、信仰不同產(chǎn)生的不包容所引起的人際沖突。（4）溝通：由溝通渠道不暢、信息交流不夠或被曲解引起的不信任、不尊重的人際沖突。

2.朝漢大學(xué)生人際沖突來源問卷結(jié)果分析與討論

第一，描述性統(tǒng)計(jì)結(jié)果與討論。

總體上看，朝漢大學(xué)生人際沖突處于輕度狀態(tài)（見表1）。作為具備知識、技能和思想道德修養(yǎng)較高的當(dāng)代大學(xué)生，多數(shù)能保持良好的交際自控力。大學(xué)生的主流群體“90后”在個(gè)性上有一定共性，彼此了解并認(rèn)同。但處于以自我同一性的形成、更為成熟的人際關(guān)系以及向成人角色的過渡為標(biāo)志的青年中期的他們，突然從備受保護(hù)的客觀環(huán)境進(jìn)入大學(xué)，對各種人際關(guān)系的分析、判斷，受到不成熟社會性的制約使他們找不到有效的途徑，因而產(chǎn)生人際矛盾，但礙于道德的約束，他們傾向于將矛盾淡化，盡力控制人際沖突的發(fā)生。

此外，4項(xiàng)因素極大值均接近5，大學(xué)生中也存在個(gè)別較嚴(yán)重的沖突。進(jìn)入大學(xué)后，他們在專心考慮、探索、確立自我的過程中，少數(shù)處于彌散型狀態(tài)的人在自我同一性確立上不能獲得共享的同一性從而無法滿意地融入社會、恰當(dāng)?shù)靥幚砣穗H關(guān)系，加上自控力的缺乏，易產(chǎn)生極端行為。

相較而言，被侵犯的均值最高（M=2.542）。當(dāng)代大學(xué)生多為獨(dú)生子女，習(xí)慣唯我獨(dú)尊，認(rèn)為所有人都應(yīng)承認(rèn)、支持、接納自己，在交往過程中稍有不滿意就會覺得被侵犯或侵犯他人，這種以自我為中心的特征恰是大學(xué)生人際沖突的癥結(jié)所在。

第二，人口統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。

一是不同專業(yè)、年級、地域的差異分析結(jié)果與討論。通過單因素方差分 析（見表2）。不同專業(yè)的朝漢大學(xué)生在4項(xiàng)因素中均存在顯著差異。人文社科類學(xué)生（以下簡稱文科生）在4項(xiàng)因素中均值最小，即人際沖突處于輕度狀態(tài)，而其他三類專業(yè)均為中度。此外，文科生與語言類和體育類學(xué)生在4項(xiàng)因素中都呈現(xiàn)顯著差異，與理工農(nóng)醫(yī)類學(xué)生（以下簡稱理科生）在差異、被侵犯、溝通3項(xiàng)因素中呈現(xiàn)顯著差異，且前者強(qiáng)于后者。在個(gè)性因素中，理科生和體育藝術(shù)類學(xué)生表現(xiàn)出顯著差異（P=0.035）。

大學(xué)是向職場過渡的時(shí)期，較為穩(wěn)定的職業(yè)個(gè)性特征形成后對人際關(guān)系產(chǎn)生較大影響，因此專業(yè)學(xué)生間表現(xiàn)出極為顯著差異。文科生表達(dá)力強(qiáng)、善于溝通，在人際交往中顯出優(yōu)勢。相較而言，“理性、直接、沒情趣”的理科生在溝通中喜歡用枯燥、尷尬的封閉式問題，易造成溝通的不協(xié)調(diào)；雖然語言類學(xué)生研究語言，卻不善在實(shí)踐中運(yùn)用；此外，根據(jù)Y-G人格測驗(yàn)調(diào)查表顯示，藝術(shù)類大學(xué)生有與普通大學(xué)生不同的人格特質(zhì)，他們過于追求個(gè)性，且攻擊性強(qiáng)，不愿聽他人意見，氣量小、承受力差，一旦事與愿違多采用極端方式，較易形成極端人際沖突。而每天接觸枯燥、精細(xì)內(nèi)容的理科生謹(jǐn)言慎行的性格與思想活躍、特立獨(dú)行的體育藝術(shù)類學(xué)生形成強(qiáng)烈的個(gè)性對比，產(chǎn)生顯著差異。

此外，社會政治經(jīng)濟(jì)的巨變強(qiáng)烈沖擊著大學(xué)生的思維模式、價(jià)值觀念，這使得社會閱歷較淺的大學(xué)生心理過早成熟，產(chǎn)生極為相似的處世態(tài)度，因此不同年級的學(xué)生對4項(xiàng)因素的態(tài)度并未表現(xiàn)出顯著差異。但是，延邊大學(xué)朝鮮族達(dá)40%左右，新的語言、被“朝化”的生活方式使大一新生對突如其來的變化無法完全適應(yīng)，通過長期生活學(xué)習(xí)，適應(yīng)了本地文化，克服差異，因此2011級和2013級在差異因素中表現(xiàn)出顯著差異（P=0.032）。此外，根據(jù)佩里的大學(xué)生思維轉(zhuǎn)變階段論可認(rèn)為大一新生處于二元論階段，對問題的看法非彼即此，絕對化的思維易激化人際關(guān)系；大三學(xué)生進(jìn)入約定型階段，他們在分析事物時(shí)既能堅(jiān)持約定俗成的立場和觀點(diǎn)，又能適時(shí)做出調(diào)整，恰當(dāng)?shù)乇苊馊穗H沖突的發(fā)生。

城鄉(xiāng)一體化建設(shè)使城市與鄉(xiāng)村的差距減小，信息化時(shí)代使人們的交流過程跨越了地域的限制，加之青年學(xué)生對新事物接受力較強(qiáng)，因此不同地域的大學(xué)生人際沖突產(chǎn)生的可能性就更小。被侵犯因素中農(nóng)村相較于城市（P=0.024）、縣城（P=0.040），個(gè)性因素中農(nóng)村相較于縣城（P=0.019）均表現(xiàn)出顯著差異。雖然城鄉(xiāng)差距越來越小，但畢竟存在一些甚至更大的差異。一般來說，城市學(xué)生家庭條件優(yōu)于農(nóng)村學(xué)生，極易表現(xiàn)出優(yōu)越感，多數(shù)人都較為自我，不懂換位思考，所以人際沖突較易產(chǎn)生。

二是在不同性別、民族和是否為獨(dú)生子女上的差異分析結(jié)果與討論。通過獨(dú)立樣本T檢驗(yàn)，3個(gè)分組變量在4項(xiàng)因素中均不存在顯著差異。

當(dāng)今社會提倡男女平等，男性和女性要進(jìn)行相同的社會活動(dòng)、承擔(dān)相同的社會家庭責(zé)任，雖然他們的能力不相上下，但由于女性姣好的容貌、性格等優(yōu)勢可以幫助她們?nèi)〉酶玫娜穗H關(guān)系。但同時(shí)受到缺乏集體觀念、過分求全責(zé)備、常以挑剔和防范的眼光看待他人等因素的局限，阻礙了她們拓展人脈，成為引發(fā)人際沖突的根源。

朝漢民族間的人際沖突水平處于輕度。在對待差異和溝通問題上，漢族大學(xué)生要稍微嚴(yán)重（P=2.581，P=2.569）。在延大，漢族學(xué)生被認(rèn)為是“少數(shù)民族”，與朝鮮族不同的民族特征使人際交往變得復(fù)雜，常產(chǎn)生孤獨(dú)、缺少支持和關(guān)愛等感受，導(dǎo)致他們不自信，渴望又排斥人際交往，產(chǎn)生壓力、發(fā)生摩擦。雖然一個(gè)民族與另一個(gè)民族間的差別常被夸大產(chǎn)生民族形態(tài)曲解，當(dāng)這種曲解不斷積累，就形成民族偏見產(chǎn)生族際沖突，但朝漢兩民族并未表現(xiàn)出顯著差異和民族偏見。

此外，無論獨(dú)生子女與否，他們的人際沖突狀態(tài)都處于輕度。經(jīng)濟(jì)的發(fā)展使人民生活水平日益提高，富足的生活使孩子的需求得以滿足。因此，獨(dú)生子女與非獨(dú)生子女的個(gè)性差異并不明顯，他們在人際交往過程中展現(xiàn)出相似的能力。雖然如此，獨(dú)生子女的父母在關(guān)愛及與其相處的時(shí)間、財(cái)力等方面會優(yōu)于非獨(dú)生子女，致使其形成高傲、自我、不愿分享的特征。進(jìn)入大學(xué)后，平等的地位、沒有家長的呵護(hù)、較弱的情緒穩(wěn)定性都會誘發(fā)他們的人際沖突。因此，差異和個(gè)性兩個(gè)因素中，獨(dú)生子女（M=2.534）較非獨(dú)生子女（M=2.464）稍嚴(yán)重。在被侵犯和溝通兩因素中，非獨(dú)生子女（M=2.578）較獨(dú)生子女（M=2.527）稍嚴(yán)重。由于非獨(dú)生子女多和成年人相處，思想更為成熟、主動(dòng)性更高、性格外向、會恰當(dāng)?shù)乇Ｗo(hù)自己的權(quán)益不被侵犯，大學(xué)中成年人的交往方式使他們在交往中如魚得水。

四 研究結(jié)論與建議

1.研究結(jié)論

第一，朝漢大學(xué)生人際沖突情況并不嚴(yán)重。差異、被侵犯、個(gè)性、溝通4項(xiàng)因素對朝漢大學(xué)生人際沖突造成影響較小。

第二，人文社科類學(xué)生人際交往技能較強(qiáng)，沖突發(fā)生率最低。

第三，被侵犯是形成朝漢大學(xué)生族際沖突的首要因素。

2.建議

第一，加大心理健康教育工作投入，開展沖突教育，減少人際沖突的發(fā)生。雖然朝漢大學(xué)生的人際適應(yīng)力較強(qiáng)，但對依然存在的人際沖突問題，學(xué)校應(yīng)加大對學(xué)生心理健康教育工作的投入與重視，將沖突教育提上日程。學(xué)校應(yīng)該從入學(xué)之初就有意識地對學(xué)生傳達(dá)避免人際沖突的方法，幫助他們樹立正確的人生觀、交友觀。通過開設(shè)有關(guān)課程或講座，豐富大學(xué)生的理論知識；通過開展校園文化活動(dòng)和社會活動(dòng)豐富實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)，為進(jìn)入社會做好準(zhǔn)備。

第二，調(diào)整對各個(gè)專業(yè)學(xué)生的教育理念與教學(xué)方法，改善大學(xué)生人際交往狀況。當(dāng)今社會復(fù)合型人才急缺，“兩耳不聞窗外事，一心只讀圣賢書”的做法是走不通的。社交生活的缺乏使他們面臨人際危機(jī)時(shí)不是逃避就是沖突。針對不同專業(yè)的學(xué)生，結(jié)合自身局限性，社會、家庭、學(xué)校通過對教育理念與教學(xué)方法的調(diào)整，比如摒棄那些傳統(tǒng)觀念，綜合評價(jià)學(xué)生，幫助他們?nèi)姘l(fā)展，釋放心理束縛，完成自我突破，形成良好的人際關(guān)系。

第三，結(jié)合個(gè)體特征，設(shè)定合理的人際期望；學(xué)會正確的自我宣泄，提高情緒調(diào)節(jié)能力。恰當(dāng)?shù)娜穗H期望可以引導(dǎo)人際關(guān)系走向成功。結(jié)合個(gè)體特征，建立符合自身的合理期望，從“現(xiàn)實(shí)”走向“理想”。此外，學(xué)會寬容、接納自己，學(xué)會合理歸因，通過自我調(diào)節(jié)和自我宣泄避免人際沖突的發(fā)生。

第2篇：基因組學(xué)發(fā)展范文

關(guān)鍵詞：功能基因組；高通量數(shù)據(jù)；生物信息學(xué)

中圖分類號：Q933 文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A 文章編號：1671-2064（2017）10-0190-01

功能基因組學(xué)（后基因組學(xué)），是在結(jié)構(gòu)基因組所提供的豐富的高通量信息資源以及大量各類生成產(chǎn)物的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的基因組學(xué)的子學(xué)科。其通過在功能基因組水平或功能系統(tǒng)水平上全面地分析基因的功能，發(fā)展和提出了多種實(shí)驗(yàn)手段和分析方法，使得生物學(xué)的研究對象由單一基因或蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)為多個(gè)基因或蛋白質(zhì)組成的系統(tǒng)，進(jìn)而得到關(guān)于基因表達(dá)、調(diào)控、功能以及生物的生長、發(fā)育的相關(guān)規(guī)律。

1 差異顯示反轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)

差異顯示反轉(zhuǎn)錄PCR（DDRT―PCR）技術(shù)是由Liang和Pardee等提出的，以PCR和聚丙烯酞胺凝z電泳為基礎(chǔ)的功能基因組學(xué)的傳統(tǒng)方法。該方法的基本原理是：以1對細(xì)胞（或組織） 的總RNA反轉(zhuǎn)錄而成的cDNA為模板，利用PCR的高效擴(kuò)增，通過5’端和3’端引物的合理設(shè)計(jì)和組合，將細(xì)胞（或組織） 中表達(dá)的基因片段直接顯示在DNA測序膠上，從而找出1對細(xì)胞（或組織）中表達(dá)有差異的cDN斷。DDRT―PCR具有周期短，功能多，靈敏度高，所需RNA的量較少并且重復(fù)性較高等優(yōu)點(diǎn)。但是，在實(shí)際施行過程中， DDRT―PCR技術(shù)存在著假陽性率高、凝膠中單條cDNA帶成分不均一、所獲cDNA僅代表mRNA 3’UTR（非翻譯區(qū)）、一些低拷貝數(shù)mRNA不能有效呈現(xiàn)等問題。[1]

2 基因表達(dá)序列分析

基因表達(dá)序列分析（SAGE）是Velculescu等人建立的一種快速高效地分析轉(zhuǎn)錄物的實(shí)驗(yàn)方法。其理論依據(jù)是：基因組中95%的基因可以由來自cDNA 3’端特定位置的一段9―11bp長的序列加以區(qū)分。這一段特異的基因序列被記作SAGE標(biāo)簽。基因表達(dá)序列分析通過對cDNA制備SAGE標(biāo)簽，然后將這些標(biāo)簽串聯(lián)起來并對其進(jìn)行測定，可以顯示出各SAGE標(biāo)簽所代表的基因在特定的組織中是否有表達(dá)，同時(shí)還可以將SAGE標(biāo)簽所出現(xiàn)的頻率作為其所代表的基因表達(dá)程度的指標(biāo)。但是，應(yīng)用SAGE技術(shù)有一個(gè)重要前提條件：GenBank中必須有某一物種足夠多的DNA序列的資料（特別是EST序列的資料）。[2]

3 微陣列分析

DNA微陣列（microarray assay）技術(shù)包括cDNA微陣列和DNA芯片（DNA chip）兩種方法，這兩種方法的原理相同。首先是在固相表面合成成千上萬個(gè)寡核苷酸“探針”（cDNA、EST或基因特異的寡核苷酸），該過程會用到光導(dǎo)化學(xué)合成、照相平版印刷和固相表面化學(xué)合成等技術(shù)。接著將寡核苷酸“探針”與來自不同細(xì)胞、組織或整個(gè)器官的用放射性同位素或熒光物標(biāo)記的DNA或mRNA反轉(zhuǎn)錄生成的第一鏈cDNA進(jìn)行雜交。最后對每個(gè)雜交點(diǎn)進(jìn)行定量分析。定量分析的結(jié)果可以用于DNA測序、DNA突變和多態(tài)性分析以及對同一組織細(xì)胞在不同狀態(tài)下或在同一狀態(tài)下多種組織細(xì)胞基因表達(dá)水平的差異的檢測，還可以發(fā)現(xiàn)新的致病基因或疾病相關(guān)基因等。微陣列分析的優(yōu)點(diǎn)是可以同時(shí)對大量的基因，甚至是整個(gè)基因組的基因表達(dá)進(jìn)行對比分析，并且在核苷酸雜交技術(shù)的各個(gè)方面應(yīng)用。其在同時(shí)比較同一組織在不同狀態(tài)下或各組織之間DNA序列分析以及基因的表達(dá)狀況等方面具有極大的優(yōu)越性。

4 反義RNA分析

反義RNA是能與靶RNA互補(bǔ)配對的，用來定點(diǎn)分析某一段DN段（基因）功能的小分子RNA。反義RNA分析即是利用反義RNA來進(jìn)行功能基因組分析的方法。該方法首先分離基因片段的mRNA，合成其mRNA的互補(bǔ)RNA（反RNA）。然后給反RNA加上基因表達(dá)必需的元件（如啟動(dòng)子等），接著插入T-DNA。將其轉(zhuǎn)化到植株中，那么合成的基因就會在植株中表達(dá)，并表現(xiàn)出相應(yīng)性狀。因?yàn)榉戳xRNA與靶RNA堿基配對的結(jié)合方式，反義RNA可以在DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯水平上對基因表達(dá)加以調(diào)控。

5 蛋白質(zhì)組分析

蛋白質(zhì)組分析方法主要涉及兩個(gè)步驟：蛋白質(zhì)的分離和蛋白質(zhì)的鑒定。用于蛋白質(zhì)分離的技術(shù)主要是雙向凝膠電泳（2-dimensional gel electrophoresis，2-DE），其原理是細(xì)胞抽提物在電泳過程中蛋白質(zhì)個(gè)體首先依據(jù)所帶電荷然后依據(jù)分子大小被分離。這種方法的最大缺點(diǎn)是重復(fù)性差，使得幾乎不能同來自其他實(shí)驗(yàn)室的資料進(jìn)行比較。

6 生物信息學(xué)

生物信息學(xué)將DNA和蛋白質(zhì)作為研究對象，以計(jì)算機(jī)等計(jì)算工具為基礎(chǔ)，發(fā)展更新各種軟件，收集、整理和儲存DNA和蛋白質(zhì)的序列和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)，并加以分析進(jìn)而發(fā)現(xiàn)藏在基因序列中的規(guī)律。應(yīng)用生物信息學(xué)可以對功能基因組研究過程中產(chǎn)生的高通量，高維度的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理，應(yīng)用數(shù)理統(tǒng)計(jì)的方法，以計(jì)算機(jī)的快速運(yùn)算能力，找到功能基因組的相關(guān)信息。常應(yīng)用生物信息學(xué)將未知DNA序列與數(shù)據(jù)庫中收集的DNA序列進(jìn)行同源性比較，或應(yīng)用相關(guān)軟件進(jìn)行核苷酸及氨基酸序列的同源性比較，以此來獲得未知DNA序列的功能信息。[3]

7 小結(jié)與展望

隨著發(fā)展，基因組學(xué)由結(jié)構(gòu)基因組學(xué)向功能基因組學(xué)發(fā)展，由此也產(chǎn)生了大量應(yīng)用于功能基因組研究的工具和方法。這些方法從不同的角度和方向挖掘基因本身蘊(yùn)含的豐富信息資源。功能基因組學(xué)無論是應(yīng)用于獲取大量基因功能信息，亦或是針對特定基因的研究都取得了突破性的進(jìn)展，發(fā)展速度迅速。但隨著各類研究的不斷深入進(jìn)行，這些方法的精確性和準(zhǔn)確性會漸漸不再滿足條件，同時(shí)各項(xiàng)技術(shù)尚未解決的一些問題也會被放大，單個(gè)方法或技術(shù)可能難以對新的問題有較好的應(yīng)用。結(jié)合各種方法，揚(yáng)長避短，綜合應(yīng)用各種技術(shù)可以對功能基因組有更全面、深入的研究。[4]

功能基因組學(xué)的應(yīng)用十分廣泛，從動(dòng)物、植物到微生物群落分析都可以取得較好的研究成果，也可以應(yīng)用于醫(yī)藥、毒理等領(lǐng)域。隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的發(fā)展，將生物信息學(xué)應(yīng)用于功能基因組學(xué)，借助計(jì)算機(jī)強(qiáng)大的計(jì)算能力，功能基因組學(xué)將能取得更大的突破。

參考文獻(xiàn)

[1]趙錦榮，閻小君，蘇成芝.差異顯示反轉(zhuǎn)錄PCR 技術(shù)研究進(jìn)展[J].生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展，2000，27（1）：28-32.

[2]常青山，余增亮.基因表達(dá)分析方法及其研究進(jìn)展[J].生物技術(shù)通報(bào)，2002，（6）：27-31.

第3篇：基因組學(xué)發(fā)展范文

關(guān)鍵詞：證候；基因組；五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)；整體

中圖分類號：R249 文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A 文章編號：1673-7717（2008）04-0826-02

證候是中醫(yī)學(xué)的一個(gè)特有的概念，是辨證論治的核心和精髓。證候的標(biāo)準(zhǔn)化和定量化問題一直是中醫(yī)學(xué)的一個(gè)棘手問題。在中醫(yī)藥學(xué)現(xiàn)代化的進(jìn)程中，證候的現(xiàn)代化研究也被當(dāng)作了中醫(yī)藥學(xué)現(xiàn)代化的突破點(diǎn)。隨著現(xiàn)代基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的迅猛發(fā)展，中醫(yī)學(xué)界正在掀起結(jié)合的浪潮，隨著人類基因組計(jì)劃的完成和后基因組時(shí)代的到來為中醫(yī)證候的研究帶來了新的機(jī)遇，如何實(shí)現(xiàn)“證候-基因組學(xué)”闡釋是目前中醫(yī)藥研究的熱點(diǎn)。

1傳統(tǒng)概念

證候是醫(yī)者對病人的癥狀、舌脈、病情變化、治療經(jīng)過、個(gè)體情況、地土方宜等狀況，經(jīng)過四診八綱的分析，采用某種辨證方法得出的一個(gè)總的概括性結(jié)論；是在疾病發(fā)展過程中的某一階段的病理概括，可以認(rèn)為證候是人體在疾病發(fā)展過程中的某一階段的反應(yīng)狀態(tài)。證會隨著疾病的進(jìn)退而變化，是一個(gè)相對穩(wěn)定的具有時(shí)間性、階段性、變化性的概念。

2沈自尹院士認(rèn)為的證研究難點(diǎn)

①證是一種功能態(tài)的，可以發(fā)展，可以轉(zhuǎn)化；②證的概念應(yīng)用亦較混亂，靈活性大，辨證可因人而異，只有憑醫(yī)生的分析概括水平；③難以定性、定量、更難以定位?？梢娭嗅t(yī)證的研究已成為影響中醫(yī)藥學(xué)發(fā)展的關(guān)鍵問題。證是一種有機(jī)綜合的功能態(tài)，由一個(gè)調(diào)控中心及其所屬的眾多分子網(wǎng)絡(luò)所構(gòu)成，作為對外界反應(yīng)與自我調(diào)節(jié)的基礎(chǔ)。那么這個(gè)網(wǎng)絡(luò)是什么呢？就是五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。

3五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)

人的形體、臟腑、經(jīng)脈、氣穴、溪骨既有各自不同的功能，又彼此聯(lián)系，內(nèi)外相應(yīng)、六合會通，共同發(fā)揮整體調(diào)控作用。這些聯(lián)系從內(nèi)環(huán)境來看，表現(xiàn)為臟與臟之間功能協(xié)同關(guān)系，臟與腑之間的表里關(guān)系，腑與腑之間的相互傳化關(guān)系，臟腑與經(jīng)絡(luò)之間的相互絡(luò)屬關(guān)系，及臟腑與五官、五體、五液之間，臟腑與精、氣、血、津液之間的互藏互用關(guān)系。從外環(huán)境看，表現(xiàn)為五臟系統(tǒng)與自然界之間的授受關(guān)系，與五音、五味、五季、五方的廣泛聯(lián)系，形成了以五行屬性為綱的整個(gè)自然界的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。五臟之間密切相關(guān),每一臟都含有其他臟之氣,而每一臟之氣又都滲透到其他臟之中,調(diào)整著相互之間的關(guān)系。五臟之間相互依存,相互制約,每一臟的功能都再與它臟的交互聯(lián)系中發(fā)揮作用。

五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)整體由心系統(tǒng)主宰，與其它各層次系統(tǒng)（子系統(tǒng)）的功能活動(dòng)相互協(xié)調(diào)，使系統(tǒng)整體功能處于有序、協(xié)調(diào)和穩(wěn)定狀態(tài)。五臟功能網(wǎng)絡(luò)并非機(jī)械的、自閉的，而是與時(shí)空聯(lián)系在一起的。

4五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)與基因組網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)

宏觀整體和微觀基因組整體有嚴(yán)密的同一性，宏觀整體規(guī)律和微觀基因組規(guī)律有同一性，宏觀的五臟網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)必然有微觀的基因組網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)相互對應(yīng)?；蚪M整體由五臟基因組集團(tuán)構(gòu)成，臟基因組集團(tuán)間的聯(lián)系路線是經(jīng)絡(luò)系統(tǒng)的根源，五臟基因組依靠微觀的經(jīng)絡(luò)系統(tǒng)的聯(lián)系的相互作用形成了一個(gè)生命的統(tǒng)一體。

從證的機(jī)理來講，證與五臟是密切相關(guān)的；從證與基因組的關(guān)系來講，基因是里，證是表，證與基因的關(guān)系也是密切的，與基因組內(nèi)部的功能作用路線是有關(guān)。中醫(yī)辨證方法有八綱、六經(jīng)、衛(wèi)氣營血、臟腑和三焦辨證等。而證又是有個(gè)體差異的，因而被認(rèn)為與基因型相關(guān)。從基因組的角度講，基因表達(dá)正常與協(xié)調(diào)為“正氣”，反之為“病氣”。1979年根據(jù)著名老中醫(yī)關(guān)幼波的臨床經(jīng)驗(yàn)，將肝病分為8個(gè)主型，36個(gè)亞型。因而證的基因組定位也是有主次的，多點(diǎn)的，與基因組的微觀經(jīng)絡(luò)系統(tǒng)、臟基因塊及其作用調(diào)控途徑有關(guān)。由證可以推出與某組蛋白質(zhì)組有關(guān),而這組蛋白質(zhì)組又與某組基因組相關(guān)，因此可以推出肝臟基因組塊的微細(xì)結(jié)構(gòu)以及證的基因組機(jī)理。證候基因組定位是某些基因之間相互聯(lián)系和表達(dá)量大小。證候的本質(zhì)因此是某些基因組成的網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。

5證候－基因組研究

為促進(jìn)中醫(yī)藥與現(xiàn)代生命科學(xué)的前沿―基因組學(xué)的溝通，尋求新的研究和發(fā)展領(lǐng)域與途徑，國家中醫(yī)藥管理局科技教育司于1999 年3 月14-15 日在北京召開了中醫(yī)藥與基因組學(xué)研討會。在中醫(yī)藥與基因組學(xué)研究相互滲透的可能性中醫(yī)藥與基因組學(xué)結(jié)合的研究領(lǐng)域、基因組學(xué)與中醫(yī)藥交叉滲透的切入點(diǎn)3個(gè)方面進(jìn)行了廣泛的交流，取得“證候-基因組”研究的共識?！白C候-基因組學(xué)”定義為在證候理論指導(dǎo)下，運(yùn)用功能基因組學(xué)的方法，通過探討證候，特別是同病異證或異病同證時(shí)基因的變異及差異表達(dá)情況，揭示與某一證候形成相關(guān)的所有基因及其功能，從整體基因表達(dá)的水平闡明證候的本質(zhì)。

“證候-基因組”的切入證候的研究也應(yīng)當(dāng)包含基因組的兩個(gè)層次，即證候的單核苷酸多態(tài)研究和證候的基因表達(dá)譜研究。前者應(yīng)從異病同證角度切入，這樣才能發(fā)現(xiàn)與證候的關(guān)系密切的核苷酸多態(tài)，但是研究者要從整體上把握證候與SNP 的關(guān)系，就必須通過對全部一千萬個(gè)SNP 位點(diǎn)都進(jìn)行基因分型，其難度是相當(dāng)大的?！白C候-基因表達(dá)譜”研究主要針對參與表達(dá)的約3 萬個(gè)基因，故從理論上把握證候的整體基因表達(dá)是可行的，因此目前“證候-基因組”研究以“證候-基因表達(dá)譜”為重點(diǎn)。

當(dāng)代有許多中醫(yī)學(xué)者專家比如王米渠先生在努力研究中醫(yī)證候和基因組的結(jié)合，試圖在基因組的研究中揭示出中醫(yī)的證或者證候的本質(zhì)。他們克服了方法論、試驗(yàn)重復(fù)性差、海量數(shù)據(jù)處理等困難，在證候－基因組研究中取得了可喜的一步，為揭示中醫(yī)證候的本質(zhì)為中醫(yī)現(xiàn)代化作出了杰出貢獻(xiàn)。

但是當(dāng)代證候－基因組研究也存在許多的不足，例如：如何證候-基因表達(dá)譜動(dòng)態(tài)中表現(xiàn)出證候的定量變化，基因組圖譜中的基因相互關(guān)系怎樣如何隨著證的逐漸變化而發(fā)展的等等。將基因組圖譜作為證候的本質(zhì)不能說明問題，似乎有將中醫(yī)走向還原論的可能，已經(jīng)有許多學(xué)者提出了批評。

6證候－基因組研究的建議

證候－基因組研究作為證候現(xiàn)代化研究的初步，能作出這樣的成果是不能提出任何批評的，但是為了進(jìn)一步的發(fā)展不能不對現(xiàn)已經(jīng)作出的成果和經(jīng)驗(yàn)作出應(yīng)有的總結(jié)和審核。

（1）重悟輕測是中醫(yī)傳統(tǒng)的認(rèn)知方法，中醫(yī)對人體生理、病理的認(rèn)識體現(xiàn)了這一點(diǎn)。藏象系統(tǒng)就是通過直覺提出的。現(xiàn)在的證候－基因組研究看起來走向了另一極端，沒有和中醫(yī)原來的優(yōu)點(diǎn)結(jié)合起來。筆者認(rèn)為，證候－基因組研究應(yīng)該和中醫(yī)基因組學(xué)結(jié)合起來，將分析測定和整體思維直覺思維結(jié)合起來，達(dá)到悟測并重，在測定中結(jié)合整體思維，在整體思維中測定，相互驗(yàn)證。

（2）中醫(yī)學(xué)在觀察分析和研究處理問題時(shí)，注重的時(shí)事物的功能、屬性、作用，而不是形態(tài)和結(jié)構(gòu)?；蚪M整體時(shí)結(jié)構(gòu)和功能的統(tǒng)一，認(rèn)識基因組整體必須堅(jiān)持功能分析和結(jié)構(gòu)分析的統(tǒng)一，在實(shí)踐中將二者結(jié)合起來，相互促進(jìn)而快速達(dá)到目的。

（3）基因組是相互聯(lián)系的整體，研究證候基因組必須從基因組整體出發(fā)，基因是整體中的部分，是全息性的部分，從整體出發(fā)才不會走向還原論，而保持中醫(yī)的整體特色。

（4）中醫(yī)堅(jiān)持臨床研究和試驗(yàn)研究的結(jié)合，證候是基因組的網(wǎng)絡(luò)出現(xiàn)的不和諧的問題，臨床有大量的證候都可以利用，可以在證候的研究中發(fā)現(xiàn)深刻的基因組聯(lián)系；把臨床研究與試驗(yàn)研究結(jié)合起來，相互彌補(bǔ)，利用各種分子生物學(xué)技術(shù)和手段可以發(fā)現(xiàn)基因組內(nèi)的整體聯(lián)系。

證候?qū)W是可以結(jié)合現(xiàn)代的分子生物學(xué)技術(shù)，闡述證候的整體本質(zhì)，讓中醫(yī)學(xué)的整體色彩在新的時(shí)代重新煥發(fā)出新的光輝；否則就可能落后，隨著生命本質(zhì)的研究繼續(xù)深入，中醫(yī)學(xué)就可能被取代?；蚪M學(xué)是現(xiàn)代生命科學(xué)由還原論走向整體論的節(jié)點(diǎn)，而中醫(yī)基因組學(xué)的建立不但促進(jìn)這種趨勢，而且可以促進(jìn)中醫(yī)藥學(xué)的現(xiàn)代化發(fā)展。中醫(yī)藥學(xué)只有在結(jié)合吸收了現(xiàn)代科學(xué)的優(yōu)秀還原論優(yōu)勢，在整體理論指導(dǎo)下分化重新整合而走向新的整體論高峰。

參考文獻(xiàn)

［1］劉家強(qiáng).中醫(yī)基因組學(xué)的建立考釋[J].中醫(yī)藥學(xué)報(bào)，2004：9：1667-1669.

第4篇：基因組學(xué)發(fā)展范文

[摘要]21世紀(jì)是基因科學(xué)高度發(fā)展的世紀(jì),針灸學(xué)可望在“后基因組時(shí)代”中發(fā)揮重要的作用。筆者認(rèn)為針灸學(xué)在關(guān)鍵基因調(diào)控方面優(yōu)勢明顯,針灸的作用機(jī)理研究可望通過借鑒基因科學(xué)的先進(jìn)的理論與技術(shù)而有所突破,并借鑒針灸治療潰瘍性結(jié)腸炎的研究思路,提出了21世紀(jì)針灸學(xué)的研究思路與發(fā)展方向。

[主題詞]針灸學(xué);研究設(shè)計(jì);基因組,人GeneScienceandAcupMoxibustionScienceofthe21thCenturyWuHuangan,ZhangBimeng,LiuHuirong(

ShanghaiMunicipalInstituteofAcupmoxibustionandMeridians,Shanghai200030)[Abstract]The21

thcenturywillbeacenturyofhighdegreeofdevelopmentingenescience.Acupmoxibustionsciencemay

playanimportantroleinthe“l(fā)atergenometimes”.Theauthorsholdthatacupmoxibustionsciencehaso

bviousadvantagesinregulationofcriticalfunctionalgenes;studiesonmechanismsofacupunc

tureandmoxibustionmayhavesomebreakthroughbymeansofadvancedtheoriesandtechniqueso

fgenescience.Theyalsoputforwardresearchthinkinganddevelopmentdirectionofacup

moxibustionscienceinthe21thcenturybasedonthinkingofstudyontreatmentofulcer

ativecolitiswithacupunctureandmoxibustion.

[Keywords]AcupunctureMoxibustionScience;ResearchDesign;Genome,Human第一作者簡介:吳煥淦,男,上海中醫(yī)藥大學(xué)教授、博士生導(dǎo)師,上海市針灸經(jīng)絡(luò)研究所副所長。

作為生命科學(xué)的重要組成部分,針灸學(xué)在現(xiàn)代化研究進(jìn)程中,充分吸收、借鑒了生命科學(xué)領(lǐng)域的新思維、新理論、新技術(shù),在針刺鎮(zhèn)痛機(jī)理研究,經(jīng)絡(luò)、腧穴本質(zhì)探討方面取得了一系列進(jìn)展,針灸與神經(jīng)、內(nèi)分泌、免疫系統(tǒng)相關(guān)性研究成果也已為醫(yī)學(xué)界所認(rèn)同。我們也意識到,有關(guān)針灸作用機(jī)理研究和其他與針灸學(xué)發(fā)展密切相關(guān)的問題,不是針灸學(xué)本身所能解決的,只有將其融入生命科學(xué)這一大環(huán)境中,針灸學(xué)才能獲得進(jìn)一步的發(fā)展?？梢灶A(yù)測,在到來的21世紀(jì)里,生命科學(xué)必將獲得空前的發(fā)展,“基因科學(xué)”將滲透到醫(yī)學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域,在新的“基因時(shí)代”里,針灸學(xué)將受到哪些影響,它的發(fā)展前景如何?我們應(yīng)該如何把握這一發(fā)展時(shí)機(jī)等一系列相關(guān)問題,應(yīng)引起每一位針灸工作者的足夠重視。結(jié)合我們課題組在長期從事針灸免疫(包括分子免疫學(xué))相關(guān)研究過程中所積累的一些經(jīng)驗(yàn),從以下幾個(gè)方面提出一些初淺的看法。

1基因組學(xué)快速發(fā)展

自20世紀(jì)以來,生命科學(xué)獲得了極大發(fā)展,特別是1953年DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn)以及1985年Crick的遺傳信息傳遞的中心法則的提出,更是極大地促進(jìn)了基因組學(xué)的發(fā)展,從而引發(fā)了一場世界范圍內(nèi)的基因技術(shù)革命,它對整個(gè)社會的影響是巨大的,在工業(yè)、農(nóng)業(yè)、環(huán)保、醫(yī)藥等方面顯示出廣闊的發(fā)展前景?；蚪M學(xué)的研究可分為兩個(gè)階段:一是以人類基因組DNA的全序列測定為標(biāo)志的“結(jié)構(gòu)基因組學(xué)”階段。自美國從1990年啟動(dòng)人類基因組計(jì)劃(HGP)以來,已經(jīng)發(fā)展成為一個(gè)國際大協(xié)作項(xiàng)目,它的意義可與曼哈頓原子彈計(jì)劃及阿波羅登月計(jì)劃相媲美,但現(xiàn)階段HGP的完成僅為今后全面認(rèn)識人類基因組的功能提供了一個(gè)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)[1]。隨之而來的是競爭更為激烈的“后基因組時(shí)代”,為了確保我國在未來的生命科學(xué)中占有重要地位,我國確立了從“功能基因組學(xué)”和“疾病基因組學(xué)”入手的研究策略,同時(shí),也認(rèn)識到人類基因組學(xué)的研究方法、研究內(nèi)容與中醫(yī)學(xué)的整體觀、辨證觀有許多相似之處,中醫(yī)藥(包括針灸)在這方面有巨大潛力。

2針灸學(xué)的優(yōu)勢

針灸是在中醫(yī)的臟腑經(jīng)脈等相關(guān)理論的指導(dǎo)下,通過針刺或艾灸來達(dá)到調(diào)整臟腑的陰陽氣血、虛實(shí)正邪等,最終起到治療作用。它擅長從整體上對人體進(jìn)行調(diào)整,并可根據(jù)機(jī)體不同的功能狀況,通過選用不同的穴位或采用不同的針刺手法來達(dá)到調(diào)整機(jī)體功能狀態(tài)之目的。針灸學(xué)作為中醫(yī)學(xué)的重要組成部分,其基本治療思想是將疾病的病理過程作為一個(gè)整體,它通過影響多靶點(diǎn)和疾病過程的多個(gè)環(huán)節(jié),從而激發(fā)機(jī)體自身內(nèi)在的調(diào)整能力來達(dá)到治療目的[2]。其整合作用不僅表現(xiàn)在影響疾病的病理過程,對體質(zhì)改善也有作用,在解決疾病易感性方面優(yōu)勢明顯。當(dāng)前,人類的疾病由以感染和營養(yǎng)失調(diào)為主的單因素疾病轉(zhuǎn)向以機(jī)體自身代謝和調(diào)控失常為主的多因素疾病,以對抗為主要特征的西醫(yī)未能達(dá)到從根本上改變復(fù)雜的病理過程,難以遏止疾病的發(fā)展[3]。雖然基因科學(xué)帶給醫(yī)學(xué)的影響是巨大的,甚至被稱為“基因科學(xué)導(dǎo)致醫(yī)學(xué)革命”,許多科學(xué)家也提出可以用改變基因結(jié)構(gòu)來治療單基因疾病,但這只是理論上的設(shè)想,迄今為止,基因治療尚不成熟,它的負(fù)面效應(yīng)還不清楚[4]。況且,絕大多數(shù)發(fā)病率高、危害性大的疾病是多基因疾病,是有多個(gè)調(diào)控基因失常所致,因此,治療策略應(yīng)該是以修飾或調(diào)控基因表達(dá)與基因產(chǎn)物功能來達(dá)到治療目的。在研究基因組過程中,認(rèn)識到多種致病因素作用于人體,能否發(fā)病以及預(yù)后情況怎樣,是疾病相關(guān)基因與內(nèi)外環(huán)境相互作用的結(jié)果,外因是通過內(nèi)因起作用的,并在此基礎(chǔ)上提出了診治的個(gè)體化等新的治療觀念,這與中醫(yī)學(xué)(針灸學(xué))的辨證論治觀相一致。針灸學(xué)在整個(gè)發(fā)展過程,都貫穿著辨證論治思想,其以多環(huán)節(jié)、多靶點(diǎn)的整合調(diào)節(jié)為特點(diǎn),在治療與病種方面的優(yōu)勢依然明顯?；蚪M學(xué)與中醫(yī)針灸學(xué)在思維方法學(xué)上的趨近性,為兩者在研究思路與研究方法的相互滲透提供了可能。

3基因芯片在針灸治療潰瘍性結(jié)腸炎作用機(jī)制研究中的應(yīng)用

有關(guān)針灸作用機(jī)理的研究,古代及近代醫(yī)家都作過探索,但基本上停留在以傳統(tǒng)的中醫(yī)理論進(jìn)行闡述。近半個(gè)世紀(jì)以來,國內(nèi)外學(xué)者在針灸作用機(jī)理研究,如針刺鎮(zhèn)痛機(jī)理的研究,針刺對神經(jīng)、免疫、內(nèi)分泌系統(tǒng)調(diào)節(jié)的研究等方面,均作了大量細(xì)致而有意義的工作,并證實(shí)了針刺的確切療效,但尚缺少被人們普遍接受的合理解釋。針灸治療潰瘍性結(jié)腸炎臨床與機(jī)理的系列研究所提供的研究思路,對我們頗有借鑒意義。潰瘍性結(jié)腸炎(UlcerativeColitis,UC)屬難治性疾病,病因涉及免疫系統(tǒng)、環(huán)境,以及尚未確定的慢性腸道炎癥易感基因之間的相互作用。這些相互作用引起一系列級聯(lián)改變,導(dǎo)致慢性腸道炎癥、組織病變和疾病。我們的研究發(fā)現(xiàn):隔藥灸治療UC不僅具有滿意的近期療效,也有一定的遠(yuǎn)期療效,且副作用小[5]。有關(guān)隔藥灸治療UC的臨床及作用機(jī)理的研究成果已得到學(xué)術(shù)界的廣泛認(rèn)同:(1)艾灸治療潰瘍性結(jié)腸炎的形態(tài)學(xué)研究(SCI收錄)[5];(2)從細(xì)胞因子與基因調(diào)控探討針灸治療潰瘍性結(jié)腸炎的機(jī)理(SCI收錄)[6];(3)針灸治療大鼠潰瘍性結(jié)腸炎分子免疫學(xué)機(jī)理研究[7],發(fā)現(xiàn)隔藥灸與電針能夠上調(diào)潰瘍性結(jié)腸炎大鼠結(jié)腸粘膜中IL1ramRNA表達(dá),降低IL1βmRNA、IL6mRNA表達(dá)及iNOSmRNA的表達(dá),從而有效地控制潰瘍性結(jié)腸炎已啟動(dòng)的炎癥和免疫級聯(lián)反應(yīng)[6、7]。上述研究成果為進(jìn)一步從基因表達(dá)調(diào)控水平上研究UC提供了理論及實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ),也為研究隔藥灸調(diào)節(jié)相關(guān)基因表達(dá)及表達(dá)產(chǎn)物功能提供了重要依據(jù)。但這種只針對單基因的研究思路對揭示UC的發(fā)病本質(zhì)存在一定的局限性,畢竟眾多細(xì)胞因子之間及其與靶細(xì)胞之間是相互影響、相互作用的。

國外有研究選擇性刪除小鼠一個(gè)感興趣的基因(或稱為“敲除”)而產(chǎn)生慢性腸道炎癥。特發(fā)性腸道炎癥可以是免疫系統(tǒng)特異基因異常的結(jié)果,在這些有基因改變的動(dòng)物,正常腸道菌群能誘發(fā)慢性腸道炎癥。但對各種潰瘍性結(jié)腸炎“敲除”突變體模型的思考,強(qiáng)烈支持環(huán)境(在這里指腸道菌群)可能與特異基因(特別是那些上調(diào)或下調(diào)免疫系統(tǒng)者)相互作用而引起潰瘍性結(jié)腸炎的設(shè)想[8]。但無論在生理或病理?xiàng)l件下,在基因表達(dá)調(diào)控、機(jī)體免疫及細(xì)胞分化等重要生命活動(dòng)中,并非每個(gè)基因都是單獨(dú)的發(fā)揮作用,眾多基因是作為一個(gè)統(tǒng)一的整體進(jìn)行調(diào)節(jié)的。目前,國內(nèi)尚缺乏全面、深入的相關(guān)研究,未能闡明潰瘍性結(jié)腸炎的確切發(fā)病機(jī)理,這給有效的治療該病帶來了困難。因此,篩選在影響UC的多個(gè)環(huán)節(jié)上起作用的分子和起關(guān)鍵性調(diào)控作用的基因,從基因的整體調(diào)控水平來揭示潰瘍性結(jié)腸炎的發(fā)病機(jī)制及針灸治療的可能作用機(jī)制應(yīng)是醫(yī)學(xué)界所關(guān)注的問題。

借鑒生命科學(xué)領(lǐng)域先進(jìn)的理論與方法,應(yīng)用近幾年發(fā)展起來的前沿生物技術(shù)―――基因芯片技術(shù)篩選出UC差異表達(dá)基因及隔藥灸“天樞穴”治療UC的反應(yīng)性基因,并克隆部分未知基因全長cDNA,進(jìn)行功能分析,初步建立“UC相關(guān)基因表達(dá)譜”,闡釋UC的發(fā)生機(jī)制與隔藥灸治療UC的基因調(diào)控和功能修飾的機(jī)制,探討能與隔藥灸起反應(yīng)的基因。這些基因可能是目前已知的與UC相關(guān)的基因,也可能是未知功能的基因,國內(nèi)尚未對潰瘍性結(jié)腸炎基因表達(dá)譜有一個(gè)全面的認(rèn)識。因此,從整體水平出發(fā)來研究針灸的基因表達(dá)譜為最終揭示針灸的作用本質(zhì)提供了可能,同時(shí)也為針灸的現(xiàn)代化研究提供了一種很好的思路。

自人類基因組計(jì)劃實(shí)施以來,不僅給現(xiàn)代醫(yī)藥學(xué)帶來新機(jī)遇,也為針灸學(xué)的發(fā)展帶來了極好的契機(jī)。國內(nèi)一些學(xué)者已注意到在“功能基因組”與“疾病基因組”的調(diào)控方面,針灸具有巨大的潛力,并且意識到如果在這方面的研究有所突破的話,將使我國在即將來臨的“后基因組時(shí)代”處于國際領(lǐng)先地位[2,3]。在考慮將“功能基因組學(xué)”與針灸學(xué)結(jié)合起來進(jìn)行研究時(shí),不僅要嚴(yán)格遵循“功能基因組學(xué)”本身的研究規(guī)律,同時(shí)也要認(rèn)識到針灸療法本身的特點(diǎn),選擇針灸療效顯著的潰瘍性結(jié)腸炎進(jìn)行研究,因此,開展“UC隔藥灸”基因表達(dá)譜的相關(guān)研究具有較高的理論與應(yīng)用價(jià)值。

實(shí)踐證明,針灸學(xué)只有采取中西醫(yī)結(jié)合方式,運(yùn)用先進(jìn)的現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)與手段,把中醫(yī)基礎(chǔ)理論的闡釋、確切的臨床療效及其作用機(jī)理提供給人們,充分發(fā)揮其在調(diào)控基因功能方面的優(yōu)勢,才能在21世紀(jì)的生命科學(xué)研究中占有一席之地。有理由認(rèn)為,只有充分地將針灸學(xué)的特色融入到生命科學(xué)的領(lǐng)域中,將宏觀現(xiàn)象的研究與微觀機(jī)理的研究緊密結(jié)合起來,針灸學(xué)才能在當(dāng)今迅速發(fā)展的生命科學(xué)里得到豐富和發(fā)展。相信,針灸學(xué)必將在21世紀(jì)里大放光彩。

4參考文獻(xiàn)

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7WuHuangan,etal.TheMechanismofiNOSGeneModulationon

第5篇：基因組學(xué)發(fā)展范文

【摘要】

整體醫(yī)學(xué)是一種弱整體觀，理論基礎(chǔ)是還原科學(xué)觀。未來的整體醫(yī)學(xué)是以中醫(yī)學(xué)為核心的功能與結(jié)構(gòu)統(tǒng)一的醫(yī)學(xué)體系。中醫(yī)學(xué)的整體觀經(jīng)歷了一個(gè)發(fā)展過程，中醫(yī)現(xiàn)代化必須從《內(nèi)經(jīng)》的整體觀開始，而中醫(yī)基因組學(xué)和中醫(yī)心理學(xué)是關(guān)鍵。中醫(yī)現(xiàn)代化的目的就是用現(xiàn)代的語言和當(dāng)代科學(xué)技術(shù)重新描述人與自然、人與社會平衡條件下的人整體及其運(yùn)動(dòng)規(guī)律。整體醫(yī)學(xué)的崛起將給中醫(yī)藥學(xué)的國際化帶來機(jī)遇。

【關(guān)鍵詞】 整體醫(yī)學(xué)； 基因組； 中醫(yī)心理學(xué)； 中醫(yī)基因組學(xué)

1 整體醫(yī)學(xué)

整體醫(yī)學(xué)是現(xiàn)代社會正在興起的一種醫(yī)學(xué)體系，將醫(yī)學(xué)看成一個(gè)有機(jī)整體，從整體上來認(rèn)識醫(yī)學(xué)的性質(zhì)、對象和目的。整體醫(yī)學(xué)與傳統(tǒng)中醫(yī)藥學(xué)在外表近似，但是本質(zhì)有所不同。整體醫(yī)學(xué)從本質(zhì)上說，是一種系統(tǒng)論。整體醫(yī)學(xué)就是用整體觀認(rèn)識醫(yī)學(xué)的各個(gè)要素。 而整體醫(yī)學(xué)的整體觀是建立在現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)所認(rèn)識的所有聯(lián)系的基礎(chǔ)上，從科學(xué)的長遠(yuǎn)發(fā)展上來說，這是一種弱整體觀，一種綜合論，理論基礎(chǔ)是還原科學(xué)觀。

醫(yī)學(xué)的發(fā)展大致經(jīng)歷了三個(gè)時(shí)代，即經(jīng)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代、實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代和當(dāng)前的整體醫(yī)學(xué)時(shí)代。經(jīng)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代為自然哲學(xué)醫(yī)學(xué)模式，實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代為生物醫(yī)學(xué)模式，而整體醫(yī)學(xué)時(shí)代為生物-心理-社會醫(yī)學(xué)模式。當(dāng)今醫(yī)學(xué)的特點(diǎn)是處在實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)時(shí)代向整體醫(yī)學(xué)時(shí)代的過渡時(shí)期，整體醫(yī)學(xué)的理論體系尚未正式形成，但已具雛形?，F(xiàn)代的整體醫(yī)學(xué)是現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)尤其是生命科學(xué)發(fā)展的結(jié)果，但是生命科學(xué)——基因組學(xué)正在走向完善的基因組聯(lián)系，將來的發(fā)展必然在基因組的普遍聯(lián)系上證明中醫(yī)的基本理論，所以隨著基因組學(xué)的整體化發(fā)展，以及中醫(yī)學(xué)的跨越式發(fā)展，現(xiàn)代整體醫(yī)學(xué)必然走向更完備的、以中醫(yī)學(xué)為核心的整體醫(yī)學(xué)。

2 中醫(yī)學(xué)現(xiàn)代化

整體醫(yī)學(xué)的崛起給中醫(yī)藥學(xué)國際化帶來了機(jī)遇，整體醫(yī)學(xué)與中醫(yī)藥學(xué)的關(guān)系是十分密切的。從理論體系看，整體醫(yī)學(xué)的理論與中醫(yī)藥學(xué)的學(xué)說實(shí)際上是相通的。如《黃帝內(nèi)經(jīng)》中就提出“人與天地相參”的觀點(diǎn)。

中醫(yī)藥學(xué)其實(shí)就是一門完整的整體醫(yī)學(xué)。中醫(yī)學(xué)有著對人體自身整體性及人與自然、社會環(huán)境相統(tǒng)一的認(rèn)識。但是中醫(yī)學(xué)又是一門模糊的整體科學(xué)?！饵S帝內(nèi)經(jīng)》建立于二千多年前，是古人觀察人體與自然所建立的整體醫(yī)學(xué)，其本質(zhì)就是結(jié)構(gòu)與功能相統(tǒng)一的整體觀，但是由于社會發(fā)展水平和極端落后的科學(xué)技術(shù)條件的限制，這個(gè)時(shí)候形成的整體只能是粗略與模糊的。隨著時(shí)代的發(fā)展，由于封建禮教的限制，加之受中國哲學(xué)觀重用輕體、重道輕器價(jià)值取向的影響，人們開始疏于人體具體的形態(tài)和結(jié)構(gòu)，歧視人體解剖，對人體的細(xì)節(jié)和局部方面未做較深入的剖析研究，隨之《內(nèi)經(jīng)》的結(jié)構(gòu)功能統(tǒng)一的整體觀逐漸演變?yōu)閱渭兊墓δ苄缘恼w觀。由于缺乏了結(jié)構(gòu)和形態(tài)的支持，不能得到有效的可見的物質(zhì)證據(jù)來說明自己的科學(xué)性，本身也缺乏創(chuàng)新發(fā)展，所以隨著以結(jié)構(gòu)為主的現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的發(fā)展，中醫(yī)學(xué)屢次受到打擊和排斥。

中醫(yī)藥學(xué)的發(fā)展必須從《黃帝內(nèi)經(jīng)》的整體思想開始做起，真正認(rèn)識整體的本質(zhì)，結(jié)合現(xiàn)達(dá)的科學(xué)技術(shù)尤其是分子生物學(xué)技術(shù)，發(fā)展新時(shí)代的完整的結(jié)構(gòu)與功能統(tǒng)一的整體觀。所謂中醫(yī)現(xiàn)代化就是用現(xiàn)代語言和科學(xué)技術(shù)重新描述人與自然、人與社會平衡條件下的人整體的運(yùn)動(dòng)規(guī)律。

當(dāng)代分子生物學(xué)在迅猛發(fā)展，借助電子計(jì)算機(jī)技術(shù)處理大量數(shù)據(jù)，基因組學(xué)得到了極大的發(fā)展。在足夠的時(shí)間內(nèi)，基因組學(xué)很可能走向整體，最后可能在基因的相互聯(lián)系中發(fā)現(xiàn)了中醫(yī)的陰陽五行所存在的基因證據(jù)，這時(shí)候中醫(yī)就會被分子生物學(xué)所吸收，現(xiàn)代的整體醫(yī)學(xué)就可能吸收了中醫(yī)藥學(xué)的優(yōu)勢發(fā)展成為完善的結(jié)構(gòu)與功能統(tǒng)一的整體醫(yī)學(xué)，中醫(yī)不再是中國的中醫(yī)了。這是好事，但是對于國家和民族，對于中醫(yī)學(xué)的發(fā)源地，我們將失去一次崛起的機(jī)會。

3 整體的含義

中醫(yī)學(xué)是整體科學(xué)，西醫(yī)學(xué)是還原科學(xué)。中醫(yī)現(xiàn)代化首先必須是基礎(chǔ)理論的現(xiàn)代化，而基礎(chǔ)理論的現(xiàn)代化又以整體為前提，整體觀的現(xiàn)代化為首要。 以前中醫(yī)現(xiàn)代化的失敗在于從傳統(tǒng)的功能整體觀方法論上而不是從整體的根本意義上看待現(xiàn)代化。而西醫(yī)也是從自身的方法論上看待中醫(yī)，所以在這種前提下根本的中西醫(yī)結(jié)合是不可能的。

整體是物質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能的統(tǒng)一，兩者互相依存、不能分離，結(jié)構(gòu)是功能的基礎(chǔ)，功能是結(jié)構(gòu)的展現(xiàn)。整體是局部的整體，局部是整體的局部。 整體是物質(zhì)形、氣、能的統(tǒng)一，是結(jié)構(gòu)與功能的統(tǒng)一，是一種客觀實(shí)在。

任何個(gè)體都是由兩種以上的物質(zhì)要素混化而成的。這一混化物可以呈質(zhì)地均勻無別的氣態(tài)，也可以呈實(shí)體存在的實(shí)體態(tài)。前者固然是一體，后者，盡管它的實(shí)體組成部分可以形形，各部分的功能也可千差萬別，但該實(shí)體物的氣卻遍布全體、貫穿內(nèi)外，使組元形成有機(jī)聯(lián)系的和諧整體。這里所說的整體，指形成氣的時(shí)空結(jié)構(gòu)而言，它是維系氣獨(dú)立性、特殊性的根本，也可把整體理解為氣的結(jié)構(gòu)模式。譬如，設(shè)某模式為特殊的比附，這種特定的形狀結(jié)構(gòu)的性質(zhì)是不受其所占位置的大小影響的。因而時(shí)空結(jié)構(gòu)模式一旦形成，不僅可以使全部事物的各個(gè)部分都處在同一結(jié)構(gòu)上，而且這一整體特以滲透到所屬各個(gè)局部中去，使在這一整體中的局部組元可以體現(xiàn)整體，這是與組元作為獨(dú)立存在物的根本區(qū)別：①整體的實(shí)在性。②整體的聯(lián)系性：任何整體都在和其他整體處在密切的聯(lián)系當(dāng)中，聯(lián)系是這個(gè)整體存在的必然條件，沒有聯(lián)系便沒有這個(gè)整體存在的必然性了。③整體的層次性：任何整體都是大的整體的一個(gè)組成部分，而這個(gè)整體有包含了小的層次的整體，小的局部組成。④整體規(guī)律的類似性：一物生來有一身，一物自有一乾坤。每個(gè)整體都是從類似規(guī)律演化而來，從無極演化，有太極，從這太極演化陰陽，以至這一整體全部。⑤整體的進(jìn)化性：宇宙從無極逐漸演化太極，以至現(xiàn)在的萬物，在發(fā)展至人這個(gè)宇宙最高級的生命個(gè)體，便是整體演化的最好的證明。

氣是中醫(yī)學(xué)的核心?，F(xiàn)代醫(yī)學(xué)是從有形的結(jié)構(gòu)上研究，形是氣所聚，形散為氣，氣是形的場，形氣是統(tǒng)一的。氣是整體的體現(xiàn)。 那么從形氣理論的兩種醫(yī)學(xué)也是可以統(tǒng)一的。

整體性是貫穿人體宏觀和微觀的根本。從宏觀逐漸微觀，每一層次都是結(jié)構(gòu)和功能的統(tǒng)一，每一層次都服從統(tǒng)一的整體性，而整體性是每一層次運(yùn)動(dòng)聯(lián)系的根本。這個(gè)的整體規(guī)律就是中醫(yī)基礎(chǔ)理論，這個(gè)規(guī)律指導(dǎo)著每一層次的運(yùn)動(dòng)和相互作用。

4 建立中醫(yī)基因組學(xué)

基因組是現(xiàn)代生物學(xué)還原到分子的體現(xiàn)，由此生命科學(xué)開始轉(zhuǎn)向整體科學(xué)?，F(xiàn)在的功能基因組學(xué)就是這一轉(zhuǎn)向的體現(xiàn)?；蚪M是整體科學(xué)與還原科學(xué)的交匯點(diǎn)。

基因組是人體的微觀信息調(diào)控中心，更體現(xiàn)了人體的整體性。它是人的精氣的凝聚態(tài)，含有生命的全部信息。宏觀人體整體和微觀的人體基因組整體性是統(tǒng)一的和同源的，基因組整體是由五臟功能模塊組成，這五臟又有亞細(xì)的模塊組成，這亞細(xì)的模塊又有更微小的基因模塊組成，各個(gè)大模塊亞細(xì)模塊之間存在協(xié)調(diào)的相互關(guān)系，這個(gè)關(guān)系就是微觀經(jīng)絡(luò)系統(tǒng)?；蚬δ苣K由相應(yīng)的基因組成，基因組整體是結(jié)構(gòu)和功能統(tǒng)一的整體。建立中醫(yī)特色的基因組學(xué)是為了完善中醫(yī)藥學(xué)理論，發(fā)展整體醫(yī)學(xué)。建立微觀基因組整體辨證論治，并沒有否定傳統(tǒng)意義上的辨證論治觀，而是將其發(fā)展一步，深入到基因組整體內(nèi)部，將整體觀深入到基因組整體中，將宏觀整體辨證和微觀基因組整體辨證結(jié)合起來，建立了一個(gè)從外至里、從里至外的整體的辨證論治觀，建立宏觀和微觀統(tǒng)一的整體的辨證體系。這才是科學(xué)的完整的辨證論治觀。

建立中醫(yī)基因組學(xué)是為了在基因研究的基礎(chǔ)上，結(jié)合證候研究，證明中醫(yī)證候理論的正確性；進(jìn)而在分子基礎(chǔ)上證明中醫(yī)臟腑經(jīng)絡(luò)理論的正確性，最后深入基因組研究，深入了解基因組所蘊(yùn)含的生命本質(zhì)以及生命的發(fā)展。

中醫(yī)基因組學(xué)的建立是中醫(yī)現(xiàn)代化走向未來的一個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)，整體科學(xué)與還原科學(xué)都在這一尖端領(lǐng)域進(jìn)行著研究，而中醫(yī)學(xué)進(jìn)入這一領(lǐng)域，一可以完善自己的理論體系，解譯基因組所包含的全部生命信息，促進(jìn)人類的健康事業(yè)；二則可以引導(dǎo)還原科學(xué)的整體化演變。

5 中醫(yī)心理學(xué)的發(fā)展

這是中醫(yī)心理學(xué)與現(xiàn)代心理學(xué)結(jié)合的關(guān)鍵點(diǎn)。也是中醫(yī)現(xiàn)代化的另一個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)。

中醫(yī)心理學(xué)原來是中醫(yī)學(xué)的一個(gè)分支，以心理的整體功能為本體論述人的心理的，講的是人的先天功能。傳統(tǒng)中醫(yī)學(xué)建立在遠(yuǎn)古極端落后的社會經(jīng)濟(jì)條件下，人們看不出人的社會本質(zhì)和社會發(fā)展，而現(xiàn)代社會條件下，人的心理與健康都受到了社會的極大影響，發(fā)生了很大改變，中醫(yī)心理學(xué)也必須隨時(shí)代的發(fā)展而發(fā)展。

現(xiàn)代心理學(xué)是以人的大腦的具體結(jié)構(gòu)為生理基礎(chǔ)，論述人在社會中的各種行為性格等，這是人的后天功能，對人們的各種行為意識均有科學(xué)的描述。但是現(xiàn)代心理學(xué)沒有與人的整體功能結(jié)合在一起，沒有指出人的根本的社會本質(zhì)，所以其發(fā)展也是有局限的?，F(xiàn)代心理學(xué)是建立在還原論基礎(chǔ)上的，而人的心理是整體的，所以它本身具有很大的缺陷。

人的各種語言、行為以及意識思維等都是在人的元神的支配下進(jìn)行的，元神是最根本的自我。而心理的進(jìn)行是在社會背景條件下的，一切心理行為都有社會背景的，社會背景形成了人的心理模塊、人格模式，人格模式下的元神系統(tǒng)構(gòu)成了人的社會自我，心理的行為是在元神的支配下通過心理模塊進(jìn)行的，以此結(jié)合這兩個(gè)心理學(xué)，可以從根本上解決人的心理問題。佛學(xué)對人的心性理論有深刻認(rèn)識，但是借鑒之前必須徹底拋棄佛學(xué)所具有的唯心思想，心性理論中性與元神相關(guān)，而心與元神、元神支配下形成的人格模式有關(guān)。

元神可以接受信息，加工、儲存、提取信息，發(fā)放信息三個(gè)方面。人出生時(shí)意識是白凈的，但是在人從出生開始，人就在不斷接受信息，在一定社會文化背景下不斷學(xué)習(xí)，不斷加深信息，積累信息，使元神中的信息不斷強(qiáng)化與激活而得到強(qiáng)化，最終形成了比較固定的人格參照模式。這個(gè)模式一旦形成，就形成了新進(jìn)入信息的文化背景，形成了人各種意識、行為的模板，形成了特定的性格模式。人的性格模式是在元神支配下形成的，但是性格模式一旦形成就對人的元神人的生理發(fā)生作用，形成了人的后天行為的文化背景和模式。人的性格模式與人的后天社會文化環(huán)境有很大關(guān)系，它也不是固定不變的。

中醫(yī)心理學(xué)和現(xiàn)代心理學(xué)是功能與應(yīng)用的結(jié)合。元神是人的整體功能，人的五臟情志、七情等都是人的元神功能的一個(gè)方面，但是這些情志的發(fā)生必然受到人的性格模式的影響，性格模式又決定了情志的發(fā)生模式。中醫(yī)心理學(xué)和現(xiàn)代心理學(xué)都是不完整的，各講述了人心理的一個(gè)方面，結(jié)合起來才是真正的人的心理整體過程。

人的心理在當(dāng)今社會是一個(gè)比較陌生的領(lǐng)域，佛學(xué)、現(xiàn)代心理學(xué)、中醫(yī)心理學(xué)都有各自的認(rèn)識，但是它們又不是完全的，正確的認(rèn)識是將它們結(jié)合起來，建立科學(xué)的辨證唯物主義的整體的心理學(xué)體系?，F(xiàn)代中醫(yī)心理學(xué)的建立不但解決了人的意識的根本問題，促進(jìn)人類的心理健康發(fā)展，而是還對社會的發(fā)展有很大的潛在的作用。

6 結(jié)論

第6篇：基因組學(xué)發(fā)展范文

組學(xué)研究?大規(guī)模隊(duì)列試驗(yàn)和數(shù)據(jù)處理是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的核心?精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是綜合個(gè)體遺傳因素及環(huán)境因素信息與表型關(guān)聯(lián)的個(gè)體化醫(yī)學(xué)模式,是在大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)下的一門多學(xué)科交叉學(xué)科?鑒于我國巨大的醫(yī)療資源需求的現(xiàn)狀,研究和實(shí)施適合我國國情的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃旨在解決以“群體”為對象的傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)診斷誤差大?用藥非精準(zhǔn)以及醫(yī)療資源浪費(fèi)大的難題,具有積極的社會意義和經(jīng)濟(jì)意義?本文就精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的提出和發(fā)展基礎(chǔ),以及國內(nèi)相關(guān)研究進(jìn)展進(jìn)行綜述?

1從循證醫(yī)學(xué)到精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)

在2008年提出以表述分子診斷使得醫(yī)生不用依賴于直覺和經(jīng)驗(yàn)便可以明確診斷?循證醫(yī)學(xué)時(shí)代強(qiáng)調(diào)“群體”的臨床證據(jù),而忽視了“個(gè)體”的復(fù)雜性以及“個(gè)體”的遺傳特性和環(huán)境因素的差異性?循證醫(yī)學(xué)過分關(guān)注群體統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,忽視了臨床實(shí)踐的真正意義;而精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)正是關(guān)注于“個(gè)體”:這便決定未來的醫(yī)學(xué)模式將從循證醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)變?yōu)榫珳?zhǔn)醫(yī)學(xué)?“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)(precision medicine)”一詞最早是由哈佛大學(xué)商學(xué)院商業(yè)戰(zhàn)略家Clayton Christensen但是,當(dāng)時(shí)這個(gè)描述并沒有引起太多的關(guān)注?2011年美國國立研究委員會下屬的“發(fā)展新疾病分類法框架委員會”發(fā)表的《邁向精準(zhǔn)醫(yī)學(xué):建立一個(gè)生物醫(yī)學(xué)知識網(wǎng)絡(luò)和一個(gè)新疾病分類法框架》藍(lán)圖,作為“個(gè)體化醫(yī)學(xué)”的新表述形式,“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”才開始被廣泛重視?精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是指為每位病患的個(gè)體特征制定醫(yī)療方案,根據(jù)對某種疾病的易感性或特定治療方案的反應(yīng)將患者個(gè)體分成亞群;然后將預(yù)防或治療措施集中于有效病患,而免去給無效患者帶來費(fèi)用和副作用?“精準(zhǔn)”包括“準(zhǔn)確(accurate)”和“精密(precise)”兩重含義?精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)根據(jù)病人個(gè)體特異性制定個(gè)性化精準(zhǔn)預(yù)防?精準(zhǔn)診斷和精準(zhǔn)治療方案,是具有顛覆性的醫(yī)學(xué)新模式?2015年初,奧巴馬政府在國情咨文中提出美國的“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃(precision medicine initiative,PMI)”,并為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃的5個(gè)具體內(nèi)容在2016財(cái)年預(yù)算案中提出2.15億美元預(yù)算?“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃”是以遺傳信息的發(fā)現(xiàn)和人類基因組計(jì)劃的實(shí)施為基礎(chǔ),依靠百萬志愿者的基因組信息和臨床信息的大數(shù)據(jù)來支撐癌癥與其它多基因病研究,轉(zhuǎn)變相關(guān)管理部門的監(jiān)管方式,尋求公立機(jī)構(gòu)和私立機(jī)構(gòu)良好合作的大型全國性乃至全球性前瞻性項(xiàng)目?從循證醫(yī)學(xué)到精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是一個(gè)粗放到精確的過程:循證醫(yī)學(xué)關(guān)注于“群體”統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)則關(guān)注于“個(gè)體”組學(xué)特征;循證醫(yī)學(xué)強(qiáng)調(diào)隨機(jī)對照數(shù)據(jù),精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)強(qiáng)調(diào)分子生物學(xué)證據(jù)?

2精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究的核心和基礎(chǔ)

基因組研究中新產(chǎn)生的流行病學(xué)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為與未來臨床應(yīng)用相關(guān)的信息?組學(xué)技術(shù)的質(zhì)量和標(biāo)準(zhǔn)是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的關(guān)鍵之一?精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)臨床轉(zhuǎn)化的基礎(chǔ)和關(guān)鍵環(huán)節(jié):通過對患者遺傳特性的研究和分型,在我國原創(chuàng)抗癌新藥西達(dá)本胺(組蛋白去乙?；敢种苿?的研發(fā)和上市過程中,藥物基因組學(xué)便起到了極大的促進(jìn)作用?精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究的主要目的是通過標(biāo)準(zhǔn)化的各種大型的隊(duì)列研究和多種組學(xué)研究,尋找疾病的新的生物標(biāo)志物以完善疾病分類;完善后的新疾病分型通過藥物基因組學(xué)等手段進(jìn)行臨床轉(zhuǎn)化,達(dá)到個(gè)體化的精準(zhǔn)醫(yī)療(Fig 2)?其中大型隊(duì)列研究是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的核心;多種組學(xué)研究是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的基礎(chǔ),其中藥物基因組學(xué)?藥物表觀基因組學(xué)以及藥物蛋白組學(xué)等是精準(zhǔn)醫(yī)療臨床轉(zhuǎn)化的橋梁;大數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化處理與發(fā)掘是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的重要憑據(jù)?

2.1大型隊(duì)列研究

作為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究的核心,大規(guī)模隊(duì)列研究通過對大規(guī)模健康和疾病人群的隨訪信息和臨床樣本的收集,進(jìn)行多層次綜合性的組學(xué)研究,有利于發(fā)現(xiàn)疾病早期診療的生物標(biāo)志物?其中新藥臨床試驗(yàn)由于規(guī)范度高?標(biāo)準(zhǔn)化好等優(yōu)勢,是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)大規(guī)模隊(duì)列研究中規(guī)范樣本和表型數(shù)據(jù)的重要來源?醫(yī)院生物樣本和臨床信息是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的寶貴資源和重要前提,由于其復(fù)雜的多樣性,其可靠性成為決定精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)成敗的關(guān)鍵?

歐洲癌癥與營養(yǎng)關(guān)系的前瞻研究計(jì)劃(european pro-spective investigation into cancer and nutrition,EPIC)自二十世紀(jì)末起開始調(diào)查膳食?代謝及遺傳因素與癌癥發(fā)病之間的關(guān)系?EPIC通過對10個(gè)歐洲國家的50萬余人群的長期隨訪(其中2.6萬人后期發(fā)展為癌癥),以及對900萬例樣本的收集和分析,研究了不同膳食類型?遺傳多態(tài)性等與癌癥發(fā)生發(fā)展的關(guān)系?其研究結(jié)果對降低癌癥發(fā)病率?減輕癌癥患者的痛苦并延長患者的生存期具有積極的意義?

第7篇：基因組學(xué)發(fā)展范文

代表團(tuán)首先參觀考察了以色列農(nóng)業(yè)研究院Newe Yaar研究中心。該中心研究人員詳細(xì)講解了中心各部門的研究內(nèi)容，甜瓜分子遺傳與育種部門負(fù)責(zé)人Kobi研究員就西瓜和甜瓜果實(shí)發(fā)育轉(zhuǎn)錄組學(xué)、西瓜甜瓜糖積累和調(diào)控關(guān)鍵基因定位進(jìn)行深入講解。期間許勇研究員與Kobi研究員重點(diǎn)討論了西瓜和甜瓜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分享以及對中國-以色列國際合作項(xiàng)目的申請和合作方案進(jìn)行了討論。

圖1 國家西甜瓜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系代表團(tuán)訪問

以色列農(nóng)業(yè)研究院Newe Yaar研究中心

代表團(tuán)考察了以色列新興育種公司Kaiima，公司負(fù)責(zé)人向代表團(tuán)一行講解了該公司獨(dú)創(chuàng)的育種技術(shù)。該公司以非轉(zhuǎn)基因工程為主要思路，以多倍體及雜種優(yōu)勢為主要育種技術(shù)，已經(jīng)育成的四倍體雜交玉米、水稻品種，十二倍體小麥、四倍體油菜、三倍體黃瓜等，有些已經(jīng)推向市場，在多倍體誘導(dǎo)過程中，通過控制染色體復(fù)制時(shí)紡錘絲對中心粒的牽引這一項(xiàng)專利技術(shù)，不損傷染色體與DNA。代表團(tuán)實(shí)地觀察了十二倍體小麥、四倍體油菜等作物植株長勢和產(chǎn)量情況，為體系育種研發(fā)提供了可借鑒思路與技術(shù)路線。

代表團(tuán)在土耳其當(dāng)?shù)赜N專家Derya Güne帶隊(duì)參觀歐洲最大的蔬菜產(chǎn)區(qū)Kumucia，實(shí)地考察了黃瓜、西葫蘆、辣椒、番茄和茄子等生產(chǎn)基地，詳細(xì)了解當(dāng)?shù)氐臍夂驐l件、蔬菜種子來源、蔬菜產(chǎn)量和蔬菜種植農(nóng)戶的人均收入水平等。當(dāng)?shù)刈畲蟮挠缙髽I(yè)DURAN FIDE是當(dāng)?shù)?0個(gè)育苗工廠之一，擁有自動(dòng)點(diǎn)播機(jī)、大型溫室和大型人工氣候室等先進(jìn)設(shè)備。本代表團(tuán)一行獲得了當(dāng)?shù)赜N公司、育苗廠及本地媒體的重視，當(dāng)?shù)孛襟w對代表團(tuán)的來訪予以報(bào)道并刊登于當(dāng)?shù)刂髁髅襟w上。

圖3 西甜瓜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系成員參加

2012年歐洲植物育種研究學(xué)會

代表團(tuán)在土耳其安塔利亞參加了2012年歐洲植物育種研究學(xué)會葫蘆科植物遺傳育種大會，在葫蘆科作物全基因組測序完成的今天，如何有效利用海量的全基因組數(shù)據(jù)，挖掘葫蘆科作物的抗病性、抗逆性、商品品質(zhì)關(guān)鍵基因，并最終應(yīng)用于優(yōu)異種質(zhì)資源的高效篩選是目前國際上葫蘆科作物基因組學(xué)研究的熱點(diǎn)。首席許勇研究員作為大會學(xué)術(shù)委員會委員，在大會上做了“西瓜轉(zhuǎn)錄組、糖積累和代謝研究”的主題報(bào)告，中國多名專家也做了口頭報(bào)告與墻報(bào)。來自美國、法國、土耳其、西班牙、以色列、日本等國家和地區(qū)的葫蘆科作物研究領(lǐng)域的Amnon Levi、Davis Angela、Garcia Mas Jordi、Kotch George 和Todd C. Wehner等200余位權(quán)威學(xué)者就西瓜果實(shí)成熟基因表達(dá)、甜瓜果實(shí)成熟基因表達(dá)譜、甜瓜糖含量基因QTL定位、西瓜漸滲系的構(gòu)建、西瓜糖含量基因QTL定位等研究結(jié)果進(jìn)行了深入交流和探討。會議期間，與波蘭華沙大學(xué)交流了他們在黃瓜隱性gg雌性系基因克隆的進(jìn)展并交換了意見。Ray D. Martyn、M.Babadoost等專家就瓜類枯萎病、美國的瓜類細(xì)菌性果斑病的研究結(jié)果進(jìn)行了交流。體系病蟲害防控研究室主任趙廷昌研究員就相關(guān)問題作了討論交流，國外科學(xué)家特別提示代表團(tuán)：瓜類細(xì)菌性果斑病需要你們在國內(nèi)普查和研究。中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所劉研究員、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院欒非時(shí)院長、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝林學(xué)學(xué)院別之龍教授及湖南省蔬菜研究所陳惠明研究員等也分別就自己研究領(lǐng)域和國外專家作了深入的交流和討論，對今后研究思路的確立及深入開展工作起到一定借鑒作用。

會議期間代表團(tuán)還參觀考察了土耳其著名育種公司YUKSEL TOHUMCLUK，該公司占有土耳其國內(nèi)25% 的蔬菜種子市場份額，擁有40公頃的蔬菜育種與繁種溫室，同時(shí)還參觀了瑞克斯旺（RIJK ZWAAN）種業(yè)公司土耳其分公司。代表團(tuán)了解了各公司的西瓜、甜瓜、黃瓜、西葫蘆和辣椒等品種類型，溫室消毒及肥水一體化技術(shù)的應(yīng)用。最后參觀了BATI AKDENIZ AGRICULTURAL RESEACH INSTITUTE農(nóng)業(yè)研究所，了解了土耳其公益性蔬菜研究所的體制與運(yùn)行機(jī)制以及資源與品種等。

第8篇：基因組學(xué)發(fā)展范文

關(guān)鍵詞高通量測序；基因組；林木育種

中圖分類號S722.3文獻(xiàn)標(biāo)識碼A文章編號 1007-5739（2013）12-0130-03

ApplicationsofHigh-throughputSequencinginForestTreeBreeding

TIAN BinXIN Pei-yaoZHANG Xue-juanWANG Da-weiHE Cheng-zhong *

（Key Laboratory of Biodiversity Conservation in Southwest China，State Forestry Administration，Southwest Forestry University，Kunming Yunnan 650224）

AbstractForest trees are not only the important renewable resources which can meet the essential needs of humans，but also the most important part of the terrestrial ecosystems. Traditional breeding methods have largely contributed to the development of forest tree breeding，but it is difficult to meet human′s needs for forest resources. Nowadays，the availability of genomic tools and resources is leading to a new revolution of plant breeding，as they facilitate the study of the relationship between the genotype and the phenotype，in particular for complex traits. With high-throughput sequencing technique，you can explore functional gene and its precise positioning by a new genetic mapping strategy. In this paper，the author reviewed the progress in tree genomic and genetic breeding，and prospected the future achievements in order to provide a useful reference for researchers working in this area.

Key wordshigh-throughput sequencing；genome；forest tree breeding

林木不僅是重要的可再生資源，為人類提供了衣、食、住、行等最基本的原材料，而且是陸地生態(tài)系統(tǒng)最重要的組成部分。其包含80%以上的陸地生物量，為超過50%的陸地生物提供庇護(hù)所。同時(shí)，林木還提供了生物多樣性保護(hù)、碳沉積、氣候調(diào)節(jié)、水源涵養(yǎng)等多種重要的生態(tài)服務(wù)，并且從一定程度上塑造了人類多樣性的文化[1-2]。

當(dāng)前，隨著全球氣候的不斷惡化和能源危機(jī)的持續(xù)發(fā)酵，對生態(tài)系統(tǒng)特別是森林生態(tài)系統(tǒng)的保護(hù)和利用已成為一個(gè)世界性的課題。利用遺傳學(xué)的方法對林木進(jìn)行改良能夠充分利用自然生產(chǎn)潛力，提高林產(chǎn)品產(chǎn)量和品質(zhì)，增強(qiáng)林木抗性以及充分發(fā)揮林木的多種生態(tài)效益。然而，與水稻、玉米等其他草本農(nóng)作物育種的高速發(fā)展不同，林木的生長周期較長，并且基因組普遍比較大，使得通過反向遺傳學(xué)的方法找尋和精確定位優(yōu)良突變受到限制，因此林木育種整體研究進(jìn)展緩慢。

傳統(tǒng)的育種學(xué)方法已經(jīng)難以滿足人類對林產(chǎn)品的快速需求。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的飛躍式發(fā)展，大量的分子標(biāo)記被運(yùn)用到林木遺傳育種中，然而無論是通過實(shí)驗(yàn)遺傳學(xué)還是比較遺傳學(xué)的方法都在對基因快速準(zhǔn)確的分析定位上受到了一定的限制。在林木中構(gòu)建較高密度的遺傳圖譜不僅耗時(shí)耗力，而且得到的信息量較少[3]。1975年英國生化學(xué)家Frederick Sanger發(fā)明了末端終止法DNA測序技術(shù)[4]，打開了解讀生命“天書”的大門。但是利用Sanger測序的方法得到一個(gè)高等生物的全基因組序列需要花費(fèi)大量的時(shí)間和資金，基因組學(xué)在生命科學(xué)領(lǐng)域中的廣泛應(yīng)用也受到一定的限制。然而，21世紀(jì)以來基于高通量的第2代和第3代測序技術(shù)的出現(xiàn)使得基因組測序所需的時(shí)間和成本大大降低，讓以前遙不可及的基因組測序工作簡單到一個(gè)實(shí)驗(yàn)室都可以進(jìn)行。以2006年毛果楊（Populus trichocarpa）全基因組序列的為契機(jī)[5]，林木遺傳育種學(xué)研究從基本遺傳平臺構(gòu)建研究的初始階段，快速進(jìn)入到以功能基因組研究為代表的后基因組時(shí)代。該文概述了林木基因組學(xué)研究的進(jìn)展，探討了高通量測序技術(shù)對林木遺傳育種帶來的機(jī)遇和挑戰(zhàn)，以為我國林木遺傳育種學(xué)研究提供有益的參考。

第9篇：基因組學(xué)發(fā)展范文

關(guān)鍵詞： 功能基因組； 西瓜； 甜瓜； 黃瓜

功能基因組學(xué)（functional genomics），又被稱為后基因組學(xué)（post-genomics），它是利用結(jié)構(gòu)基因組學(xué)提供的豐富信息和產(chǎn)物，借助高通量、大規(guī)模的試驗(yàn)分析方法，在全基因組或系統(tǒng)水平上研究基因的功能，弄清生物體中各組分是如何工作并形成有功能的細(xì)胞、組織及整個(gè)生物體[1]。其目標(biāo)是明確基因組中全部基因的功能， 揭示植物生長發(fā)育、環(huán)境應(yīng)答互作的分子網(wǎng)絡(luò)， 從而全面闡釋植物的生物學(xué)基礎(chǔ)。目前，水稻、擬南芥等模式植物功能基因組學(xué)研究發(fā)展較快，近幾年隨著科技進(jìn)步和資金投入的不斷增加，葫蘆科作物基因組研究也取得了一定的成果。西瓜基因組全長約425 Mb，甜瓜約450 Mb，黃瓜約376 Mb[2]， 基因組大小比較適合開展基因組測序和功能基因組研究。2007年由西班牙牽頭組織，美國、中國、法國、以色列、日本等國家的14個(gè)實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合啟動(dòng)了國際葫蘆科基因組計(jì)劃（International Cucurbit Genomics Initiative，ICuGI），該計(jì)劃為瓜類蔬菜的基因組學(xué)研究奠定了良好的技術(shù)平臺。在此基礎(chǔ)上，2008年相繼啟動(dòng)了葫蘆科三大作物西瓜、甜瓜、黃瓜的全基因組測序計(jì)劃[3]。隨著基因組測序工作的陸續(xù)完成，瓜類作物基因組研究逐步進(jìn)入到功能基因組研究時(shí)代。本文綜述了近些年植物功能基因組學(xué)主要研究方法在西瓜、甜瓜以及黃瓜上的應(yīng)用概況。

1 高通量、大規(guī)模EST測序及功能解析

EST（Express Sequence Tag）是指通過對cDNA 文庫中隨機(jī)挑取的克隆進(jìn)行大規(guī)模測序所獲得的cDNA 的5’或3’端序列，長度一般為150～500 bp。EST是基因編碼序列的一部分，通過與數(shù)據(jù)庫中已知功能的基因序列進(jìn)行對比，從理論上可推測其基因功能。EST已發(fā)展成為新基因發(fā)現(xiàn)的有效途徑，也是植物功能基因組學(xué)研究的重要工具。隨著測序技術(shù)的不斷改良和測序成本的降低，高通量、大規(guī)模EST測序及功能解析開始廣泛應(yīng)用。

西瓜EST研究方面，A. Levi 等[4]通過與葉片cDNA消減雜交構(gòu)建了西瓜果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期（授粉后12、24、36 d）果肉消減cDNA文庫，獲得了832條無冗余EST，序列比對分析表明有410個(gè)EST-unigenes與已知編碼蛋白的基因同源，按功能歸類分屬于初級代謝、氨基酸合成組裝、細(xì)胞膜運(yùn)輸、細(xì)胞分裂、細(xì)胞壁代謝、細(xì)胞骨架和細(xì)胞形成、基因轉(zhuǎn)錄和表達(dá)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、抗性防御和次級代謝。這些潛在的功能基因序列為日后開展西瓜果實(shí)發(fā)育和品質(zhì)形成的遺傳與功能基因組研究奠定了基礎(chǔ)。呂桂云等[5]通過構(gòu)建枯萎病菌誘導(dǎo)的西瓜根系組織SSH-cDNA文庫，對測序獲得的4 431條高質(zhì)量EST序列進(jìn)行聚類拼接，獲得1 756個(gè)非重復(fù)序列，基因功能分類表明抗病與防御相關(guān)基因約占36.3%，對獲得的西瓜與枯萎病非親和互作中部分特異性表達(dá)的基因進(jìn)行了初步探討，發(fā)現(xiàn)可能參與西瓜與枯萎病菌非親和互作的轉(zhuǎn)錄因子、激酶和防衛(wèi)基因及茉莉酸和木質(zhì)素2個(gè)主要代謝途徑。Guo等[6]采用Roche/454新一代測序技術(shù)，從西瓜4個(gè)果實(shí)發(fā)育期（授粉后10、18、26、34 d）獲得了577 023個(gè)高質(zhì)量EST，組裝成了75 068個(gè)unigenes，有54.9% 的unigenes與GeneBank中的已知基因同源，其中2/3來源于黃瓜。Gene Ontology （GO）注釋表明，有33 853個(gè)unigenes（45.1%）獲得至少1個(gè)GO術(shù)語，被注釋序列的基因功能分屬于分子功能（molecular function）類別、生物過程（biological process）類別和細(xì)胞組分（cellular component）類別，所占比例分別為38.6%、38.6%和36%，另外大約29%的unigenes同時(shí)具有以上3種功能分類。生物過程類別的基因主要參與細(xì)胞過程、代謝過程和生物合成過程，表明果肉組織在發(fā)育過程中發(fā)生了廣泛的代謝活動(dòng)。數(shù)字基因表達(dá)譜分析及實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證表明有3 023個(gè)基因在果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期存在顯著的表達(dá)差異，表達(dá)量差異至少在2倍以上。研究發(fā)現(xiàn)細(xì)胞壁相關(guān)基因在未成熟白瓤果肉組織中高效表達(dá)，而類葫蘆卜素代謝基因（八氫番茄紅素合成酶和番茄紅素-β環(huán)化酶）、蔗糖代謝基因（蔗糖磷酸合成酶、蔗糖合成酶）在果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期差異表達(dá)明顯，作者對與果實(shí)品質(zhì)相關(guān)的一些生化途徑如纖維素合成、木栓質(zhì)合成、葡萄糖合成降解以及淀粉合成降解等進(jìn)行了進(jìn)一步鑒定。

甜瓜大規(guī)模EST測序及功能解析方面，Nurit Katzir等[7]通過構(gòu)建甜瓜EST數(shù)據(jù)庫，從4 800條序列中鑒定出與甜瓜果實(shí)香味代謝相關(guān)的3類基因家族，乙醇乙酰轉(zhuǎn)移酶、倍半萜合酶和類胡蘿卜素裂解雙加氧酶，克隆得到候選基因的全長序列，研究了這些基因在不同甜瓜品種間的表達(dá)模式。Daniel Gonzalez-Ibeas等[8]通過對8個(gè)來源于甜瓜不同組織和生理狀態(tài)的cDNA文庫（包括授粉后15 d和46 d的2個(gè)果實(shí)的文庫）測序和序列拼接、組裝，獲得16 637個(gè)無冗余EST。通過與擬南芥基因組做生物信息學(xué)比對分析，發(fā)現(xiàn)眾多個(gè)與果實(shí)發(fā)育相關(guān)的基因，如ACC合成酶、ACC氧化酶、細(xì)胞壁代謝酶、類胡蘿卜素合成代謝酶、MADS-box 基因等。實(shí)時(shí)定量PCR表明在果實(shí)成熟期乙烯受體基因EIN4表達(dá)量翻倍，表明該基因與果實(shí)成熟期乙烯信號調(diào)控相關(guān)。MADS-box 基因SVP在果實(shí)成熟期表達(dá)量下降了4倍，番茄紅素ε環(huán)化酶基因（LUT2）和木葡聚糖內(nèi)糖基轉(zhuǎn)移酶基因（TCH4）表達(dá)量也下降了4倍。2011年，Christian Clepet等[9]構(gòu)建了4個(gè)不同類型甜瓜品種不同植物組織的11個(gè)全長cDNA文庫和4個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化cDNA文庫，分別獲得71 577 條和22 179條EST，能夠組裝成24 444條unigenes，基因?qū)Ρ蕊@示有75%～85%的序列與雙子葉植物同源，70%與單子葉植物同源，有6 972個(gè)基因家族在雙子葉植物和單子葉植物間具有保守性。對數(shù)字基因表達(dá)譜研究，結(jié)果表明有175個(gè)基因?yàn)榻M織特異表達(dá)，這些基因?yàn)槲磥黹_展功能基因組研究提供了寶貴的資源。作者從這些序列中鑒定出了4 068個(gè)SSR和3 073個(gè)SNP，并對1 382個(gè)全長轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了分析。為了解甜瓜對鹽脅迫的抗性反應(yīng)機(jī)制，Shiwei Wei等[10]構(gòu)建了耐鹽甜瓜品種根系組織的抑制消減雜交（SSH）cDNA文庫，測序獲得262條uni-ESTs，有161條序列與已知基因高度同源，128條與未知功能基因同源，有很多基因顯示與生物和非生物脅迫相關(guān)。研究表明，甜瓜耐鹽受眾多蛋白質(zhì)調(diào)控，這些蛋白涉及細(xì)胞代謝、能量、轉(zhuǎn)錄、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)命運(yùn)以及細(xì)胞拯救和防御等生物過程，表明甜瓜作物耐鹽存在復(fù)雜的抗性反應(yīng)機(jī)制。

在黃瓜上面，Dae-Jae Kim[11]構(gòu)建了黃瓜子葉生長不同時(shí)期的cDNA文庫，篩選出大量與衰老相關(guān)的基因，利用半定量RT-PCR分析了365個(gè)克隆，發(fā)現(xiàn)有很多基因表達(dá)量提高，這些基因有些功能已知，有些功能未知。齊曉花等[12]采用SMART 技術(shù)構(gòu)建了高抗白粉病的黃瓜品系JIN5-508 的葉片cDNA文庫，利用該文庫隨機(jī)挑選的8 352個(gè)克隆從5’端進(jìn)行單向測序，共獲得8 035個(gè)有效的ESTs，序列的平均長度為838 bp。從文庫中篩選出了大量的低豐度表達(dá)基因，約占unigene總數(shù)的72.5%，1 991個(gè)unigenes 獲得分子功能注釋，其中與蛋白結(jié)合活性和催化活性相關(guān)的基因分別達(dá)到了41.34%和38.72%；在獲得功能注釋的unigene 中，有部分抗病抗逆相關(guān)基因高豐度表達(dá)，其中3個(gè)unigenes與擬南芥白粉病抗性基因Mlo2、Mlo8 和Mlo14 高度同源。盛慧等[13]利用抑制性消減雜交技術(shù)（SSH）構(gòu)建黃瓜胚胎發(fā)育早期和晚期差異表達(dá)cDNA文庫，經(jīng)反向Northern blot雜交檢測，共得到97個(gè)陽性克隆。利用分子生物學(xué)軟件對測序后的序列進(jìn)行質(zhì)量檢測和聚類、拼接，共得到93個(gè)Uni-ESTs，其中包括86個(gè)singletons 和7個(gè)contigs。將上述EST序列在GenBank上進(jìn)行BLAST比對，有83個(gè)EST片段找到了與之匹配的同源序列，有10 個(gè)EST片段未找到同源序列，推測可能是新基因。其中很多EST與擬南芥、水稻或玉米蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的熱激蛋白具有很高的同源性。將以上序列進(jìn)行功能分類，發(fā)現(xiàn)在胚胎發(fā)育早期細(xì)胞防御和代謝過程占主要位置，而在胚胎發(fā)育晚期細(xì)胞防御和抗?jié)B透脅迫功能是非常重要的。Guo等[14]以黃瓜全雌系和雌雄同株系測序獲得353 941條EST，其中188 255條來源于全雌花，165 686條來源于雌雄花，結(jié)合5 600條GeneBank收錄的EST和mRNA序列，組裝成了81 401條unigenes。通過基因功能注釋和分析，預(yù)測了343個(gè)生化代謝途徑。對數(shù)字基因表達(dá)分析，表明大約200個(gè)基因在不同花性型存在差異表達(dá)，為研究植物花分化的分子機(jī)理提供了新的認(rèn)識。潘宇等[15]構(gòu)建了黃瓜授粉前后多個(gè)發(fā)育階段的幼果組織cDNA文庫，測序獲得116條EST，92.2% 的長度在400 bp以上，19% 為重疊序列。在GeneBank中進(jìn)行BLAST分析后確認(rèn)與已知功能基因相似的EST序列有71條，有相似序列而功能未知的基因和沒有相似序列的EST序列各占19.83% 和18.97%。

2 TILLING技術(shù)

TILLING（targeting induced local lesions in

genomes，定向誘導(dǎo)基因組局部突變技術(shù)），該技術(shù)借助高通量、標(biāo)準(zhǔn)化的檢測手段，快速有效地從經(jīng)化學(xué)誘變劑（EMS）誘變過的突變?nèi)后w中鑒定出點(diǎn)突變。與傳統(tǒng)的插入突變比，TILLING技術(shù)利用傳統(tǒng)的化學(xué)誘變獲得突變體，不需要耗時(shí)的轉(zhuǎn)基因和復(fù)雜的組織培養(yǎng)過程，具有高通量、低成本、高效率等諸多優(yōu)勢。目前，TILLING作為一種全新的反向遺傳學(xué)研究方法已經(jīng)用于多種植物。

TILLING技術(shù)在葫蘆科作物上的應(yīng)用主要集中在甜瓜方面，2007年，Yaakov Tadmor等[16]最先用EMS誘變構(gòu)建了甜瓜品種Noy Yizreel的突變基因庫，共產(chǎn)生3 000個(gè)M2家系，發(fā)現(xiàn)了大量新的表型突變，大部分為隱性單基因控制。Fatima Dahmani-Mardas等[17]建立了甜瓜品種Char Mono （Cucumis melo L. subsp. melo var. cantalupensis）的TILLING技術(shù)平臺，CharMono系雌雄同株、呼吸躍變型，在M2現(xiàn)了大量子葉、莖蔓、花和果實(shí)發(fā)生的表型突變，利用與果實(shí)品質(zhì)相關(guān)的11個(gè)基因篩選突變株系，發(fā)現(xiàn)大約每隔573 kb會發(fā)生一個(gè)突變，大部分都是G/C 突變成 A/T ，也有G/C 到 C/G，T/A到 A/T和C/G到A/T的變異，外顯子測序表明31.3%為基因沉默突變，65.1%為錯(cuò)義，2.4%為轉(zhuǎn)錄終止，1.2%為拼接剪接突變，氨基環(huán)丙烷羧酸氧化酶基因CmACO1篩選到7個(gè)獨(dú)立的點(diǎn)突變，其中G194D果皮顏色變異明顯，果實(shí)延遲成熟黃化，而果形、可溶性固形物含量和果肉顏色仍然與野生型一樣。G194D自交純合株系也呈現(xiàn)出果實(shí)發(fā)育期延長、果肉變硬和果實(shí)延熟，并且在2個(gè)不同試驗(yàn)地點(diǎn)表現(xiàn)一致，這些表型變異證明了G194D系CmACO1基因突變而來，該研究利用TILLING技術(shù)成功創(chuàng)造了甜瓜品質(zhì)新資源，顯著提高了品種貨架期。Mireia González等[18]建立了甜瓜品種Piel de Sapo （Cucumis melo subsp. melo var. inodorus）的TILLING技術(shù)平臺，Piel de Sapo系雄全同株、非呼吸躍變型，EMS誘變得到2 368個(gè)M2家系，用病毒侵染抗性相關(guān)的2個(gè)基因Cm-eIF4E（核細(xì)胞翻譯起始因子）、eIF（iso）4E（核細(xì)胞翻譯起始因子異構(gòu)體）、4個(gè)與果實(shí)成熟相關(guān)的基因ACO1、Cm-NOR、Cm-DET1、Cm-DHS（脫氧羧腐胺賴氨酸合酶）以及PDS（八氫番茄紅素去飽和酶）篩選突變株系，發(fā)現(xiàn)有4個(gè)Cm-eIF4E等位基因突變，推測其中的2個(gè)改變了蛋白質(zhì)功能，PDS有2個(gè)等位突變，發(fā)生在外顯子的突變改變了蛋白質(zhì)功能，造成了苗期白化表型突變。4個(gè)與果實(shí)成熟相關(guān)的基因在群體中篩選突變，得到8個(gè)突變的家系。徐美紅等[19]用PCR產(chǎn)物直接測序和克隆測序2種方法用于檢測這8個(gè)突變家系的堿基變化。在直接測序中，4個(gè)突變家系的測序結(jié)果清晰，能夠確認(rèn)堿基的變化；其他4個(gè)家系的結(jié)果不清晰，不能確認(rèn)堿基的改變。在克隆測序中，8個(gè)家系的測序結(jié)果均清晰，能夠直接確定目的基因的點(diǎn)突變。在2種方法的比較中，克隆測序的準(zhǔn)確率、效率明顯優(yōu)于直接測序法。

黃瓜方面，以色列的R. Fraenkel等[20]通過EMS誘變獲得了大約1 000個(gè)M2家系，在苗期發(fā)現(xiàn)了諸如植株矮化、子葉自發(fā)病變、黃（花）葉、白化苗、葉片卷曲、窄型黑色子葉等諸多表型突變，利用PDS-3（八氫番茄紅素去飽和酶）篩選突變株系，發(fā)現(xiàn)了4個(gè)突變家系，測序表明堿基突變均發(fā)生于基因內(nèi)含子區(qū)域，因此并未造成相應(yīng)的黃化表型突變。該套突變體庫為黃瓜反向遺傳學(xué)及基因功能研究奠定了很好的基礎(chǔ)。

西瓜作物TILLING技術(shù)的應(yīng)用尚未見正式報(bào)道，美國農(nóng)業(yè)部蔬菜研究實(shí)驗(yàn)室的科學(xué)家目前正在從事相關(guān)的工作，預(yù)計(jì)將很快取得進(jìn)展。

3 DNA芯片

DNA芯片是利用已知基因組序列，或來自未知序列的 cDNA 克隆制備模板 cDNA，通過人工或特定的儀器將大量模板 cDNA 按設(shè)計(jì)好的順序定量地固定在載體上制備成高密度的微陣列。將標(biāo)記好的樣品 cDNA 片段（來自不同細(xì)胞、組織或整個(gè)器官）與模板上的cDNA 進(jìn)行分子雜交。根據(jù)不同材料間基因差異表達(dá)的信息，推論某個(gè)基因的功能或鑒定和分離目的基因。DNA 芯片還廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)譜、突變基因篩選和轉(zhuǎn)基因鑒別等方面。

在西瓜上，Levi 等[4]通過與葉片cDNA消減雜交構(gòu)建了西瓜果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期（授粉后12、24、36 d）果肉消減cDNA文庫。為進(jìn)一步探究這些EST-unigenes在果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期的轉(zhuǎn)錄表達(dá)差異，W. Patrick Wechter等[21]利用微列陣（microarray）技術(shù)對這些EST進(jìn)行了差異表達(dá)分析，發(fā)現(xiàn)與葉片相比，有335個(gè)ESTs的表達(dá)存在明顯的差異，表達(dá)量差異至少在2倍以上。其中有211個(gè)與已知功能基因同源，96個(gè)為未知基因。這些基因參與了維管系統(tǒng)、類胡蘿卜素合成、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、病原和逆境脅迫響應(yīng)以及乙烯合成等，實(shí)時(shí)定量PCR也驗(yàn)證了這些功能基因的差異表達(dá)。

在甜瓜上，張紅等[22]利用國內(nèi)首個(gè)甜瓜cDNA 芯片Melon cDNA array ver1.0檢測了新疆厚皮甜瓜（Cucumis melo var. ameri）果實(shí)基因表達(dá)以及經(jīng)60Co射線輻射誘變后的新疆厚皮甜瓜酸味抗病變異株成熟果實(shí)基因的表達(dá)。結(jié)果顯示，該芯片平均能夠檢測新疆厚皮甜瓜基因2 008個(gè)，檢測出的基因占該芯片基因探針總數(shù)的65.4%。發(fā)現(xiàn)酸味抗病變異株上調(diào)表達(dá)的基因有251個(gè)，占檢出基因總數(shù)的12.5%，下調(diào)表達(dá)的基因224個(gè)，占檢出基因總數(shù)的11.16%。RT-PCR重復(fù)試驗(yàn)表明用Melon cDNA array ver 1.0檢測新疆厚皮甜瓜成熟果實(shí)基因表達(dá)水平是可行的。Daniel Gonzalez-Ibeas等[23]利用抗西瓜花葉病毒甜瓜材料TGR-1551，感病材料Tendral，用DNA 芯片檢測了17 443個(gè)unigenes的表達(dá)，發(fā)現(xiàn)接種感染后TGR-1551比對照發(fā)生了顯著的轉(zhuǎn)錄差異，與空白對照相比，Tendral有 3 291個(gè)unigenes 差異表達(dá)，TGR-1551有2 488個(gè)unigenes 差異表達(dá)，共有677個(gè)unigene unigenes受到抑制表達(dá)。說明TGR-1551發(fā)生了廣泛、深刻的轉(zhuǎn)錄差異。

在黃瓜上，毛偉華等[24]通過GenBank搜索已的生物代謝途徑中的關(guān)鍵酶基因序列， 設(shè)計(jì)特異性引物， 采用RT-PCR法擴(kuò)增這些酶的相應(yīng)基因片段，在完成432個(gè)基因片段的克隆分離、測序和生物信息學(xué)分析工作的基礎(chǔ)上研制出國內(nèi)首張黃瓜cDNA 芯片。該芯片含有9個(gè)質(zhì)控cDN段和423個(gè)cDNA探針， 涉及光反應(yīng)、卡爾文循環(huán)、碳水化合物代謝、水-水循環(huán)、信號傳導(dǎo)、激素代謝、光呼吸、防御、蛋白與氨基酸代謝等多個(gè)代謝途徑。利用該芯片對黃瓜缺鎂脅迫下基因表達(dá)譜進(jìn)行了初步研究， 發(fā)現(xiàn)在缺鎂脅迫下差異表達(dá)的22個(gè)基因， 其中10個(gè)基因的表達(dá)受缺鎂處理抑制， 12個(gè)基因的表達(dá)受缺鎂處理誘導(dǎo)。該芯片的研制為進(jìn)一步研究黃瓜功能基因的高通量時(shí)空變化提供了有效的技術(shù)支撐。為驗(yàn)證該套cDNA芯片雜交結(jié)果的可靠性，毛偉華等[25]研究了黃瓜在CMV 侵染脅迫下的基因表達(dá)譜變化，并對其中5個(gè)具有代表性的基因通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR（QRT—PCR）進(jìn)行檢測，共獲得67個(gè)差異表達(dá)顯著的基因，其中42個(gè)基因下調(diào)表達(dá)，25個(gè)基因上調(diào)表達(dá)。這些差異表達(dá)的基因涉及了許多重要代謝途徑，許多與光合作用、氮同化相關(guān)的基因受到明顯的抑制，而一些防御相關(guān)基因和信號傳導(dǎo)相關(guān)基因則誘導(dǎo)表達(dá)。同時(shí)，也發(fā)現(xiàn)了一些與CMV 脅迫相關(guān)的功能未知基因或未有任何功能信息的基因。研究發(fā)現(xiàn)，CMV 脅迫引發(fā)了黃瓜代謝發(fā)生一系列復(fù)雜的適應(yīng)性變化，PR1-1a 等基因可能在黃瓜防御CMV侵染過程發(fā)揮著重要作用。

4 RNAi技術(shù)

RNAi（RNA interference）是一種雙鏈RNA （double-stranded RNA，dsRNA）分子在mRNA水平關(guān)閉相應(yīng)序列基因的表達(dá)或使其沉默的過程，也就是序列特異性的轉(zhuǎn)錄后基因沉默（post-transcriptional gene silencing， PTGS）。RNAi技術(shù)具有高度的序列專一性和有效的干擾活力，可以特異地使特定基因沉默，獲得功能喪失或降低的突變體，根據(jù)表型變異可推測該基因的功能，RNAi已發(fā)展成為功能基因組學(xué)研究中基因功能鑒定的一種強(qiáng)有力的工具。

2012年，ANA M.等[26]利用RNAi技術(shù)沉默甜瓜 Cm-eIF4E（核細(xì)胞翻譯起始因子）基因，通過對轉(zhuǎn)基因T2代接種8種甜瓜易侵染的病毒，發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因植株對黃瓜葉脈黃化病毒（CVYV）、甜瓜壞死斑病毒（MNSV）、摩洛哥西瓜花葉病毒（MWMV）、小西葫蘆黃花葉病毒（ZYMV）產(chǎn)生抗性，表明Cm-eIF4E的存在造成甜瓜對這4種病毒的易感染性。Cm-eIF4E基因?qū)τ谔鸸献魑飶V譜高抗等位基因的發(fā)現(xiàn)，將是一個(gè)有效的選擇途徑。程鴻等[27]通過RT-PCR 方法從甜瓜中克隆得到白粉病感病相關(guān)基因CmMLO2 的cDNA 序列，RT-PCR 結(jié)果表明，CmMLO2 主要在甜瓜葉片中表達(dá)，具有組織特異性。在受到白粉病菌脅迫時(shí)CmMLO2表達(dá)顯著上調(diào)，表明CmMLO2 很有可能與白粉病發(fā)病有關(guān)。構(gòu)建RNAi表達(dá)載體，利用葉盤轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化甜瓜，獲得了PCR 陽性植株，對白粉病接種鑒定結(jié)果表明，轉(zhuǎn)化植株對白粉病具有抗性，證明通過ihpRNAi敲除CmMLO2，可以獲得對白粉病具有抗性的甜瓜材料。

5 T-DNA插入突變

T-DNA（transferred DNA）是根癌農(nóng)桿菌（Agrobacterium tumefaciens）內(nèi) Ti 質(zhì)粒（tumor-inducing plasmid）上的一段 DNA， 它能侵染并穩(wěn)定地整合到植物基因組中。由于插入的 T-DNA 序列已知， 插入到植物基因組中的T-DNA 類似于給基因貼了一個(gè)序列標(biāo)簽。通過分離T-DNA 標(biāo)簽位點(diǎn)的側(cè)翼水稻基因組序列， 可以快捷地找到含有標(biāo)簽的基因， 經(jīng)過插入標(biāo)簽基因與突變體表型的共分離檢測， 從而獲得基因的生物學(xué)功能。任海英等[28]采用農(nóng)桿菌侵染子葉外植體的方法產(chǎn)生T-DNA 插入的甜瓜突變體，篩選到一個(gè)蔓枯病抗性明顯增強(qiáng)的突變體，命名為edr2，該突變體是T-DNA 單拷貝插入甜瓜染色體引起的，edr2 的蔓枯病抗性和標(biāo)記基因卡那霉素抗性基因共分離。蔓枯病菌在突變體甜瓜edr2上的侵染過程與在野生型甜瓜上相比，分生孢子萌發(fā)率降低、芽管的伸長和菌絲的生長較遲緩。蔓枯病菌的侵染能引起edr2突變體發(fā)生細(xì)胞程序性死亡，但是不引起野生型甜瓜的細(xì)胞發(fā)生程序性死亡。本研究為選育抗蔓枯病的甜瓜品種提供了新的思路，為挖掘甜瓜-蔓枯病菌互作的基因提供了支持。

6 展 望

西瓜[29]、甜瓜[30]、黃瓜 [31]全基因組測序已完成并對外公布，測序獲得的大量生物信息為開展功能基因組學(xué)研究奠定了基礎(chǔ)，也標(biāo)志著瓜類作物基因組研究逐步進(jìn)入到功能基因組研究時(shí)代。可以預(yù)測，未來將會有更多不同類型的cDNA文庫，包括全長cDNA文庫被構(gòu)建，更多的EST序列將被釋放，從而為基因芯片的開發(fā)提供更多的源序列。另外，TILLING 、T-DNA突變體庫的構(gòu)建工作也將陸續(xù)啟動(dòng)或完成，更多的功能基因?qū)⒈昏b定和分離。功能基因組研究的深入有望鑒定和分離出控制重要農(nóng)藝性狀的全部基因， 揭示基因的時(shí)空表達(dá)模式，弄清在性狀形成中基因與基因的互作，并在此基礎(chǔ)上形成對基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的認(rèn)識。屆時(shí)人們就能夠從基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)調(diào)控兩個(gè)方面對基因進(jìn)行修飾，在作物育種實(shí)踐中實(shí)現(xiàn)分子設(shè)計(jì)育種，從而培育出抗逆性強(qiáng)、品質(zhì)優(yōu)良、有益人體健康的西瓜、甜瓜、黃瓜品種，滿足人們不斷增長的消費(fèi)需求。

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